RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.91■■■■□ 3.5
ZBED3-203ENST00000511587 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.9■■■■□ 3.5
ZBED3-203ENST00000511587 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.89■■■■□ 3.5
ZBED3-203ENST00000511587 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.88■■■■□ 3.5
ZBED3-203ENST00000511587 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.86■■■■□ 3.49
ZBED3-203ENST00000511587 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.86■■■■□ 3.49
ZBED3-203ENST00000511587 PTPRMP28827 1452 aa36.83■■■■□ 3.49
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.83■■■■□ 3.49
ZBED3-203ENST00000511587 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.82■■■■□ 3.49
ZBED3-203ENST00000511587 MADDQ8WXG6 1647 aa36.82■■■■□ 3.49
ZBED3-203ENST00000511587 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.81■■■■□ 3.48
ZBED3-203ENST00000511587 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
ZBED3-203ENST00000511587 PREX2Q70Z35 1606 aa36.78■■■■□ 3.48
ZBED3-203ENST00000511587 KDM5CP41229 1560 aa36.74■■■■□ 3.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.73■■■■□ 3.47
ZBED3-203ENST00000511587 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.69■■■■□ 3.46
ZBED3-203ENST00000511587 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
ZBED3-203ENST00000511587 ABCC1P33527 1531 aa36.66■■■■□ 3.46
ZBED3-203ENST00000511587 ATP10AO60312 1499 aa36.66■■■■□ 3.46
ZBED3-203ENST00000511587 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.63■■■■□ 3.45
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.62■■■■□ 3.45
ZBED3-203ENST00000511587 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.61■■■■□ 3.45
ZBED3-203ENST00000511587 AFAP1Q8N556 730 aa36.61■■■■□ 3.45
ZBED3-203ENST00000511587 CEP162Q5TB80 1403 aa36.6■■■■□ 3.45
ZBED3-203ENST00000511587 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.56■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.56■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.56■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.53■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 REREQ9P2R6 1566 aa36.53■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 ABCA6Q8N139 1617 aa36.52■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.51■■■■□ 3.44
ZBED3-203ENST00000511587 MLECQ14165 292 aa36.47■■■■□ 3.43
ZBED3-203ENST00000511587 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.47■■■■□ 3.43
ZBED3-203ENST00000511587 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.45■■■■□ 3.43
ZBED3-203ENST00000511587 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.44■■■■□ 3.42
ZBED3-203ENST00000511587 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.43■■■■□ 3.42
ZBED3-203ENST00000511587 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.42■■■■□ 3.42
ZBED3-203ENST00000511587 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.39■■■■□ 3.42
ZBED3-203ENST00000511587 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.38■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 AGLP35573 1532 aa36.38■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 TIAM1Q13009 1591 aa36.36■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.36■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.34■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
ZBED3-203ENST00000511587 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.29■■■■□ 3.4
ZBED3-203ENST00000511587 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.29■■■■□ 3.4
ZBED3-203ENST00000511587 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
ZBED3-203ENST00000511587 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
ZBED3-203ENST00000511587 ATP7AQ04656 1500 aa36.24■■■■□ 3.39
ZBED3-203ENST00000511587 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
ZBED3-203ENST00000511587 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.23■■■■□ 3.39
ZBED3-203ENST00000511587 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ZBED3-203ENST00000511587 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
ZBED3-203ENST00000511587 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.19■■■■□ 3.38
ZBED3-203ENST00000511587 NCOA2Q15596 1464 aa36.18■■■■□ 3.38
ZBED3-203ENST00000511587 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
ZBED3-203ENST00000511587 MBD5Q9P267 1494 aa36.18■■■■□ 3.38
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
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ZBED3-203ENST00000511587 C3P01024 1663 aa36.15■■■■□ 3.38
ZBED3-203ENST00000511587 A2MP01023 1474 aa36.09■■■■□ 3.37
ZBED3-203ENST00000511587 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.08■■■■□ 3.37
ZBED3-203ENST00000511587 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.07■■■■□ 3.37
ZBED3-203ENST00000511587 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.07■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.05■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 MAP3K1Q13233 1512 aa36.04■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 MROH2AA6NES4 1674 aa36.03■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.03■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.01■■■■□ 3.36
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.99■■■■□ 3.35
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ZBED3-203ENST00000511587 STRCQ7RTU9 1775 aa35.9■■■■□ 3.34
ZBED3-203ENST00000511587 NPATQ14207 1427 aa35.9■■■■□ 3.34
ZBED3-203ENST00000511587 ZMYM3Q14202 1370 aa35.89■■■■□ 3.34
ZBED3-203ENST00000511587 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.89■■■■□ 3.34
ZBED3-203ENST00000511587 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
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ZBED3-203ENST00000511587 FBXO41Q8TF61 875 aa35.82■■■■□ 3.32
ZBED3-203ENST00000511587 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.82■■■■□ 3.32
ZBED3-203ENST00000511587 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.81■■■■□ 3.32
ZBED3-203ENST00000511587 MIA2Q96PC5 1412 aa35.8■■■■□ 3.32
ZBED3-203ENST00000511587 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.77■■■■□ 3.32
ZBED3-203ENST00000511587 PTPRKQ15262 1439 aa35.77■■■■□ 3.32
ZBED3-203ENST00000511587 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.74■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.73■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 TSPY4P0CV99 314 aa35.71■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 TSPY10P0CW01 314 aa35.71■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 NCOA1Q15788 1441 aa35.7■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.7■■■■□ 3.31
ZBED3-203ENST00000511587 KIF3BO15066 747 aa35.69■■■■□ 3.3
ZBED3-203ENST00000511587 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.67■■■■□ 3.3
ZBED3-203ENST00000511587 PTPRTO14522 1441 aa35.67■■■■□ 3.3
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