RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.22■■■■□ 3.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.22■■■■□ 3.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.22■■■■□ 3.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.21■■■■□ 3.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.2■■■■□ 3.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.15■■■■□ 3.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.13■■■■□ 3.7
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.13■■■■□ 3.69
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.1■■■■□ 3.69
RASGEF1B-210ENST00000512716 TIAM1Q13009 1591 aa38.08■■■■□ 3.69
RASGEF1B-210ENST00000512716 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.03■■■■□ 3.68
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.03■■■■□ 3.68
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.03■■■■□ 3.68
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCC1P33527 1531 aa38.02■■■■□ 3.68
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.02■■■■□ 3.68
RASGEF1B-210ENST00000512716 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38■■■■□ 3.67
RASGEF1B-210ENST00000512716 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
RASGEF1B-210ENST00000512716 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.97■■■■□ 3.67
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
RASGEF1B-210ENST00000512716 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.96■■■■□ 3.67
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM5CP41229 1560 aa37.95■■■■□ 3.67
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.93■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 AFAP1Q8N556 730 aa37.93■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAP3K1Q13233 1512 aa37.91■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.9■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.89■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.89■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 NCOA2Q15596 1464 aa37.89■■■■□ 3.66
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.87■■■■□ 3.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.87■■■■□ 3.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.87■■■■□ 3.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.84■■■■□ 3.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.83■■■■□ 3.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.82■■■■□ 3.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP10AO60312 1499 aa37.82■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.8■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 APLP2Q06481 763 aa37.8■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.79■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.79■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
RASGEF1B-210ENST00000512716 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.76■■■■□ 3.63
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCA6Q8N139 1617 aa37.75■■■■□ 3.63
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.74■■■■□ 3.63
RASGEF1B-210ENST00000512716 MADDQ8WXG6 1647 aa37.72■■■■□ 3.63
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
RASGEF1B-210ENST00000512716 REREQ9P2R6 1566 aa37.66■■■■□ 3.62
RASGEF1B-210ENST00000512716 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.64■■■■□ 3.62
RASGEF1B-210ENST00000512716 MLECQ14165 292 aa37.64■■■■□ 3.62
RASGEF1B-210ENST00000512716 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.62
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP7AQ04656 1500 aa37.62■■■■□ 3.61
RASGEF1B-210ENST00000512716 PTPRMP28827 1452 aa37.62■■■■□ 3.61
RASGEF1B-210ENST00000512716 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
RASGEF1B-210ENST00000512716 MBD5Q9P267 1494 aa37.61■■■■□ 3.61
RASGEF1B-210ENST00000512716 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.6■■■■□ 3.61
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.55■■■■□ 3.6
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.52■■■■□ 3.6
RASGEF1B-210ENST00000512716 AGLP35573 1532 aa37.52■■■■□ 3.6
RASGEF1B-210ENST00000512716 MIA2Q96PC5 1412 aa37.5■■■■□ 3.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.48■■■■□ 3.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.48■■■■□ 3.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.47■■■■□ 3.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.44■■■■□ 3.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 A2MP01023 1474 aa37.43■■■■□ 3.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLXNC1O60486 1568 aa37.41■■■■□ 3.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.39■■■■□ 3.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.36■■■■□ 3.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSPY4P0CV99 314 aa37.35■■■■□ 3.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSPY10P0CW01 314 aa37.35■■■■□ 3.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.31■■■■□ 3.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.29■■■■□ 3.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.22■■■■□ 3.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 C3P01024 1663 aa37.22■■■■□ 3.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.22■■■■□ 3.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 GGT6Q6P531 493 aa37.19■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 MROH2AA6NES4 1674 aa37.17■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.15■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCC5O15440 1437 aa37.15■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.14■■■■□ 3.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 DAPK1P53355 1430 aa37.13■■■■□ 3.53
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIF3BO15066 747 aa37.12■■■■□ 3.53
RASGEF1B-210ENST00000512716 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.11■■■■□ 3.53
RASGEF1B-210ENST00000512716 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
RASGEF1B-210ENST00000512716 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.08■■■■□ 3.53
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
RASGEF1B-210ENST00000512716 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZMYM3Q14202 1370 aa37.04■■■■□ 3.52
RASGEF1B-210ENST00000512716 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
RASGEF1B-210ENST00000512716 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.03■■■■□ 3.52
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIF15Q9NS87 1388 aa37■■■■□ 3.51
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