RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529525.1

FADS3-209, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 3

Gene FADS3, Length 530 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-209	ENST00000529525	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.36	■■■■■ 4.21
FADS3-209	ENST00000529525	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.35	■■■■■ 4.21
FADS3-209	ENST00000529525	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.34	■■■■■ 4.21
FADS3-209	ENST00000529525	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.33	■■■■■ 4.21
FADS3-209	ENST00000529525	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.33	■■■■■ 4.21
FADS3-209	ENST00000529525	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.31	■■■■■ 4.2
FADS3-209	ENST00000529525	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.28	■■■■■ 4.2
FADS3-209	ENST00000529525	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.27	■■■■■ 4.2
FADS3-209	ENST00000529525	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.22	■■■■■ 4.19
FADS3-209	ENST00000529525	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.21	■■■■■ 4.19
FADS3-209	ENST00000529525	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.17	■■■■■ 4.18
FADS3-209	ENST00000529525	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.17	■■■■■ 4.18
FADS3-209	ENST00000529525	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.16	■■■■■ 4.18
FADS3-209	ENST00000529525	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.13	■■■■■ 4.17
FADS3-209	ENST00000529525	ATP10A	O60312	1499 aa		41.12	■■■■■ 4.17
FADS3-209	ENST00000529525	KDM5C	P41229	1560 aa		41.12	■■■■■ 4.17
FADS3-209	ENST00000529525	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.11	■■■■■ 4.17
FADS3-209	ENST00000529525	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.07	■■■■■ 4.16
FADS3-209	ENST00000529525	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.03	■■■■■ 4.16
FADS3-209	ENST00000529525	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.01	■■■■■ 4.16
FADS3-209	ENST00000529525	ABCC1	P33527	1531 aa		40.98	■■■■■ 4.15
FADS3-209	ENST00000529525	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.98	■■■■■ 4.15
FADS3-209	ENST00000529525	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.96	■■■■■ 4.15
FADS3-209	ENST00000529525	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.95	■■■■■ 4.15
FADS3-209	ENST00000529525	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.94	■■■■■ 4.14
FADS3-209	ENST00000529525	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.94	■■■■■ 4.14
FADS3-209	ENST00000529525	MLEC	Q14165	292 aa		40.93	■■■■■ 4.14
FADS3-209	ENST00000529525	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.92	■■■■■ 4.14
FADS3-209	ENST00000529525	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.91	■■■■■ 4.14
FADS3-209	ENST00000529525	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.9	■■■■■ 4.14
FADS3-209	ENST00000529525	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.13
FADS3-209	ENST00000529525	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
FADS3-209	ENST00000529525	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.84	■■■■■ 4.13
FADS3-209	ENST00000529525	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.84	■■■■■ 4.13
FADS3-209	ENST00000529525	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.78	■■■■■ 4.12
FADS3-209	ENST00000529525	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.78	■■■■■ 4.12
FADS3-209	ENST00000529525	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.78	■■■■■ 4.12
FADS3-209	ENST00000529525	AGL	P35573	1532 aa		40.77	■■■■■ 4.12
FADS3-209	ENST00000529525	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.76	■■■■■ 4.12
FADS3-209	ENST00000529525	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.73	■■■■■ 4.11
FADS3-209	ENST00000529525	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.72	■■■■■ 4.11
FADS3-209	ENST00000529525	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.72	■■■■■ 4.11
FADS3-209	ENST00000529525	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
FADS3-209	ENST00000529525	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.7	■■■■■ 4.11
FADS3-209	ENST00000529525	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.7	■■■■■ 4.11
FADS3-209	ENST00000529525	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
FADS3-209	ENST00000529525	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
FADS3-209	ENST00000529525	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.67	■■■■■ 4.1
FADS3-209	ENST00000529525	HSPA2	P54652	639 aa		40.63	■■■■■ 4.09
FADS3-209	ENST00000529525	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.62	■■■■■ 4.09
FADS3-209	ENST00000529525	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.62	■■■■■ 4.09
FADS3-209	ENST00000529525	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
FADS3-209	ENST00000529525	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
FADS3-209	ENST00000529525	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.58	■■■■■ 4.09
FADS3-209	ENST00000529525	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.54	■■■■■ 4.08
FADS3-209	ENST00000529525	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
FADS3-209	ENST00000529525	C3	P01024	1663 aa		40.52	■■■■■ 4.08
FADS3-209	ENST00000529525	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.51	■■■■■ 4.08
FADS3-209	ENST00000529525	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
FADS3-209	ENST00000529525	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FADS3-209	ENST00000529525	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FADS3-209	ENST00000529525	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.45	■■■■■ 4.07
FADS3-209	ENST00000529525	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.44	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	A2M	P01023	1474 aa		40.42	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.39	■■■■■ 4.06
FADS3-209	ENST00000529525	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.37	■■■■■ 4.05
FADS3-209	ENST00000529525	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.36	■■■■■ 4.05
FADS3-209	ENST00000529525	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.31	■■■■■ 4.04
FADS3-209	ENST00000529525	NPAT	Q14207	1427 aa		40.29	■■■■■ 4.04
FADS3-209	ENST00000529525	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.28	■■■■■ 4.04
FADS3-209	ENST00000529525	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.27	■■■■■ 4.04
FADS3-209	ENST00000529525	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.27	■■■■■ 4.04
FADS3-209	ENST00000529525	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.27	■■■■■ 4.04
FADS3-209	ENST00000529525	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.26	■■■■■ 4.03
FADS3-209	ENST00000529525	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.26	■■■■■ 4.03
FADS3-209	ENST00000529525	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.25	■■■■■ 4.03
FADS3-209	ENST00000529525	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.24	■■■■■ 4.03
FADS3-209	ENST00000529525	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
FADS3-209	ENST00000529525	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
FADS3-209	ENST00000529525	GGT6	Q6P531	493 aa		40.18	■■■■■ 4.02
FADS3-209	ENST00000529525	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.17	■■■■■ 4.02
FADS3-209	ENST00000529525	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.13	■■■■■ 4.01
FADS3-209	ENST00000529525	PTPRT	O14522	1441 aa		40.12	■■■■■ 4.01
FADS3-209	ENST00000529525	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.08	■■■■■ 4.01
FADS3-209	ENST00000529525	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.08	■■■■■ 4.01
FADS3-209	ENST00000529525	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.05	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.05	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.05	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.01	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.01	■■■■■ 4
FADS3-209	ENST00000529525	KIF3B	O15066	747 aa		40	■■■■□ 3.99
FADS3-209	ENST00000529525	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40	■■■■□ 3.99
FADS3-209	ENST00000529525	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		39.98	■■■■□ 3.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms