RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527527.1

PITPNM1-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, humanhuman

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 459 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1-210ENST00000527527 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.32■■■■□ 3.56
PITPNM1-210ENST00000527527 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.31■■■■□ 3.56
PITPNM1-210ENST00000527527 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.3■■■■□ 3.56
PITPNM1-210ENST00000527527 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.3■■■■□ 3.56
PITPNM1-210ENST00000527527 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.29■■■■□ 3.56
PITPNM1-210ENST00000527527 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.26■■■■□ 3.56
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.26■■■■□ 3.55
PITPNM1-210ENST00000527527 PTPRMP28827 1452 aa37.25■■■■□ 3.55
PITPNM1-210ENST00000527527 MADDQ8WXG6 1647 aa37.24■■■■□ 3.55
PITPNM1-210ENST00000527527 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.22■■■■□ 3.55
PITPNM1-210ENST00000527527 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.22■■■■□ 3.55
PITPNM1-210ENST00000527527 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.18■■■■□ 3.54
PITPNM1-210ENST00000527527 PREX2Q70Z35 1606 aa37.14■■■■□ 3.54
PITPNM1-210ENST00000527527 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
PITPNM1-210ENST00000527527 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.1■■■■□ 3.53
PITPNM1-210ENST00000527527 AFAP1Q8N556 730 aa37.09■■■■□ 3.53
PITPNM1-210ENST00000527527 KDM5CP41229 1560 aa37.07■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 ATP10AO60312 1499 aa37.06■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.05■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 MLECQ14165 292 aa37.04■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC1P33527 1531 aa37.03■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.03■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.02■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 CEP162Q5TB80 1403 aa37.02■■■■□ 3.52
PITPNM1-210ENST00000527527 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37■■■■□ 3.51
PITPNM1-210ENST00000527527 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.97■■■■□ 3.51
PITPNM1-210ENST00000527527 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.96■■■■□ 3.51
PITPNM1-210ENST00000527527 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.95■■■■□ 3.51
PITPNM1-210ENST00000527527 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.94■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.93■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.91■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCA6Q8N139 1617 aa36.91■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.9■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.9■■■■□ 3.5
PITPNM1-210ENST00000527527 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.88■■■■□ 3.49
PITPNM1-210ENST00000527527 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.84■■■■□ 3.49
PITPNM1-210ENST00000527527 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.82■■■■□ 3.49
PITPNM1-210ENST00000527527 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.82■■■■□ 3.48
PITPNM1-210ENST00000527527 REREQ9P2R6 1566 aa36.82■■■■□ 3.48
PITPNM1-210ENST00000527527 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.81■■■■□ 3.48
PITPNM1-210ENST00000527527 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.79■■■■□ 3.48
PITPNM1-210ENST00000527527 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
PITPNM1-210ENST00000527527 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.77■■■■□ 3.48
PITPNM1-210ENST00000527527 TIAM1Q13009 1591 aa36.74■■■■□ 3.47
PITPNM1-210ENST00000527527 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
PITPNM1-210ENST00000527527 AGLP35573 1532 aa36.71■■■■□ 3.47
PITPNM1-210ENST00000527527 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
PITPNM1-210ENST00000527527 HSPA2P54652 639 aa36.71■■■■□ 3.47
PITPNM1-210ENST00000527527 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.7■■■■□ 3.47
PITPNM1-210ENST00000527527 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.69■■■■□ 3.46
PITPNM1-210ENST00000527527 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
PITPNM1-210ENST00000527527 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
PITPNM1-210ENST00000527527 ATP7AQ04656 1500 aa36.63■■■■□ 3.45
PITPNM1-210ENST00000527527 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
PITPNM1-210ENST00000527527 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.59■■■■□ 3.45
PITPNM1-210ENST00000527527 NCOA2Q15596 1464 aa36.58■■■■□ 3.45
PITPNM1-210ENST00000527527 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
PITPNM1-210ENST00000527527 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.55■■■■□ 3.44
PITPNM1-210ENST00000527527 MBD5Q9P267 1494 aa36.54■■■■□ 3.44
PITPNM1-210ENST00000527527 C3P01024 1663 aa36.54■■■■□ 3.44
PITPNM1-210ENST00000527527 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
PITPNM1-210ENST00000527527 PLXNC1O60486 1568 aa36.5■■■■□ 3.43
PITPNM1-210ENST00000527527 A2MP01023 1474 aa36.5■■■■□ 3.43
PITPNM1-210ENST00000527527 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.45■■■■□ 3.43
PITPNM1-210ENST00000527527 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.44■■■■□ 3.42
PITPNM1-210ENST00000527527 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.43■■■■□ 3.42
PITPNM1-210ENST00000527527 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.43■■■■□ 3.42
PITPNM1-210ENST00000527527 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.4■■■■□ 3.42
PITPNM1-210ENST00000527527 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PITPNM1-210ENST00000527527 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.37■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.37■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 MROH2AA6NES4 1674 aa36.35■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 GGT6Q6P531 493 aa36.34■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 MAP3K1Q13233 1512 aa36.34■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PITPNM1-210ENST00000527527 ZMYM3Q14202 1370 aa36.32■■■■□ 3.4
PITPNM1-210ENST00000527527 STRCQ7RTU9 1775 aa36.28■■■■□ 3.4
PITPNM1-210ENST00000527527 FBXO41Q8TF61 875 aa36.27■■■■□ 3.4
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.27■■■■□ 3.4
PITPNM1-210ENST00000527527 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
PITPNM1-210ENST00000527527 NPATQ14207 1427 aa36.25■■■■□ 3.39
PITPNM1-210ENST00000527527 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.24■■■■□ 3.39
PITPNM1-210ENST00000527527 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.18■■■■□ 3.38
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF3BO15066 747 aa36.17■■■■□ 3.38
PITPNM1-210ENST00000527527 PTPRKQ15262 1439 aa36.17■■■■□ 3.38
PITPNM1-210ENST00000527527 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.16■■■■□ 3.38
PITPNM1-210ENST00000527527 TSPY4P0CV99 314 aa36.14■■■■□ 3.38
PITPNM1-210ENST00000527527 TSPY10P0CW01 314 aa36.14■■■■□ 3.38
PITPNM1-210ENST00000527527 MIA2Q96PC5 1412 aa36.13■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.11■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.11■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 CERKQ8TCT0 537 aa36.09■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.09■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 NCOA1Q15788 1441 aa36.08■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 APLP2Q06481 763 aa36.08■■■■□ 3.37
PITPNM1-210ENST00000527527 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.07■■■■□ 3.36
PITPNM1-210ENST00000527527 PTPRTO14522 1441 aa36.05■■■■□ 3.36
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