RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528426.5

CHID1-212, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHID1, Length 991 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-212ENST00000528426 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.4■■■■■ 4.86
CHID1-212ENST00000528426 RICTORQ6R327 1708 aa45.33■■■■■ 4.85
CHID1-212ENST00000528426 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
CHID1-212ENST00000528426 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.31■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 PREX2Q70Z35 1606 aa45.31■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.31■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.31■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.29■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.27■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.26■■■■■ 4.84
CHID1-212ENST00000528426 MAP3K1Q13233 1512 aa45.25■■■■■ 4.83
CHID1-212ENST00000528426 TIAM1Q13009 1591 aa45.24■■■■■ 4.83
CHID1-212ENST00000528426 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
CHID1-212ENST00000528426 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.23■■■■■ 4.83
CHID1-212ENST00000528426 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.19■■■■■ 4.82
CHID1-212ENST00000528426 AFAP1Q8N556 730 aa45.19■■■■■ 4.82
CHID1-212ENST00000528426 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
CHID1-212ENST00000528426 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.14■■■■■ 4.82
CHID1-212ENST00000528426 ABCC1P33527 1531 aa45.12■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.11■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.11■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.11■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 APLP2Q06481 763 aa45.1■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.09■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 NCOA2Q15596 1464 aa45.08■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.08■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.07■■■■■ 4.81
CHID1-212ENST00000528426 KDM5CP41229 1560 aa45.07■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.06■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.03■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.01■■■■■ 4.8
CHID1-212ENST00000528426 ATP10AO60312 1499 aa44.99■■■■■ 4.79
CHID1-212ENST00000528426 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.96■■■■■ 4.79
CHID1-212ENST00000528426 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.96■■■■■ 4.79
CHID1-212ENST00000528426 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
CHID1-212ENST00000528426 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.91■■■■■ 4.78
CHID1-212ENST00000528426 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.9■■■■■ 4.78
CHID1-212ENST00000528426 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.89■■■■■ 4.78
CHID1-212ENST00000528426 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
CHID1-212ENST00000528426 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.83■■■■■ 4.77
CHID1-212ENST00000528426 MBD5Q9P267 1494 aa44.82■■■■■ 4.77
CHID1-212ENST00000528426 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.81■■■■■ 4.76
CHID1-212ENST00000528426 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.8■■■■■ 4.76
CHID1-212ENST00000528426 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.76■■■■■ 4.76
CHID1-212ENST00000528426 REREQ9P2R6 1566 aa44.74■■■■■ 4.75
CHID1-212ENST00000528426 MIA2Q96PC5 1412 aa44.74■■■■■ 4.75
CHID1-212ENST00000528426 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.73■■■■■ 4.75
CHID1-212ENST00000528426 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.73■■■■■ 4.75
CHID1-212ENST00000528426 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.72■■■■■ 4.75
CHID1-212ENST00000528426 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.71■■■■■ 4.75
CHID1-212ENST00000528426 ABCA6Q8N139 1617 aa44.69■■■■■ 4.74
CHID1-212ENST00000528426 MLECQ14165 292 aa44.67■■■■■ 4.74
CHID1-212ENST00000528426 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.66■■■■■ 4.74
CHID1-212ENST00000528426 PTPRMP28827 1452 aa44.65■■■■■ 4.74
CHID1-212ENST00000528426 AGLP35573 1532 aa44.64■■■■■ 4.74
CHID1-212ENST00000528426 ATP7AQ04656 1500 aa44.64■■■■■ 4.74
CHID1-212ENST00000528426 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.62■■■■■ 4.73
CHID1-212ENST00000528426 MADDQ8WXG6 1647 aa44.6■■■■■ 4.73
CHID1-212ENST00000528426 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
CHID1-212ENST00000528426 TSPY4P0CV99 314 aa44.58■■■■■ 4.73
CHID1-212ENST00000528426 TSPY10P0CW01 314 aa44.58■■■■■ 4.73
CHID1-212ENST00000528426 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.56■■■■■ 4.72
CHID1-212ENST00000528426 A2MP01023 1474 aa44.5■■■■■ 4.71
CHID1-212ENST00000528426 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.44■■■■■ 4.7
CHID1-212ENST00000528426 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
CHID1-212ENST00000528426 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
CHID1-212ENST00000528426 PLXNC1O60486 1568 aa44.4■■■■■ 4.7
CHID1-212ENST00000528426 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.37■■■■■ 4.69
CHID1-212ENST00000528426 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.37■■■■■ 4.69
CHID1-212ENST00000528426 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
CHID1-212ENST00000528426 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
CHID1-212ENST00000528426 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.35■■■■■ 4.69
CHID1-212ENST00000528426 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.33■■■■■ 4.69
CHID1-212ENST00000528426 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.31■■■■■ 4.68
CHID1-212ENST00000528426 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.28■■■■■ 4.68
CHID1-212ENST00000528426 ABCC5O15440 1437 aa44.27■■■■■ 4.68
CHID1-212ENST00000528426 GGT6Q6P531 493 aa44.26■■■■■ 4.68
CHID1-212ENST00000528426 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.24■■■■■ 4.67
CHID1-212ENST00000528426 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
CHID1-212ENST00000528426 KIF3BO15066 747 aa44.21■■■■■ 4.67
CHID1-212ENST00000528426 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.2■■■■■ 4.67
CHID1-212ENST00000528426 DAPK1P53355 1430 aa44.19■■■■■ 4.66
CHID1-212ENST00000528426 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
CHID1-212ENST00000528426 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
CHID1-212ENST00000528426 ZMYM3Q14202 1370 aa44.11■■■■■ 4.65
CHID1-212ENST00000528426 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
CHID1-212ENST00000528426 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.06■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 KIF15Q9NS87 1388 aa44.05■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.04■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.04■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.04■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.03■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 MROH2AA6NES4 1674 aa44.02■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 C3P01024 1663 aa44.01■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.01■■■■■ 4.64
CHID1-212ENST00000528426 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
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