RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519842.1

HOXA7-202, Transcript of homeobox A7, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA7, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7-202ENST00000519842 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXA7-202ENST00000519842 PREX2Q70Z35 1606 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXA7-202ENST00000519842 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXA7-202ENST00000519842 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXA7-202ENST00000519842 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
HOXA7-202ENST00000519842 PTPRMP28827 1452 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXA7-202ENST00000519842 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXA7-202ENST00000519842 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXA7-202ENST00000519842 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXA7-202ENST00000519842 KDM5CP41229 1560 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXA7-202ENST00000519842 ABCC1P33527 1531 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXA7-202ENST00000519842 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXA7-202ENST00000519842 CEP162Q5TB80 1403 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXA7-202ENST00000519842 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXA7-202ENST00000519842 ABCA6Q8N139 1617 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 ATP10AO60312 1499 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 AFAP1Q8N556 730 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXA7-202ENST00000519842 MLECQ14165 292 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXA7-202ENST00000519842 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXA7-202ENST00000519842 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
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HOXA7-202ENST00000519842 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXA7-202ENST00000519842 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 TIAM1Q13009 1591 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 REREQ9P2R6 1566 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXA7-202ENST00000519842 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXA7-202ENST00000519842 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXA7-202ENST00000519842 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
HOXA7-202ENST00000519842 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
HOXA7-202ENST00000519842 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
HOXA7-202ENST00000519842 AGLP35573 1532 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXA7-202ENST00000519842 ATP7AQ04656 1500 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXA7-202ENST00000519842 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
HOXA7-202ENST00000519842 C3P01024 1663 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 HSPA2P54652 639 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXA7-202ENST00000519842 NCOA2Q15596 1464 aa29.78■■■□□ 2.36
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HOXA7-202ENST00000519842 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
HOXA7-202ENST00000519842 MBD5Q9P267 1494 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXA7-202ENST00000519842 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXA7-202ENST00000519842 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXA7-202ENST00000519842 A2MP01023 1474 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXA7-202ENST00000519842 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXA7-202ENST00000519842 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXA7-202ENST00000519842 MROH2AA6NES4 1674 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXA7-202ENST00000519842 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXA7-202ENST00000519842 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXA7-202ENST00000519842 STRCQ7RTU9 1775 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXA7-202ENST00000519842 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXA7-202ENST00000519842 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXA7-202ENST00000519842 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
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HOXA7-202ENST00000519842 MAP3K1Q13233 1512 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXA7-202ENST00000519842 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXA7-202ENST00000519842 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXA7-202ENST00000519842 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXA7-202ENST00000519842 GGT6Q6P531 493 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXA7-202ENST00000519842 ZMYM3Q14202 1370 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXA7-202ENST00000519842 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.45■■■□□ 2.3
HOXA7-202ENST00000519842 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXA7-202ENST00000519842 NPATQ14207 1427 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
HOXA7-202ENST00000519842 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXA7-202ENST00000519842 PTPRKQ15262 1439 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXA7-202ENST00000519842 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 MIA2Q96PC5 1412 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 KIF3BO15066 747 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 FBXO41Q8TF61 875 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 NCOA1Q15788 1441 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXA7-202ENST00000519842 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
HOXA7-202ENST00000519842 TSPY4P0CV99 314 aa29.29■■■□□ 2.28
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