RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532225.5

NFRKB-211, Transcript of nuclear factor related to kappaB binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene NFRKB, Length 938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFRKB-211ENST00000532225 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.44■■■■□ 3.42
NFRKB-211ENST00000532225 RICTORQ6R327 1708 aa36.43■■■■□ 3.42
NFRKB-211ENST00000532225 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.42■■■■□ 3.42
NFRKB-211ENST00000532225 PREX2Q70Z35 1606 aa36.41■■■■□ 3.42
NFRKB-211ENST00000532225 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.39■■■■□ 3.42
NFRKB-211ENST00000532225 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.39■■■■□ 3.42
NFRKB-211ENST00000532225 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.37■■■■□ 3.41
NFRKB-211ENST00000532225 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.36■■■■□ 3.41
NFRKB-211ENST00000532225 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
NFRKB-211ENST00000532225 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
NFRKB-211ENST00000532225 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
NFRKB-211ENST00000532225 TIAM1Q13009 1591 aa36.32■■■■□ 3.41
NFRKB-211ENST00000532225 APLP2Q06481 763 aa36.32■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.3■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.3■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.29■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 AFAP1Q8N556 730 aa36.28■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.27■■■■□ 3.4
NFRKB-211ENST00000532225 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.25■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.24■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 MAP3K1Q13233 1512 aa36.23■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 ABCC1P33527 1531 aa36.22■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.21■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.2■■■■□ 3.39
NFRKB-211ENST00000532225 NCOA2Q15596 1464 aa36.18■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.383e-6■■■■□ 23.6
NFRKB-211ENST00000532225 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.17■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.17■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.17■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.16■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
NFRKB-211ENST00000532225 KDM5CP41229 1560 aa36.13■■■■□ 3.37
NFRKB-211ENST00000532225 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.12■■■■□ 3.37
NFRKB-211ENST00000532225 ATP10AO60312 1499 aa36.11■■■■□ 3.37
NFRKB-211ENST00000532225 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.08■■■■□ 3.37
NFRKB-211ENST00000532225 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.08■■■■□ 3.37
NFRKB-211ENST00000532225 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.08■■■■□ 3.37
NFRKB-211ENST00000532225 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
NFRKB-211ENST00000532225 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.05■■■■□ 3.36
NFRKB-211ENST00000532225 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
NFRKB-211ENST00000532225 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.02■■■■□ 3.36
NFRKB-211ENST00000532225 MLECQ14165 292 aa35.99■■■■□ 3.35
NFRKB-211ENST00000532225 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.98■■■■□ 3.35
NFRKB-211ENST00000532225 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.94■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.94■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.93■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.92■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 ABCA6Q8N139 1617 aa35.91■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 MBD5Q9P267 1494 aa35.91■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.91■■■■□ 3.34
NFRKB-211ENST00000532225 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.88■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 MADDQ8WXG6 1647 aa35.87■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 REREQ9P2R6 1566 aa35.86■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 ATP7AQ04656 1500 aa35.86■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 PTPRMP28827 1452 aa35.86■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 MIA2Q96PC5 1412 aa35.85■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 TSPY4P0CV99 314 aa35.83■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 TSPY10P0CW01 314 aa35.83■■■■□ 3.33
NFRKB-211ENST00000532225 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.81■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.78■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 AGLP35573 1532 aa35.78■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.76■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
NFRKB-211ENST00000532225 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.75■■■■□ 3.31
NFRKB-211ENST00000532225 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.74■■■■□ 3.31
NFRKB-211ENST00000532225 A2MP01023 1474 aa35.73■■■■□ 3.31
NFRKB-211ENST00000532225 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.68■■■■□ 3.3
NFRKB-211ENST00000532225 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.66■■■■□ 3.3
NFRKB-211ENST00000532225 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.65■■■■□ 3.3
NFRKB-211ENST00000532225 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
NFRKB-211ENST00000532225 GGT6Q6P531 493 aa35.6■■■■□ 3.29
NFRKB-211ENST00000532225 PLXNC1O60486 1568 aa35.59■■■■□ 3.29
NFRKB-211ENST00000532225 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.55■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.55■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 KIF3BO15066 747 aa35.54■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.52■■■■□ 3.28
NFRKB-211ENST00000532225 ABCC5O15440 1437 aa35.5■■■■□ 3.27
NFRKB-211ENST00000532225 DAPK1P53355 1430 aa35.47■■■■□ 3.27
NFRKB-211ENST00000532225 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.43■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 ZMYM3Q14202 1370 aa35.41■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.41■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.41■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.4■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 C3P01024 1663 aa35.4■■■■□ 3.26
NFRKB-211ENST00000532225 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
NFRKB-211ENST00000532225 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
NFRKB-211ENST00000532225 KIF15Q9NS87 1388 aa35.37■■■■□ 3.25
NFRKB-211ENST00000532225 MROH2AA6NES4 1674 aa35.37■■■■□ 3.25
NFRKB-211ENST00000532225 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.36■■■■□ 3.25
NFRKB-211ENST00000532225 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.36■■■■□ 3.25
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