RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523446.1

LINC01848-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1848, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01848, Length 518 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01848-201ENST00000523446 NEO1Q92859 1461 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 NCOA2Q15596 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.85■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 RICTORQ6R327 1708 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LINC01848-201ENST00000523446 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 AKNAQ7Z591 1439 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.81■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 ADGRL1O94910 1474 aa22.8■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.78■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 ABCC1P33527 1531 aa22.78■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.77■■□□□ 1.24
LINC01848-201ENST00000523446 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LINC01848-201ENST00000523446 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.74■■□□□ 1.23
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LINC01848-201ENST00000523446 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LINC01848-201ENST00000523446 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.73■■□□□ 1.23
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LINC01848-201ENST00000523446 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.71■■□□□ 1.23
LINC01848-201ENST00000523446 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.7■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.69■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 RAPGEF3O95398 923 aa22.69■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.68■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.67■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.67■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.66■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.66■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 KDM5CP41229 1560 aa22.65■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.65■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
LINC01848-201ENST00000523446 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.63■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.63■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 MIA2Q96PC5 1412 aa22.61■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.61■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.6■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.59■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.59■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.59■■□□□ 1.21
LINC01848-201ENST00000523446 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
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LINC01848-201ENST00000523446 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.57■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 AFAP1Q8N556 730 aa22.56■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 MBD5Q9P267 1494 aa22.55■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.55■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.54■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 ATP7AQ04656 1500 aa22.54■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.54■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.54■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.53■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.53■■□□□ 1.2
LINC01848-201ENST00000523446 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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LINC01848-201ENST00000523446 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.5■■□□□ 1.19
LINC01848-201ENST00000523446 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LINC01848-201ENST00000523446 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.46■■□□□ 1.19
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LINC01848-201ENST00000523446 ATP10AO60312 1499 aa22.43■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.43■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 DAPK1P53355 1430 aa22.42■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 REREQ9P2R6 1566 aa22.41■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.4■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 PLXNC1O60486 1568 aa22.4■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.4■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 ABCC5O15440 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
LINC01848-201ENST00000523446 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.39■■□□□ 1.17
LINC01848-201ENST00000523446 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.38■■□□□ 1.17
LINC01848-201ENST00000523446 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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LINC01848-201ENST00000523446 TSPY10P0CW01 314 aa22.36■■□□□ 1.17
LINC01848-201ENST00000523446 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.35■■□□□ 1.17
LINC01848-201ENST00000523446 A2MP01023 1474 aa22.34■■□□□ 1.17
LINC01848-201ENST00000523446 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.32■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 MADDQ8WXG6 1647 aa22.31■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 AGLP35573 1532 aa22.3■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 ITGAEP38570 1179 aa22.29■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.29■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LINC01848-201ENST00000523446 PTPRKQ15262 1439 aa22.26■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 MLECQ14165 292 aa22.26■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 ADGRL2O95490 1459 aa22.26■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.26■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 KIF15Q9NS87 1388 aa22.25■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.24■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.22■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.22■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 NCOA1Q15788 1441 aa22.21■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
LINC01848-201ENST00000523446 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.2■■□□□ 1.14
LINC01848-201ENST00000523446 ERBINQ96RT1 1412 aa22.17■■□□□ 1.14
LINC01848-201ENST00000523446 CEP152O94986 1710 aa22.17■■□□□ 1.14
LINC01848-201ENST00000523446 KIF3BO15066 747 aa22.15■■□□□ 1.14
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