RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.24■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.23■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.21■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 MADDQ8WXG6 1647 aa40.2■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 PTPRMP28827 1452 aa40.2■■■■■ 4.03
ALYREF-203ENST00000511412 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.17■■■■■ 4.02
ALYREF-203ENST00000511412 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.16■■■■■ 4.02
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.16■■■■■ 4.02
ALYREF-203ENST00000511412 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.16■■■■■ 4.02
ALYREF-203ENST00000511412 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.1■■■■■ 4.01
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ALYREF-203ENST00000511412 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.07■■■■■ 4
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ALYREF-203ENST00000511412 ATP10AO60312 1499 aa39.96■■■■□ 3.99
ALYREF-203ENST00000511412 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.94■■■■□ 3.98
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC1P33527 1531 aa39.93■■■■□ 3.98
ALYREF-203ENST00000511412 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.92■■■■□ 3.98
ALYREF-203ENST00000511412 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.89■■■■□ 3.98
ALYREF-203ENST00000511412 AFAP1Q8N556 730 aa39.87■■■■□ 3.97
ALYREF-203ENST00000511412 MLECQ14165 292 aa39.85■■■■□ 3.97
ALYREF-203ENST00000511412 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.84■■■■□ 3.97
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.82■■■■□ 3.97
ALYREF-203ENST00000511412 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.81■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.8■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.8■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA6Q8N139 1617 aa39.8■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.79■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 REREQ9P2R6 1566 aa39.78■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 CEP162Q5TB80 1403 aa39.76■■■■□ 3.96
ALYREF-203ENST00000511412 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.75■■■■□ 3.95
ALYREF-203ENST00000511412 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
ALYREF-203ENST00000511412 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.73■■■■□ 3.95
ALYREF-203ENST00000511412 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.71■■■■□ 3.95
ALYREF-203ENST00000511412 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.69■■■■□ 3.94
ALYREF-203ENST00000511412 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.68■■■■□ 3.94
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
ALYREF-203ENST00000511412 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.65■■■■□ 3.94
ALYREF-203ENST00000511412 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
ALYREF-203ENST00000511412 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.64■■■■□ 3.94
ALYREF-203ENST00000511412 AGLP35573 1532 aa39.62■■■■□ 3.93
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.6■■■■□ 3.93
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ALYREF-203ENST00000511412 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.56■■■■□ 3.92
ALYREF-203ENST00000511412 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.54■■■■□ 3.92
ALYREF-203ENST00000511412 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.91
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ALYREF-203ENST00000511412 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-203ENST00000511412 ATP7AQ04656 1500 aa39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-203ENST00000511412 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
ALYREF-203ENST00000511412 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
ALYREF-203ENST00000511412 C3P01024 1663 aa39.45■■■■□ 3.91
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ALYREF-203ENST00000511412 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.35■■■■□ 3.89
ALYREF-203ENST00000511412 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.35■■■■□ 3.89
ALYREF-203ENST00000511412 NCOA2Q15596 1464 aa39.35■■■■□ 3.89
ALYREF-203ENST00000511412 A2MP01023 1474 aa39.33■■■■□ 3.89
ALYREF-203ENST00000511412 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.33■■■■□ 3.89
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
ALYREF-203ENST00000511412 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.32■■■■□ 3.88
ALYREF-203ENST00000511412 MBD5Q9P267 1494 aa39.31■■■■□ 3.88
ALYREF-203ENST00000511412 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
ALYREF-203ENST00000511412 MROH2AA6NES4 1674 aa39.31■■■■□ 3.88
ALYREF-203ENST00000511412 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.24■■■■□ 3.87
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO41Q8TF61 875 aa39.22■■■■□ 3.87
ALYREF-203ENST00000511412 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.21■■■■□ 3.87
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.2■■■■□ 3.87
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.2■■■■□ 3.87
ALYREF-203ENST00000511412 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
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ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K1Q13233 1512 aa39.14■■■■□ 3.86
ALYREF-203ENST00000511412 NPATQ14207 1427 aa39.14■■■■□ 3.86
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ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.1■■■■□ 3.85
ALYREF-203ENST00000511412 GGT6Q6P531 493 aa39.09■■■■□ 3.85
ALYREF-203ENST00000511412 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.06■■■■□ 3.84
ALYREF-203ENST00000511412 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
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ALYREF-203ENST00000511412 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.01■■■■□ 3.84
ALYREF-203ENST00000511412 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39■■■■□ 3.83
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ALYREF-203ENST00000511412 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
ALYREF-203ENST00000511412 PTPRKQ15262 1439 aa38.97■■■■□ 3.83
ALYREF-203ENST00000511412 NCOA1Q15788 1441 aa38.96■■■■□ 3.83
ALYREF-203ENST00000511412 CERKQ8TCT0 537 aa38.94■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 PTPRTO14522 1441 aa38.94■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.94■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.93■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.93■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 MIA2Q96PC5 1412 aa38.92■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 TSPY4P0CV99 314 aa38.92■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 TSPY10P0CW01 314 aa38.92■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.91■■■■□ 3.82
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