RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.12■■□□□ 1.61
SERF1B-208ENST00000515588 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.1■■□□□ 1.61
SERF1B-208ENST00000515588 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.1■■□□□ 1.61
SERF1B-208ENST00000515588 PREX2Q70Z35 1606 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-208ENST00000515588 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-208ENST00000515588 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-208ENST00000515588 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-208ENST00000515588 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-208ENST00000515588 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.02■■□□□ 1.6
SERF1B-208ENST00000515588 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.02■■□□□ 1.6
SERF1B-208ENST00000515588 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.02■■□□□ 1.6
SERF1B-208ENST00000515588 AFAP1Q8N556 730 aa25.01■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.01■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 TIAM1Q13009 1591 aa25■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.99■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.99■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 ABCC1P33527 1531 aa24.98■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.98■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.97■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.96■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SERF1B-208ENST00000515588 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 KDM5CP41229 1560 aa24.94■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.94■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.92■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.91■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 NCOA2Q15596 1464 aa24.91■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 MAP3K1Q13233 1512 aa24.91■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.89■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
SERF1B-208ENST00000515588 ATP10AO60312 1499 aa24.88■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.87■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.87■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.87■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.87■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.86■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1B-208ENST00000515588 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 ABCA6Q8N139 1617 aa24.79■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.79■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 MBD5Q9P267 1494 aa24.78■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 MADDQ8WXG6 1647 aa24.78■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 MLECQ14165 292 aa24.77■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SERF1B-208ENST00000515588 APLP2Q06481 763 aa24.76■■□□□ 1.55
SERF1B-208ENST00000515588 PTPRMP28827 1452 aa24.76■■□□□ 1.55
SERF1B-208ENST00000515588 REREQ9P2R6 1566 aa24.74■■□□□ 1.55
SERF1B-208ENST00000515588 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.72■■□□□ 1.55
SERF1B-208ENST00000515588 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 ATP7AQ04656 1500 aa24.7■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 AGLP35573 1532 aa24.67■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 MIA2Q96PC5 1412 aa24.65■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.64■■□□□ 1.54
SERF1B-208ENST00000515588 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.62■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.62■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.62■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.61■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 A2MP01023 1474 aa24.6■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 PLXNC1O60486 1568 aa24.59■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.59■■□□□ 1.53
SERF1B-208ENST00000515588 TSPY4P0CV99 314 aa24.54■■□□□ 1.52
SERF1B-208ENST00000515588 TSPY10P0CW01 314 aa24.54■■□□□ 1.52
SERF1B-208ENST00000515588 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.53■■□□□ 1.52
SERF1B-208ENST00000515588 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.53■■□□□ 1.52
SERF1B-208ENST00000515588 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SERF1B-208ENST00000515588 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SERF1B-208ENST00000515588 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.51■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.48■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 ABCC5O15440 1437 aa24.47■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.46■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 GGT6Q6P531 493 aa24.46■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SERF1B-208ENST00000515588 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.44■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 KIF3BO15066 747 aa24.42■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 C3P01024 1663 aa24.42■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 DAPK1P53355 1430 aa24.41■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 ZMYM3Q14202 1370 aa24.4■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.39■■□□□ 1.5
SERF1B-208ENST00000515588 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.39■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 HSPA2P54652 639 aa24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 MROH2AA6NES4 1674 aa24.36■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.33■■□□□ 1.49
SERF1B-208ENST00000515588 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
SERF1B-208ENST00000515588 KIF15Q9NS87 1388 aa24.32■■□□□ 1.48
SERF1B-208ENST00000515588 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.32■■□□□ 1.48
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