RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523456.1

PDGFRB-211, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 2

Gene PDGFRB, Length 1,023 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-211ENST00000523456 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.23■□□□□ 0.51
PDGFRB-211ENST00000523456 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.23■□□□□ 0.51
PDGFRB-211ENST00000523456 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.22■□□□□ 0.51
PDGFRB-211ENST00000523456 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.21■□□□□ 0.51
PDGFRB-211ENST00000523456 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 MADDQ8WXG6 1647 aa18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.18■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.18■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 ILDR2Q71H61 639 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 KDM5CP41229 1560 aa18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-211ENST00000523456 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 ATP10AO60312 1499 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 PREX2Q70Z35 1606 aa18.12■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.11■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 REREQ9P2R6 1566 aa18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.09■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 SOCS7O14512 581 aa18.09■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.08■□□□□ 0.49
PDGFRB-211ENST00000523456 ABCC1P33527 1531 aa18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.04■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 AFAP1Q8N556 730 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 AGLP35573 1532 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-211ENST00000523456 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PDGFRB-211ENST00000523456 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.99■□□□□ 0.47
PDGFRB-211ENST00000523456 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.98■□□□□ 0.47
PDGFRB-211ENST00000523456 ABCA6Q8N139 1617 aa17.98■□□□□ 0.47
PDGFRB-211ENST00000523456 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.98■□□□□ 0.47
PDGFRB-211ENST00000523456 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.98■□□□□ 0.47
PDGFRB-211ENST00000523456 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.96■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.95■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 MLECQ14165 292 aa17.95■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 CERKQ8TCT0 537 aa17.95■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.93■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.93■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 CEP162Q5TB80 1403 aa17.92■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 HSPA2P54652 639 aa17.92■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.92■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.92■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.91■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.91■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 CNTLNQ9NXG0 1405 aa17.9■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
PDGFRB-211ENST00000523456 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 ATP7AQ04656 1500 aa17.87■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 TIAM1Q13009 1591 aa17.87■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 PLXNC1O60486 1568 aa17.86■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.85■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 MROH2AA6NES4 1674 aa17.84■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 C3P01024 1663 aa17.84■□□□□ 0.45
PDGFRB-211ENST00000523456 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 MBD5Q9P267 1494 aa17.82■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.82■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.82■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 A2MP01023 1474 aa17.82■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 NPATQ14207 1427 aa17.81■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.81■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.8■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.79■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.79■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.78■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.78■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 NCOA2Q15596 1464 aa17.77■□□□□ 0.44
PDGFRB-211ENST00000523456 MAP3K1Q13233 1512 aa17.77■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 STRCQ7RTU9 1775 aa17.75■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 ZMYM3Q14202 1370 aa17.75■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.74■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.74■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 PTPRTO14522 1441 aa17.73■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.72■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.72■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.72■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PDGFRB-211ENST00000523456 NCOA1Q15788 1441 aa17.7■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 PTPRKQ15262 1439 aa17.68■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 MIA2Q96PC5 1412 aa17.66■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.66■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 PLA2R1Q13018 1463 aa17.65■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 GGT6Q6P531 493 aa17.65■□□□□ 0.42
PDGFRB-211ENST00000523456 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.64■□□□□ 0.41
PDGFRB-211ENST00000523456 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17.64■□□□□ 0.41
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