RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.72■■■■□ 3.79
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP162Q5TB80 1403 aa38.68■■■■□ 3.78
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.68■■■■□ 3.78
PACSIN3-204ENST00000528201 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.63■■■■□ 3.78
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.63■■■■□ 3.77
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.62■■■■□ 3.77
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.58■■■■□ 3.77
PACSIN3-204ENST00000528201 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.57■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.55■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 AFAP1Q8N556 730 aa38.55■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.55■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 PREX2Q70Z35 1606 aa38.54■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRMP28827 1452 aa38.54■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.52■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.51■■■■□ 3.76
PACSIN3-204ENST00000528201 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.49■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 MADDQ8WXG6 1647 aa38.49■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM5CP41229 1560 aa38.48■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.46■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC1P33527 1531 aa38.46■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP10AO60312 1499 aa38.45■■■■□ 3.75
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.44■■■■□ 3.74
PACSIN3-204ENST00000528201 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.42■■■■□ 3.74
PACSIN3-204ENST00000528201 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.4■■■■□ 3.74
PACSIN3-204ENST00000528201 MLECQ14165 292 aa38.37■■■■□ 3.73
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
PACSIN3-204ENST00000528201 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.35■■■■□ 3.73
PACSIN3-204ENST00000528201 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.33■■■■□ 3.73
PACSIN3-204ENST00000528201 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.33■■■■□ 3.73
PACSIN3-204ENST00000528201 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.31■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.31■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.3■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.29■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.27■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCA6Q8N139 1617 aa38.27■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.72
PACSIN3-204ENST00000528201 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.23■■■■□ 3.71
PACSIN3-204ENST00000528201 TIAM1Q13009 1591 aa38.23■■■■□ 3.71
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.21■■■■□ 3.71
PACSIN3-204ENST00000528201 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.2■■■■□ 3.71
PACSIN3-204ENST00000528201 REREQ9P2R6 1566 aa38.19■■■■□ 3.7
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
PACSIN3-204ENST00000528201 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.17■■■■□ 3.7
PACSIN3-204ENST00000528201 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.15■■■■□ 3.7
PACSIN3-204ENST00000528201 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.14■■■■□ 3.7
PACSIN3-204ENST00000528201 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.7
PACSIN3-204ENST00000528201 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.13■■■■□ 3.69
PACSIN3-204ENST00000528201 NCOA2Q15596 1464 aa38.12■■■■□ 3.69
PACSIN3-204ENST00000528201 AGLP35573 1532 aa38.1■■■■□ 3.69
PACSIN3-204ENST00000528201 MBD5Q9P267 1494 aa38.06■■■■□ 3.68
PACSIN3-204ENST00000528201 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.03■■■■□ 3.68
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP7AQ04656 1500 aa38.02■■■■□ 3.68
PACSIN3-204ENST00000528201 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
PACSIN3-204ENST00000528201 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
PACSIN3-204ENST00000528201 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
PACSIN3-204ENST00000528201 HSPA2P54652 639 aa37.97■■■■□ 3.67
PACSIN3-204ENST00000528201 MAP3K1Q13233 1512 aa37.93■■■■□ 3.66
PACSIN3-204ENST00000528201 A2MP01023 1474 aa37.91■■■■□ 3.66
PACSIN3-204ENST00000528201 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.91■■■■□ 3.66
PACSIN3-204ENST00000528201 PLXNC1O60486 1568 aa37.9■■■■□ 3.66
PACSIN3-204ENST00000528201 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.84■■■■□ 3.65
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.84■■■■□ 3.65
PACSIN3-204ENST00000528201 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
PACSIN3-204ENST00000528201 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.79■■■■□ 3.64
PACSIN3-204ENST00000528201 C3P01024 1663 aa37.78■■■■□ 3.64
PACSIN3-204ENST00000528201 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
PACSIN3-204ENST00000528201 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.74■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.73■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.72■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.72■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 GGT6Q6P531 493 aa37.72■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.72■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.7■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ZMYM3Q14202 1370 aa37.7■■■■□ 3.63
PACSIN3-204ENST00000528201 MIA2Q96PC5 1412 aa37.67■■■■□ 3.62
PACSIN3-204ENST00000528201 APLP2Q06481 763 aa37.64■■■■□ 3.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MROH2AA6NES4 1674 aa37.63■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPY4P0CV99 314 aa37.62■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPY10P0CW01 314 aa37.62■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 NPATQ14207 1427 aa37.6■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF3BO15066 747 aa37.59■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.58■■■■□ 3.61
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRKQ15262 1439 aa37.54■■■■□ 3.6
PACSIN3-204ENST00000528201 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.53■■■■□ 3.6
PACSIN3-204ENST00000528201 STRCQ7RTU9 1775 aa37.47■■■■□ 3.59
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC5O15440 1437 aa37.45■■■■□ 3.59
PACSIN3-204ENST00000528201 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.45■■■■□ 3.59
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.43■■■■□ 3.58
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.41■■■■□ 3.58
PACSIN3-204ENST00000528201 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PACSIN3-204ENST00000528201 NCOA1Q15788 1441 aa37.39■■■■□ 3.58
PACSIN3-204ENST00000528201 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.38■■■■□ 3.58
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