RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531411.1

PTDSS2-211, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS2, Length 624 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-211ENST00000531411 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 AKNAQ7Z591 1439 aa22.48■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 NEO1Q92859 1461 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 KDM6BO15054 1643 aa22.46■■□□□ 1.19
PTDSS2-211ENST00000531411 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.43■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 RAPGEF3O95398 923 aa22.42■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 ADGRL1O94910 1474 aa22.41■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
PTDSS2-211ENST00000531411 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.38■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 ABCC1P33527 1531 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 RICTORQ6R327 1708 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 AFAP1Q8N556 730 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2-211ENST00000531411 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 MIA2Q96PC5 1412 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 MBD5Q9P267 1494 aa22.29■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2-211ENST00000531411 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2-211ENST00000531411 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2-211ENST00000531411 KDM5CP41229 1560 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-211ENST00000531411 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2-211ENST00000531411 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-211ENST00000531411 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2-211ENST00000531411 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 ABCC5O15440 1437 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTDSS2-211ENST00000531411 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 DAPK1P53355 1430 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 ATP7AQ04656 1500 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 PTPRKQ15262 1439 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 ITGAEP38570 1179 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS2-211ENST00000531411 TSPY4P0CV99 314 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 TSPY10P0CW01 314 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 ATP10AO60312 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.02■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.02■■□□□ 1.12
PTDSS2-211ENST00000531411 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.99■■□□□ 1.11
PTDSS2-211ENST00000531411 A2MP01023 1474 aa21.97■■□□□ 1.11
PTDSS2-211ENST00000531411 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTDSS2-211ENST00000531411 PLXNC1O60486 1568 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS2-211ENST00000531411 REREQ9P2R6 1566 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS2-211ENST00000531411 NCOA1Q15788 1441 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS2-211ENST00000531411 ADGRL2O95490 1459 aa21.95■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 MLECQ14165 292 aa21.94■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 KIF15Q9NS87 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.92■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.91■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 AGLP35573 1532 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS2-211ENST00000531411 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS2-211ENST00000531411 KIF3BO15066 747 aa21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2-211ENST00000531411 ROCK1Q13464 1354 aa21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2-211ENST00000531411 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.85■■□□□ 1.09
PTDSS2-211ENST00000531411 GGT6Q6P531 493 aa21.84■■□□□ 1.09
PTDSS2-211ENST00000531411 MADDQ8WXG6 1647 aa21.83■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 NAIPQ13075 1403 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 ERBINQ96RT1 1412 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS2-211ENST00000531411 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms