RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528988.1

HSF1-206, Transcript of heat shock transcription factor 1, human

TSL 3

Gene HSF1, Length 775 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF1-206	ENST00000528988	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.1	■■■■■ 4.17
HSF1-206	ENST00000528988	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.1	■■■■■ 4.17
HSF1-206	ENST00000528988	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.08	■■■■■ 4.17
HSF1-206	ENST00000528988	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.08	■■■■■ 4.17
HSF1-206	ENST00000528988	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.04	■■■■■ 4.16
HSF1-206	ENST00000528988	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.03	■■■■■ 4.16
HSF1-206	ENST00000528988	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.02	■■■■■ 4.16
HSF1-206	ENST00000528988	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.01	■■■■■ 4.16
HSF1-206	ENST00000528988	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41	■■■■■ 4.15
HSF1-206	ENST00000528988	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.97	■■■■■ 4.15
HSF1-206	ENST00000528988	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.95	■■■■■ 4.15
HSF1-206	ENST00000528988	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.95	■■■■■ 4.15
HSF1-206	ENST00000528988	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.91	■■■■■ 4.14
HSF1-206	ENST00000528988	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.9	■■■■■ 4.14
HSF1-206	ENST00000528988	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.9	■■■■■ 4.14
HSF1-206	ENST00000528988	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.88	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	ABCC1	P33527	1531 aa		40.86	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	KDM5C	P41229	1560 aa		40.84	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.83	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40.83	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.82	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
HSF1-206	ENST00000528988	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	ATP10A	O60312	1499 aa		40.79	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	PTPRM	P28827	1452 aa		40.79	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.78	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.78	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.77	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.77	■■■■■ 4.12
HSF1-206	ENST00000528988	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.74	■■■■■ 4.11
HSF1-206	ENST00000528988	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.74	■■■■■ 4.11
HSF1-206	ENST00000528988	MLEC	Q14165	292 aa		40.72	■■■■■ 4.11
HSF1-206	ENST00000528988	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
HSF1-206	ENST00000528988	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
HSF1-206	ENST00000528988	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.68	■■■■■ 4.1
HSF1-206	ENST00000528988	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.68	■■■■■ 4.1
HSF1-206	ENST00000528988	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.68	■■■■■ 4.1
HSF1-206	ENST00000528988	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.67	■■■■■ 4.1
HSF1-206	ENST00000528988	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.66	■■■■■ 4.1
HSF1-206	ENST00000528988	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.65	■■■■■ 4.1	8e-6	■■■■□ 19.5
HSF1-206	ENST00000528988	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.61	■■■■■ 4.09
HSF1-206	ENST00000528988	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
HSF1-206	ENST00000528988	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.58	■■■■■ 4.09
HSF1-206	ENST00000528988	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.57	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.56	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.56	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.55	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.54	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
HSF1-206	ENST00000528988	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.49	■■■■■ 4.07
HSF1-206	ENST00000528988	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HSF1-206	ENST00000528988	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
HSF1-206	ENST00000528988	AGL	P35573	1532 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HSF1-206	ENST00000528988	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HSF1-206	ENST00000528988	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
HSF1-206	ENST00000528988	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HSF1-206	ENST00000528988	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.34	■■■■■ 4.05
HSF1-206	ENST00000528988	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
HSF1-206	ENST00000528988	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.32	■■■■■ 4.04
HSF1-206	ENST00000528988	A2M	P01023	1474 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HSF1-206	ENST00000528988	APLP2	Q06481	763 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HSF1-206	ENST00000528988	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
HSF1-206	ENST00000528988	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.23	■■■■■ 4.03
HSF1-206	ENST00000528988	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.23	■■■■■ 4.03
HSF1-206	ENST00000528988	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.22	■■■■■ 4.03
HSF1-206	ENST00000528988	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.2	■■■■■ 4.03
HSF1-206	ENST00000528988	C3	P01024	1663 aa		40.18	■■■■■ 4.02
HSF1-206	ENST00000528988	HSPA2	P54652	639 aa		40.17	■■■■■ 4.02
HSF1-206	ENST00000528988	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.17	■■■■■ 4.02
HSF1-206	ENST00000528988	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.16	■■■■■ 4.02
HSF1-206	ENST00000528988	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.14	■■■■■ 4.02
HSF1-206	ENST00000528988	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.12	■■■■■ 4.01
HSF1-206	ENST00000528988	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.1	■■■■■ 4.01
HSF1-206	ENST00000528988	GGT6	Q6P531	493 aa		40.09	■■■■■ 4.01
HSF1-206	ENST00000528988	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.08	■■■■■ 4.01
HSF1-206	ENST00000528988	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.06	■■■■■ 4
HSF1-206	ENST00000528988	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.06	■■■■■ 4
HSF1-206	ENST00000528988	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
HSF1-206	ENST00000528988	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
HSF1-206	ENST00000528988	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
HSF1-206	ENST00000528988	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.03	■■■■■ 4
HSF1-206	ENST00000528988	ZMYM3	Q14202	1370 aa		39.98	■■■■□ 3.99
HSF1-206	ENST00000528988	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		39.98	■■■■□ 3.99
HSF1-206	ENST00000528988	KIF3B	O15066	747 aa		39.95	■■■■□ 3.99
HSF1-206	ENST00000528988	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		39.94	■■■■□ 3.98
HSF1-206	ENST00000528988	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		39.94	■■■■□ 3.98
HSF1-206	ENST00000528988	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		39.89	■■■■□ 3.98
HSF1-206	ENST00000528988	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		39.86	■■■■□ 3.97
HSF1-206	ENST00000528988	NPAT	Q14207	1427 aa		39.84	■■■■□ 3.97
HSF1-206	ENST00000528988	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		39.8	■■■■□ 3.96
HSF1-206	ENST00000528988	ABCC5	O15440	1437 aa		39.79	■■■■□ 3.96
HSF1-206	ENST00000528988	PTPRK	Q15262	1439 aa		39.79	■■■■□ 3.96
HSF1-206	ENST00000528988	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	39.79	■■■■□ 3.96
HSF1-206	ENST00000528988	STRC	Q7RTU9	1775 aa		39.77	■■■■□ 3.96
HSF1-206	ENST00000528988	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	39.77	■■■■□ 3.96
HSF1-206	ENST00000528988	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	39.74	■■■■□ 3.95
HSF1-206	ENST00000528988	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		39.74	■■■■□ 3.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms