RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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PTPRK-217ENST00000524534 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.84■□□□□ 0.13
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PTPRK-217ENST00000524534 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
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PTPRK-217ENST00000524534 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.54■□□□□ 0.08
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PTPRK-217ENST00000524534 KIF15Q9NS87 1388 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-217ENST00000524534 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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PTPRK-217ENST00000524534 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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PTPRK-217ENST00000524534 NUP155O75694 1391 aa15.46■□□□□ 0.07
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PTPRK-217ENST00000524534 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 CEP170Q5SW79 1584 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 PTPRGP23470 1445 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-217ENST00000524534 NBR1Q14596 966 aa15.39■□□□□ 0.05
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