RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520057.1

IGHV3-62-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-62 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-62, Length 340 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
IGHV3-62-201ENST00000520057 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.96■■□□□ 1.75
IGHV3-62-201ENST00000520057 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.96■■□□□ 1.75
IGHV3-62-201ENST00000520057 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
IGHV3-62-201ENST00000520057 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.93■■□□□ 1.74
IGHV3-62-201ENST00000520057 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
IGHV3-62-201ENST00000520057 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.88■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.87■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 TIAM1Q13009 1591 aa25.86■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 PREX2Q70Z35 1606 aa25.85■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 AFAP1Q8N556 730 aa25.85■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.85■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.83■■□□□ 1.73
IGHV3-62-201ENST00000520057 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.81■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.81■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 RICTORQ6R327 1708 aa25.8■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.8■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 NCOA2Q15596 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 MAP3K1Q13233 1512 aa25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-62-201ENST00000520057 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.76■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 ABCC1P33527 1531 aa25.75■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.75■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.74■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.74■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.71■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.71■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
IGHV3-62-201ENST00000520057 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.7■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.69■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.69■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 ATP10AO60312 1499 aa25.69■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 MLECQ14165 292 aa25.68■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 KDM5CP41229 1560 aa25.66■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.66■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.66■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.65■■□□□ 1.7
IGHV3-62-201ENST00000520057 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.62■■□□□ 1.69
IGHV3-62-201ENST00000520057 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.58■■□□□ 1.69
IGHV3-62-201ENST00000520057 TSPY4P0CV99 314 aa25.58■■□□□ 1.69
IGHV3-62-201ENST00000520057 TSPY10P0CW01 314 aa25.58■■□□□ 1.69
IGHV3-62-201ENST00000520057 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.58■■□□□ 1.69
IGHV3-62-201ENST00000520057 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 MIA2Q96PC5 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 MBD5Q9P267 1494 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-62-201ENST00000520057 ATP7AQ04656 1500 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 ABCA6Q8N139 1617 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 PTPRMP28827 1452 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.47■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 MADDQ8WXG6 1647 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-62-201ENST00000520057 REREQ9P2R6 1566 aa25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 A2MP01023 1474 aa25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.42■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 AGLP35573 1532 aa25.42■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.41■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.41■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 GGT6Q6P531 493 aa25.4■■□□□ 1.66
IGHV3-62-201ENST00000520057 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
IGHV3-62-201ENST00000520057 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
IGHV3-62-201ENST00000520057 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.36■■□□□ 1.65
IGHV3-62-201ENST00000520057 KIF3BO15066 747 aa25.34■■□□□ 1.65
IGHV3-62-201ENST00000520057 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.33■■□□□ 1.65
IGHV3-62-201ENST00000520057 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.32■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.3■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.29■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.29■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 ABCC5O15440 1437 aa25.29■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 PLXNC1O60486 1568 aa25.28■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 DAPK1P53355 1430 aa25.28■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.27■■□□□ 1.64
IGHV3-62-201ENST00000520057 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.26■■□□□ 1.63
IGHV3-62-201ENST00000520057 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.24■■□□□ 1.63
IGHV3-62-201ENST00000520057 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-62-201ENST00000520057 KIF15Q9NS87 1388 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-62-201ENST00000520057 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZMYM3Q14202 1370 aa25.2■■□□□ 1.63
IGHV3-62-201ENST00000520057 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-62-201ENST00000520057 ITGAEP38570 1179 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-62-201ENST00000520057 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-62-201ENST00000520057 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-62-201ENST00000520057 HSPA2P54652 639 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-62-201ENST00000520057 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
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