RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527375.5

BRMS1-205, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 3

Gene BRMS1, Length 913 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-205ENST00000527375 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.05■■□□□ 1.44
BRMS1-205ENST00000527375 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.02■■□□□ 1.44
BRMS1-205ENST00000527375 AKNAQ7Z591 1439 aa24.01■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.01■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 RICTORQ6R327 1708 aa23.99■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 NCOA2Q15596 1464 aa23.97■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 ADGRL1O94910 1474 aa23.96■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
BRMS1-205ENST00000527375 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.91■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.9■■□□□ 1.42
BRMS1-205ENST00000527375 ABCC1P33527 1531 aa23.89■■□□□ 1.41
BRMS1-205ENST00000527375 RAPGEF3O95398 923 aa23.88■■□□□ 1.41
BRMS1-205ENST00000527375 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.84■■□□□ 1.41
BRMS1-205ENST00000527375 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.84■■□□□ 1.41
BRMS1-205ENST00000527375 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.83■■□□□ 1.41
BRMS1-205ENST00000527375 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.82■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.82■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.8■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.78■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 KDM5CP41229 1560 aa23.78■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.77■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.77■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.77■■□□□ 1.4
BRMS1-205ENST00000527375 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.76■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.76■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.75■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.75■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.74■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 MIA2Q96PC5 1412 aa23.74■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.74■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 AFAP1Q8N556 730 aa23.73■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.71■■□□□ 1.39
BRMS1-205ENST00000527375 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.69■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.67■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.67■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 ABCA6Q8N139 1617 aa23.66■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.66■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 ATP7AQ04656 1500 aa23.65■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.65■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.65■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.65■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 MBD5Q9P267 1494 aa23.64■■□□□ 1.38
BRMS1-205ENST00000527375 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.64■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.64■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 ATP10AO60312 1499 aa23.62■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.59■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 TSPY4P0CV99 314 aa23.58■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 TSPY10P0CW01 314 aa23.58■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.58■■□□□ 1.37
BRMS1-205ENST00000527375 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
BRMS1-205ENST00000527375 REREQ9P2R6 1566 aa23.56■■□□□ 1.36
BRMS1-205ENST00000527375 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.55■■□□□ 1.36
BRMS1-205ENST00000527375 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.55■■□□□ 1.36
BRMS1-205ENST00000527375 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.52■■□□□ 1.36
BRMS1-205ENST00000527375 DAPK1P53355 1430 aa23.5■■□□□ 1.35
BRMS1-205ENST00000527375 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.49■■□□□ 1.35
BRMS1-205ENST00000527375 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.49■■□□□ 1.35
BRMS1-205ENST00000527375 PLXNC1O60486 1568 aa23.48■■□□□ 1.35
BRMS1-205ENST00000527375 A2MP01023 1474 aa23.48■■□□□ 1.35
BRMS1-205ENST00000527375 ABCC5O15440 1437 aa23.46■■□□□ 1.35
BRMS1-205ENST00000527375 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 AGLP35573 1532 aa23.45■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 MADDQ8WXG6 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.43■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 MLECQ14165 292 aa23.43■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
BRMS1-205ENST00000527375 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.39■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.38■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.38■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 ITGAEP38570 1179 aa23.36■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 KIF15Q9NS87 1388 aa23.34■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 ADGRL2O95490 1459 aa23.33■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.33■■□□□ 1.33
BRMS1-205ENST00000527375 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
BRMS1-205ENST00000527375 KIF3BO15066 747 aa23.31■■□□□ 1.32
BRMS1-205ENST00000527375 MROH2AA6NES4 1674 aa23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-205ENST00000527375 GGT6Q6P531 493 aa23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-205ENST00000527375 NCOA1Q15788 1441 aa23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-205ENST00000527375 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
BRMS1-205ENST00000527375 PTPRMP28827 1452 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms