RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
SNF8-208	ENST00000510195	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SNF8-208	ENST00000510195	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SNF8-208	ENST00000510195	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.24	■■■■■ 4.51
SNF8-208	ENST00000510195	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.22	■■■■■ 4.51
SNF8-208	ENST00000510195	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.22	■■■■■ 4.51
SNF8-208	ENST00000510195	PTPRM	P28827	1452 aa		43.19	■■■■■ 4.51
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SNF8-208	ENST00000510195	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.1	■■■■■ 4.49
SNF8-208	ENST00000510195	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SNF8-208	ENST00000510195	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SNF8-208	ENST00000510195	ATP10A	O60312	1499 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SNF8-208	ENST00000510195	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SNF8-208	ENST00000510195	KDM5C	P41229	1560 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SNF8-208	ENST00000510195	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SNF8-208	ENST00000510195	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SNF8-208	ENST00000510195	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SNF8-208	ENST00000510195	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
SNF8-208	ENST00000510195	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SNF8-208	ENST00000510195	ABCC1	P33527	1531 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SNF8-208	ENST00000510195	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SNF8-208	ENST00000510195	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SNF8-208	ENST00000510195	MLEC	Q14165	292 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SNF8-208	ENST00000510195	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SNF8-208	ENST00000510195	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.81	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.78	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
SNF8-208	ENST00000510195	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SNF8-208	ENST00000510195	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SNF8-208	ENST00000510195	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.69	■■■■■ 4.43
SNF8-208	ENST00000510195	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	AGL	P35573	1532 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SNF8-208	ENST00000510195	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SNF8-208	ENST00000510195	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SNF8-208	ENST00000510195	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.59	■■■■■ 4.41
SNF8-208	ENST00000510195	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
SNF8-208	ENST00000510195	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
SNF8-208	ENST00000510195	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SNF8-208	ENST00000510195	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SNF8-208	ENST00000510195	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SNF8-208	ENST00000510195	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SNF8-208	ENST00000510195	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.45	■■■■■ 4.39
SNF8-208	ENST00000510195	HSPA2	P54652	639 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.43	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
SNF8-208	ENST00000510195	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SNF8-208	ENST00000510195	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SNF8-208	ENST00000510195	A2M	P01023	1474 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SNF8-208	ENST00000510195	C3	P01024	1663 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SNF8-208	ENST00000510195	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SNF8-208	ENST00000510195	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SNF8-208	ENST00000510195	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.29	■■■■■ 4.36
SNF8-208	ENST00000510195	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.29	■■■■■ 4.36
SNF8-208	ENST00000510195	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SNF8-208	ENST00000510195	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SNF8-208	ENST00000510195	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SNF8-208	ENST00000510195	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SNF8-208	ENST00000510195	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.21	■■■■■ 4.35
SNF8-208	ENST00000510195	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SNF8-208	ENST00000510195	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SNF8-208	ENST00000510195	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.16	■■■■■ 4.34
SNF8-208	ENST00000510195	NPAT	Q14207	1427 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SNF8-208	ENST00000510195	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.13	■■■■■ 4.33
SNF8-208	ENST00000510195	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
SNF8-208	ENST00000510195	GGT6	Q6P531	493 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SNF8-208	ENST00000510195	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
SNF8-208	ENST00000510195	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
SNF8-208	ENST00000510195	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SNF8-208	ENST00000510195	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SNF8-208	ENST00000510195	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.03	■■■■■ 4.32
SNF8-208	ENST00000510195	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42	■■■■■ 4.31
SNF8-208	ENST00000510195	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SNF8-208	ENST00000510195	APLP2	Q06481	763 aa		41.95	■■■■■ 4.31
SNF8-208	ENST00000510195	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SNF8-208	ENST00000510195	KIF3B	O15066	747 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SNF8-208	ENST00000510195	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SNF8-208	ENST00000510195	PTPRT	O14522	1441 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SNF8-208	ENST00000510195	CERK	Q8TCT0	537 aa		41.9	■■■■■ 4.3
SNF8-208	ENST00000510195	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SNF8-208	ENST00000510195	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28

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