RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-218	ENST00000525459	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPRK-218	ENST00000525459	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-218	ENST00000525459	FANCA	O15360	1455 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRK-218	ENST00000525459	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PTPRK-218	ENST00000525459	KDM6B	O15054	1643 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PTPRK-218	ENST00000525459	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPRK-218	ENST00000525459	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPRK-218	ENST00000525459	AKNA	Q7Z591	1439 aa		29	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	ABCC1	P33527	1531 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PTPRK-218	ENST00000525459	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRK-218	ENST00000525459	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRK-218	ENST00000525459	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PTPRK-218	ENST00000525459	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRK-218	ENST00000525459	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRK-218	ENST00000525459	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRK-218	ENST00000525459	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	KDM5C	P41229	1560 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRK-218	ENST00000525459	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-218	ENST00000525459	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PTPRK-218	ENST00000525459	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.76	■■■□□ 2.2
PTPRK-218	ENST00000525459	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.72	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PTPRK-218	ENST00000525459	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.68	■■■□□ 2.18	2e-6	■■■□□ 16.2
PTPRK-218	ENST00000525459	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTPRK-218	ENST00000525459	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	DAPK1	P53355	1430 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	ABCC5	O15440	1437 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PTPRK-218	ENST00000525459	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPRK-218	ENST00000525459	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPRK-218	ENST00000525459	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-218	ENST00000525459	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRK-218	ENST00000525459	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PTPRK-218	ENST00000525459	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PTPRK-218	ENST00000525459	ATP10A	O60312	1499 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PTPRK-218	ENST00000525459	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRK-218	ENST00000525459	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	A2M	P01023	1474 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	AGL	P35573	1532 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PTPRK-218	ENST00000525459	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.39	■■■□□ 2.13
PTPRK-218	ENST00000525459	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PTPRK-218	ENST00000525459	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PTPRK-218	ENST00000525459	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PTPRK-218	ENST00000525459	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PTPRK-218	ENST00000525459	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PTPRK-218	ENST00000525459	ITGAE	P38570	1179 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PTPRK-218	ENST00000525459	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PTPRK-218	ENST00000525459	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PTPRK-218	ENST00000525459	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPRK-218	ENST00000525459	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	NAIP	Q13075	1403 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1

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