RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530449.1

TCIRG1-211, Transcript of T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCIRG1, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1-211ENST00000530449 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.27■■■■□ 3.24
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TCIRG1-211ENST00000530449 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.25■■■■□ 3.23
TCIRG1-211ENST00000530449 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.24■■■■□ 3.23
TCIRG1-211ENST00000530449 PTPRMP28827 1452 aa35.24■■■■□ 3.23
TCIRG1-211ENST00000530449 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.24■■■■□ 3.23
TCIRG1-211ENST00000530449 MADDQ8WXG6 1647 aa35.21■■■■□ 3.23
TCIRG1-211ENST00000530449 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.2■■■■□ 3.23
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TCIRG1-211ENST00000530449 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.02■■■■□ 3.2
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TCIRG1-211ENST00000530449 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.96■■■■□ 3.19
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TCIRG1-211ENST00000530449 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.93■■■■□ 3.18
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TCIRG1-211ENST00000530449 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.9■■■■□ 3.18
TCIRG1-211ENST00000530449 CEP162Q5TB80 1403 aa34.89■■■■□ 3.18
TCIRG1-211ENST00000530449 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.89■■■■□ 3.18
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TCIRG1-211ENST00000530449 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.85■■■■□ 3.17
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TCIRG1-211ENST00000530449 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.84■■■■□ 3.17
TCIRG1-211ENST00000530449 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.83■■■■□ 3.17
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TCIRG1-211ENST00000530449 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
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TCIRG1-211ENST00000530449 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
TCIRG1-211ENST00000530449 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.74■■■■□ 3.15
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TCIRG1-211ENST00000530449 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.71■■■■□ 3.15
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TCIRG1-211ENST00000530449 HSPA2P54652 639 aa34.68■■■■□ 3.14
TCIRG1-211ENST00000530449 TIAM1Q13009 1591 aa34.68■■■■□ 3.14
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TCIRG1-211ENST00000530449 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
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TCIRG1-211ENST00000530449 NCOA2Q15596 1464 aa34.52■■■■□ 3.12
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TCIRG1-211ENST00000530449 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
TCIRG1-211ENST00000530449 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
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TCIRG1-211ENST00000530449 TSPY10P0CW01 314 aa34.16■■■■□ 3.06
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TCIRG1-211ENST00000530449 NCOA1Q15788 1441 aa34.14■■■■□ 3.06
TCIRG1-211ENST00000530449 MIA2Q96PC5 1412 aa34.14■■■■□ 3.06
TCIRG1-211ENST00000530449 PTPRTO14522 1441 aa34.13■■■■□ 3.05
TCIRG1-211ENST00000530449 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.13■■■■□ 3.05
TCIRG1-211ENST00000530449 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
TCIRG1-211ENST00000530449 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.11■■■■□ 3.05
TCIRG1-211ENST00000530449 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.11■■■■□ 3.05
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