RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505760.5

HERC4-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 4

Gene HERC4, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-212ENST00000505760 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.32■■■■■ 4.04
HERC4-212ENST00000505760 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.31■■■■■ 4.04
HERC4-212ENST00000505760 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.29■■■■■ 4.04
HERC4-212ENST00000505760 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.28■■■■■ 4.04
HERC4-212ENST00000505760 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.26■■■■■ 4.04
HERC4-212ENST00000505760 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
HERC4-212ENST00000505760 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.24■■■■■ 4.03
HERC4-212ENST00000505760 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.21■■■■■ 4.03
HERC4-212ENST00000505760 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.21■■■■■ 4.03
HERC4-212ENST00000505760 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
HERC4-212ENST00000505760 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.15■■■■■ 4.02
HERC4-212ENST00000505760 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.1■■■■■ 4.01
HERC4-212ENST00000505760 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.09■■■■■ 4.01
HERC4-212ENST00000505760 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.09■■■■■ 4.01
HERC4-212ENST00000505760 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
HERC4-212ENST00000505760 ATP10AO60312 1499 aa40.07■■■■■ 4.01
HERC4-212ENST00000505760 MLECQ14165 292 aa40.07■■■■■ 4.01
HERC4-212ENST00000505760 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.04■■■■■ 4
HERC4-212ENST00000505760 PREX2Q70Z35 1606 aa40.03■■■■■ 4
HERC4-212ENST00000505760 AFAP1Q8N556 730 aa40.03■■■■■ 4
HERC4-212ENST00000505760 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.01■■■■■ 4
HERC4-212ENST00000505760 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.01■■■■■ 4
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HERC4-212ENST00000505760 MYT1LQ9UL68 1186 aa40■■■■□ 3.99
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HERC4-212ENST00000505760 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.94■■■■□ 3.98
HERC4-212ENST00000505760 ABCC1P33527 1531 aa39.91■■■■□ 3.98
HERC4-212ENST00000505760 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.9■■■■□ 3.98
HERC4-212ENST00000505760 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.88■■■■□ 3.97
HERC4-212ENST00000505760 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.87■■■■□ 3.97
HERC4-212ENST00000505760 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.86■■■■□ 3.97
HERC4-212ENST00000505760 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.85■■■■□ 3.97
HERC4-212ENST00000505760 ABCA6Q8N139 1617 aa39.82■■■■□ 3.96
HERC4-212ENST00000505760 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
HERC4-212ENST00000505760 REREQ9P2R6 1566 aa39.79■■■■□ 3.96
HERC4-212ENST00000505760 HSPA2P54652 639 aa39.77■■■■□ 3.96
HERC4-212ENST00000505760 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
HERC4-212ENST00000505760 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.73■■■■□ 3.95
HERC4-212ENST00000505760 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.72■■■■□ 3.95
HERC4-212ENST00000505760 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.72■■■■□ 3.95
HERC4-212ENST00000505760 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.69■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.69■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 CEP162Q5TB80 1403 aa39.67■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 AGLP35573 1532 aa39.66■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.65■■■■□ 3.94
HERC4-212ENST00000505760 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.63■■■■□ 3.931e-6■■■□□ 16.9
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HERC4-212ENST00000505760 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.61■■■■□ 3.93
HERC4-212ENST00000505760 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
HERC4-212ENST00000505760 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.58■■■■□ 3.93
HERC4-212ENST00000505760 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.56■■■■□ 3.92
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HERC4-212ENST00000505760 FBXO41Q8TF61 875 aa39.55■■■■□ 3.92
HERC4-212ENST00000505760 C3P01024 1663 aa39.53■■■■□ 3.92
HERC4-212ENST00000505760 ATP7AQ04656 1500 aa39.51■■■■□ 3.92
HERC4-212ENST00000505760 TIAM1Q13009 1591 aa39.5■■■■□ 3.91
HERC4-212ENST00000505760 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.49■■■■□ 3.91
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HERC4-212ENST00000505760 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.46■■■■□ 3.91
HERC4-212ENST00000505760 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
HERC4-212ENST00000505760 A2MP01023 1474 aa39.38■■■■□ 3.9
HERC4-212ENST00000505760 PLXNC1O60486 1568 aa39.36■■■■□ 3.89
HERC4-212ENST00000505760 MROH2AA6NES4 1674 aa39.34■■■■□ 3.89
HERC4-212ENST00000505760 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.33■■■■□ 3.89
HERC4-212ENST00000505760 STRCQ7RTU9 1775 aa39.33■■■■□ 3.89
HERC4-212ENST00000505760 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.32■■■■□ 3.89
HERC4-212ENST00000505760 MBD5Q9P267 1494 aa39.32■■■■□ 3.89
HERC4-212ENST00000505760 NCOA2Q15596 1464 aa39.31■■■■□ 3.88
HERC4-212ENST00000505760 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.3■■■■□ 3.88
HERC4-212ENST00000505760 ZMYM3Q14202 1370 aa39.27■■■■□ 3.88
HERC4-212ENST00000505760 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
HERC4-212ENST00000505760 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.25■■■■□ 3.87
HERC4-212ENST00000505760 GGT6Q6P531 493 aa39.25■■■■□ 3.87
HERC4-212ENST00000505760 CERKQ8TCT0 537 aa39.24■■■■□ 3.87
HERC4-212ENST00000505760 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.23■■■■□ 3.87
HERC4-212ENST00000505760 NPATQ14207 1427 aa39.23■■■■□ 3.87
HERC4-212ENST00000505760 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.21■■■■□ 3.87
HERC4-212ENST00000505760 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.18■■■■□ 3.86
HERC4-212ENST00000505760 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.15■■■■□ 3.86
HERC4-212ENST00000505760 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.14■■■■□ 3.86
HERC4-212ENST00000505760 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.14■■■■□ 3.86
HERC4-212ENST00000505760 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
HERC4-212ENST00000505760 PTPRTO14522 1441 aa39.1■■■■□ 3.85
HERC4-212ENST00000505760 NCOA1Q15788 1441 aa39.07■■■■□ 3.85
HERC4-212ENST00000505760 PTPRKQ15262 1439 aa39.06■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.05■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.05■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.04■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 KIF3BO15066 747 aa39.03■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 TSPY4P0CV99 314 aa39.03■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 TSPY10P0CW01 314 aa39.03■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 MAP3K1Q13233 1512 aa39.03■■■■□ 3.84
HERC4-212ENST00000505760 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
HERC4-212ENST00000505760 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
HERC4-212ENST00000505760 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
HERC4-212ENST00000505760 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.91■■■■□ 3.82
HERC4-212ENST00000505760 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.9■■■■□ 3.82
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