RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.27■■■□□ 2.12
RASGEF1B-205ENST00000507538 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADGRL1O94910 1474 aa28.26■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 NCOA2Q15596 1464 aa28.24■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 RAPGEF3O95398 923 aa28.22■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.22■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.22■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.2■■■□□ 2.11
RASGEF1B-205ENST00000507538 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.2■■■□□ 2.1
RASGEF1B-205ENST00000507538 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
RASGEF1B-205ENST00000507538 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.17■■■□□ 2.1
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCC1P33527 1531 aa28.14■■■□□ 2.1
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 RICTORQ6R327 1708 aa28.12■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.12■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.09■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.09■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.08■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.05■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.05■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.04■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 AFAP1Q8N556 730 aa28.04■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.03■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM5CP41229 1560 aa28.03■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.02■■■□□ 2.08
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.01■■■□□ 2.07
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.99■■■□□ 2.07
RASGEF1B-205ENST00000507538 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
RASGEF1B-205ENST00000507538 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.99■■■□□ 2.07
RASGEF1B-205ENST00000507538 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.98■■■□□ 2.07
RASGEF1B-205ENST00000507538 MIA2Q96PC5 1412 aa27.97■■■□□ 2.07
RASGEF1B-205ENST00000507538 MBD5Q9P267 1494 aa27.95■■■□□ 2.06
RASGEF1B-205ENST00000507538 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.94■■■□□ 2.06
RASGEF1B-205ENST00000507538 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.94■■■□□ 2.06
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.89■■■□□ 2.06
RASGEF1B-205ENST00000507538 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.89■■■□□ 2.06
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATP10AO60312 1499 aa27.87■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.86■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.84■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.84■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.84■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.84■■■□□ 2.05
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATP7AQ04656 1500 aa27.82■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCA6Q8N139 1617 aa27.82■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.82■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.81■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.81■■■□□ 2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
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RASGEF1B-205ENST00000507538 TSPY10P0CW01 314 aa27.72■■■□□ 2.03
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCC5O15440 1437 aa27.7■■■□□ 2.03
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RASGEF1B-205ENST00000507538 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.68■■■□□ 2.02
RASGEF1B-205ENST00000507538 A2MP01023 1474 aa27.68■■■□□ 2.02
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.68■■■□□ 2.02
RASGEF1B-205ENST00000507538 DAPK1P53355 1430 aa27.67■■■□□ 2.02
RASGEF1B-205ENST00000507538 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.67■■■□□ 2.02
RASGEF1B-205ENST00000507538 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.65■■■□□ 2.02
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RASGEF1B-205ENST00000507538 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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RASGEF1B-205ENST00000507538 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.52■■■□□ 2
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RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF3BO15066 747 aa27.47■■□□□ 1.99
RASGEF1B-205ENST00000507538 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.47■■□□□ 1.99
RASGEF1B-205ENST00000507538 GGT6Q6P531 493 aa27.45■■□□□ 1.98
RASGEF1B-205ENST00000507538 ERBINQ96RT1 1412 aa27.43■■□□□ 1.98
RASGEF1B-205ENST00000507538 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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RASGEF1B-205ENST00000507538 ITGAEP38570 1179 aa27.42■■□□□ 1.98
RASGEF1B-205ENST00000507538 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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