RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518928.1

TSNARE1-203, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-203ENST00000518928 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 MADDQ8WXG6 1647 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 PTPRMP28827 1452 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-203ENST00000518928 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1-203ENST00000518928 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-203ENST00000518928 PREX2Q70Z35 1606 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-203ENST00000518928 AFAP1Q8N556 730 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-203ENST00000518928 CEP162Q5TB80 1403 aa22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1-203ENST00000518928 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.89■■□□□ 1.26
TSNARE1-203ENST00000518928 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 KDM5CP41229 1560 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 MLECQ14165 292 aa22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 ABCC1P33527 1531 aa22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 ATP10AO60312 1499 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-203ENST00000518928 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 ABCA6Q8N139 1617 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
TSNARE1-203ENST00000518928 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 TIAM1Q13009 1591 aa22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1-203ENST00000518928 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-203ENST00000518928 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-203ENST00000518928 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-203ENST00000518928 HSPA2P54652 639 aa22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1-203ENST00000518928 REREQ9P2R6 1566 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-203ENST00000518928 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-203ENST00000518928 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 AGLP35573 1532 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 NCOA2Q15596 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 ATP7AQ04656 1500 aa22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 MBD5Q9P267 1494 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-203ENST00000518928 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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TSNARE1-203ENST00000518928 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-203ENST00000518928 C3P01024 1663 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-203ENST00000518928 PLXNC1O60486 1568 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-203ENST00000518928 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-203ENST00000518928 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-203ENST00000518928 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-203ENST00000518928 A2MP01023 1474 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-203ENST00000518928 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 STRCQ7RTU9 1775 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 GGT6Q6P531 493 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 MAP3K1Q13233 1512 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-203ENST00000518928 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-203ENST00000518928 ZMYM3Q14202 1370 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-203ENST00000518928 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-203ENST00000518928 MROH2AA6NES4 1674 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-203ENST00000518928 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.37■■□□□ 1.17
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TSNARE1-203ENST00000518928 KIF3BO15066 747 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-203ENST00000518928 NPATQ14207 1427 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-203ENST00000518928 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-203ENST00000518928 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 FBXO41Q8TF61 875 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 MIA2Q96PC5 1412 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 NCOA1Q15788 1441 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 TSPY4P0CV99 314 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 TSPY10P0CW01 314 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 ABCC5O15440 1437 aa22.21■■□□□ 1.15
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