RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514663.5

PACRGL-232, Transcript of parkin coregulated like, humanhuman

TSL 4

Gene PACRGL, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGL-232ENST00000514663 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.45■■■■□ 3.43
PACRGL-232ENST00000514663 PTPRMP28827 1452 aa36.45■■■■□ 3.43
PACRGL-232ENST00000514663 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.45■■■■□ 3.43
PACRGL-232ENST00000514663 MADDQ8WXG6 1647 aa36.45■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 CLIP1P30622 1438 aa36.43■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.43■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.42■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.4■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.39■■■■□ 3.42
PACRGL-232ENST00000514663 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.38■■■■□ 3.41
PACRGL-232ENST00000514663 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.37■■■■□ 3.41
PACRGL-232ENST00000514663 PREX2Q70Z35 1606 aa36.32■■■■□ 3.4
PACRGL-232ENST00000514663 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
PACRGL-232ENST00000514663 KDM5CP41229 1560 aa36.27■■■■□ 3.4
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.26■■■■□ 3.4
PACRGL-232ENST00000514663 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.25■■■■□ 3.39
PACRGL-232ENST00000514663 ATP10AO60312 1499 aa36.23■■■■□ 3.39
PACRGL-232ENST00000514663 AFAP1Q8N556 730 aa36.2■■■■□ 3.39
PACRGL-232ENST00000514663 ABCC1P33527 1531 aa36.19■■■■□ 3.38
PACRGL-232ENST00000514663 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.19■■■■□ 3.38
PACRGL-232ENST00000514663 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.18■■■■□ 3.38
PACRGL-232ENST00000514663 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.17■■■■□ 3.38
PACRGL-232ENST00000514663 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.17■■■■□ 3.38
PACRGL-232ENST00000514663 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.13■■■■□ 3.37
PACRGL-232ENST00000514663 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.12■■■■□ 3.37
PACRGL-232ENST00000514663 ABCA6Q8N139 1617 aa36.1■■■■□ 3.37
PACRGL-232ENST00000514663 MLECQ14165 292 aa36.1■■■■□ 3.37
PACRGL-232ENST00000514663 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.1■■■■□ 3.37
PACRGL-232ENST00000514663 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.09■■■■□ 3.37
PACRGL-232ENST00000514663 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
PACRGL-232ENST00000514663 CEP162Q5TB80 1403 aa36.06■■■■□ 3.36
PACRGL-232ENST00000514663 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.06■■■■□ 3.36
PACRGL-232ENST00000514663 REREQ9P2R6 1566 aa36.06■■■■□ 3.36
PACRGL-232ENST00000514663 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.02■■■■□ 3.36
PACRGL-232ENST00000514663 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.97■■■■□ 3.35
PACRGL-232ENST00000514663 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
PACRGL-232ENST00000514663 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.97■■■■□ 3.35
PACRGL-232ENST00000514663 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.96■■■■□ 3.35
PACRGL-232ENST00000514663 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.95■■■■□ 3.35
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
PACRGL-232ENST00000514663 AGLP35573 1532 aa35.93■■■■□ 3.34
PACRGL-232ENST00000514663 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.9■■■■□ 3.34
PACRGL-232ENST00000514663 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.89■■■■□ 3.34
PACRGL-232ENST00000514663 TIAM1Q13009 1591 aa35.89■■■■□ 3.34
PACRGL-232ENST00000514663 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.86■■■■□ 3.33
PACRGL-232ENST00000514663 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
PACRGL-232ENST00000514663 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
PACRGL-232ENST00000514663 HSPA2P54652 639 aa35.84■■■■□ 3.33
PACRGL-232ENST00000514663 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PACRGL-232ENST00000514663 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.83■■■■□ 3.33
PACRGL-232ENST00000514663 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.81■■■■□ 3.32
PACRGL-232ENST00000514663 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
PACRGL-232ENST00000514663 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.79■■■■□ 3.32
PACRGL-232ENST00000514663 ATP7AQ04656 1500 aa35.78■■■■□ 3.32
PACRGL-232ENST00000514663 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
PACRGL-232ENST00000514663 C3P01024 1663 aa35.78■■■■□ 3.32
PACRGL-232ENST00000514663 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
PACRGL-232ENST00000514663 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
PACRGL-232ENST00000514663 PLXNC1O60486 1568 aa35.72■■■■□ 3.31
PACRGL-232ENST00000514663 MBD5Q9P267 1494 aa35.71■■■■□ 3.31
PACRGL-232ENST00000514663 NCOA2Q15596 1464 aa35.68■■■■□ 3.3
PACRGL-232ENST00000514663 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.67■■■■□ 3.3
PACRGL-232ENST00000514663 A2MP01023 1474 aa35.64■■■■□ 3.3
PACRGL-232ENST00000514663 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.63■■■■□ 3.29
PACRGL-232ENST00000514663 MROH2AA6NES4 1674 aa35.62■■■■□ 3.29
PACRGL-232ENST00000514663 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.62■■■■□ 3.29
PACRGL-232ENST00000514663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.6■■■■□ 3.29
PACRGL-232ENST00000514663 STRCQ7RTU9 1775 aa35.59■■■■□ 3.29
PACRGL-232ENST00000514663 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
PACRGL-232ENST00000514663 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.56■■■■□ 3.28
PACRGL-232ENST00000514663 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.55■■■■□ 3.28
PACRGL-232ENST00000514663 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.54■■■■□ 3.28
PACRGL-232ENST00000514663 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PACRGL-232ENST00000514663 FBXO41Q8TF61 875 aa35.52■■■■□ 3.28
PACRGL-232ENST00000514663 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.5■■■■□ 3.27
PACRGL-232ENST00000514663 MAP3K1Q13233 1512 aa35.49■■■■□ 3.27
PACRGL-232ENST00000514663 ZMYM3Q14202 1370 aa35.48■■■■□ 3.27
PACRGL-232ENST00000514663 NPATQ14207 1427 aa35.46■■■■□ 3.27
PACRGL-232ENST00000514663 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.44■■■■□ 3.26
PACRGL-232ENST00000514663 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
PACRGL-232ENST00000514663 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
PACRGL-232ENST00000514663 GGT6Q6P531 493 aa35.42■■■■□ 3.26
PACRGL-232ENST00000514663 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.38■■■■□ 3.25
PACRGL-232ENST00000514663 PTPRKQ15262 1439 aa35.35■■■■□ 3.25
PACRGL-232ENST00000514663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.34■■■■□ 3.25
PACRGL-232ENST00000514663 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.33■■■■□ 3.25
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 NCOA1Q15788 1441 aa35.32■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.31■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 CERKQ8TCT0 537 aa35.3■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 PTPRTO14522 1441 aa35.29■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.29■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.28■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.28■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 MIA2Q96PC5 1412 aa35.26■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 KIF3BO15066 747 aa35.26■■■■□ 3.24
PACRGL-232ENST00000514663 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
PACRGL-232ENST00000514663 TSPY4P0CV99 314 aa35.23■■■■□ 3.23
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