RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532927.5

FBXO3-211, Transcript of F-box protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO3, Length 945 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3-211ENST00000532927 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.81■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.78■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
FBXO3-211ENST00000532927 CLIP1P30622 1438 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.72■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.72■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.71■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 ATP10AO60312 1499 aa21.71■■□□□ 1.07
FBXO3-211ENST00000532927 AFAP1Q8N556 730 aa21.69■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 KDM5CP41229 1560 aa21.67■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 PREX2Q70Z35 1606 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 MLECQ14165 292 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.65■■□□□ 1.06
FBXO3-211ENST00000532927 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.64■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.64■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.63■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.61■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 ABCC1P33527 1531 aa21.6■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.6■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.59■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.58■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.58■■□□□ 1.05
FBXO3-211ENST00000532927 ABCA6Q8N139 1617 aa21.56■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 HSPA2P54652 639 aa21.55■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 REREQ9P2R6 1566 aa21.55■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.54■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.53■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.52■■□□□ 1.04
FBXO3-211ENST00000532927 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
FBXO3-211ENST00000532927 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.5■■□□□ 1.03
FBXO3-211ENST00000532927 AGLP35573 1532 aa21.5■■□□□ 1.03
FBXO3-211ENST00000532927 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FBXO3-211ENST00000532927 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.47■■□□□ 1.03
FBXO3-211ENST00000532927 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
FBXO3-211ENST00000532927 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 CEP162Q5TB80 1403 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.44■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.44■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 FBXO41Q8TF61 875 aa21.43■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.43■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 C3P01024 1663 aa21.4■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.4■■□□□ 1.02
FBXO3-211ENST00000532927 TIAM1Q13009 1591 aa21.39■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 ATP7AQ04656 1500 aa21.37■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.37■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.35■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 STRCQ7RTU9 1775 aa21.34■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.33■■□□□ 1.01
FBXO3-211ENST00000532927 MBD5Q9P267 1494 aa21.32■■□□□ 1
FBXO3-211ENST00000532927 PLXNC1O60486 1568 aa21.32■■□□□ 1
FBXO3-211ENST00000532927 A2MP01023 1474 aa21.31■■□□□ 1
FBXO3-211ENST00000532927 MROH2AA6NES4 1674 aa21.29■■□□□ 1
FBXO3-211ENST00000532927 NCOA2Q15596 1464 aa21.27■■□□□ 1
FBXO3-211ENST00000532927 ZMYM3Q14202 1370 aa21.27■■□□□ 1
FBXO3-211ENST00000532927 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.26■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 CERKQ8TCT0 537 aa21.26■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.24■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 NPATQ14207 1427 aa21.23■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.23■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.22■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 GGT6Q6P531 493 aa21.22■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.21■□□□□ 0.99
FBXO3-211ENST00000532927 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 PTPRTO14522 1441 aa21.19■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.19■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.18■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 NCOA1Q15788 1441 aa21.18■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.18■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 PTPRKQ15262 1439 aa21.17■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.15■□□□□ 0.98
FBXO3-211ENST00000532927 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.14■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.14■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 MAP3K1Q13233 1512 aa21.13■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.11■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 KIF3BO15066 747 aa21.11■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.08■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
FBXO3-211ENST00000532927 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.07■□□□□ 0.96
FBXO3-211ENST00000532927 TSPY4P0CV99 314 aa21.06■□□□□ 0.96
FBXO3-211ENST00000532927 TSPY10P0CW01 314 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms