RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517557.5

PTDSS1-203, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-203ENST00000517557 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.33■■■■□ 3.57
PTDSS1-203ENST00000517557 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.32■■■■□ 3.56
PTDSS1-203ENST00000517557 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.31■■■■□ 3.56
PTDSS1-203ENST00000517557 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
PTDSS1-203ENST00000517557 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
PTDSS1-203ENST00000517557 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.29■■■■□ 3.56
PTDSS1-203ENST00000517557 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.26■■■■□ 3.56
PTDSS1-203ENST00000517557 CLIP1P30622 1438 aa37.23■■■■□ 3.55
PTDSS1-203ENST00000517557 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.18■■■■□ 3.54
PTDSS1-203ENST00000517557 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.17■■■■□ 3.54
PTDSS1-203ENST00000517557 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.13■■■■□ 3.54
PTDSS1-203ENST00000517557 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.13■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.12■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 ATP10AO60312 1499 aa37.12■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.11■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.11■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.09■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 MLECQ14165 292 aa37.08■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 KDM5CP41229 1560 aa37.08■■■■□ 3.53
PTDSS1-203ENST00000517557 PREX2Q70Z35 1606 aa37.05■■■■□ 3.52
PTDSS1-203ENST00000517557 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.03■■■■□ 3.52
PTDSS1-203ENST00000517557 AFAP1Q8N556 730 aa37.03■■■■□ 3.52
PTDSS1-203ENST00000517557 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.02■■■■□ 3.52
PTDSS1-203ENST00000517557 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.01■■■■□ 3.52
PTDSS1-203ENST00000517557 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.96■■■■□ 3.51
PTDSS1-203ENST00000517557 ABCC1P33527 1531 aa36.95■■■■□ 3.51
PTDSS1-203ENST00000517557 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.95■■■■□ 3.51
PTDSS1-203ENST00000517557 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.93■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.92■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.91■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 ABCA6Q8N139 1617 aa36.9■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 HSPA2P54652 639 aa36.89■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 REREQ9P2R6 1566 aa36.89■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.89■■■■□ 3.5
PTDSS1-203ENST00000517557 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.8■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.8■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 FBXO41Q8TF61 875 aa36.79■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.77■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 AGLP35573 1532 aa36.76■■■■□ 3.48
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PTDSS1-203ENST00000517557 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.71■■■■□ 3.47
PTDSS1-203ENST00000517557 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
PTDSS1-203ENST00000517557 C3P01024 1663 aa36.67■■■■□ 3.46
PTDSS1-203ENST00000517557 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.65■■■■□ 3.46
PTDSS1-203ENST00000517557 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.64■■■■□ 3.46
PTDSS1-203ENST00000517557 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.61■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.61■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.6■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PTDSS1-203ENST00000517557 ATP7AQ04656 1500 aa36.56■■■■□ 3.44
PTDSS1-203ENST00000517557 CEP162Q5TB80 1403 aa36.56■■■■□ 3.44
PTDSS1-203ENST00000517557 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.55■■■■□ 3.44
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PTDSS1-203ENST00000517557 STRCQ7RTU9 1775 aa36.54■■■■□ 3.44
PTDSS1-203ENST00000517557 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
PTDSS1-203ENST00000517557 TIAM1Q13009 1591 aa36.53■■■■□ 3.44
PTDSS1-203ENST00000517557 MROH2AA6NES4 1674 aa36.48■■■■□ 3.43
PTDSS1-203ENST00000517557 PLXNC1O60486 1568 aa36.47■■■■□ 3.43
PTDSS1-203ENST00000517557 A2MP01023 1474 aa36.44■■■■□ 3.42
PTDSS1-203ENST00000517557 CERKQ8TCT0 537 aa36.44■■■■□ 3.42
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
PTDSS1-203ENST00000517557 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.42■■■■□ 3.42
PTDSS1-203ENST00000517557 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.4■■■■□ 3.42
PTDSS1-203ENST00000517557 MBD5Q9P267 1494 aa36.38■■■■□ 3.41
PTDSS1-203ENST00000517557 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
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PTDSS1-203ENST00000517557 ZMYM3Q14202 1370 aa36.36■■■■□ 3.41
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PTDSS1-203ENST00000517557 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.29■■■■□ 3.4
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PTDSS1-203ENST00000517557 NCOA1Q15788 1441 aa36.25■■■■□ 3.39
PTDSS1-203ENST00000517557 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.24■■■■□ 3.39
PTDSS1-203ENST00000517557 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.23■■■■□ 3.39
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PTDSS1-203ENST00000517557 PTPRKQ15262 1439 aa36.2■■■■□ 3.39
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PTDSS1-203ENST00000517557 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
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PTDSS1-203ENST00000517557 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.18■■■■□ 3.38
PTDSS1-203ENST00000517557 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.14■■■■□ 3.38
PTDSS1-203ENST00000517557 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.13■■■■□ 3.37
PTDSS1-203ENST00000517557 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
PTDSS1-203ENST00000517557 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.11■■■■□ 3.37
PTDSS1-203ENST00000517557 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.09■■■■□ 3.37
PTDSS1-203ENST00000517557 KIF3BO15066 747 aa36.07■■■■□ 3.36
PTDSS1-203ENST00000517557 PLA2R1Q13018 1463 aa36.05■■■■□ 3.36
PTDSS1-203ENST00000517557 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.05■■■■□ 3.36
PTDSS1-203ENST00000517557 MAP3K1Q13233 1512 aa36.03■■■■□ 3.36
PTDSS1-203ENST00000517557 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.03■■■■□ 3.36
PTDSS1-203ENST00000517557 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.02■■■■□ 3.36
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