RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 GPR37O15354 613 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 DPYSL4O14531 572 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 PDIA6Q15084 440 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 FAM117AQ9C073 453 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-209ENST00000504994 GOLGA2Q08379 1002 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 PHF12Q96QT6 1004 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 ARID3AQ99856 593 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 TRPC6Q9Y210 931 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.1□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 DSG2Q14126 1118 aa9.09□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 POTEHQ6S545 545 aa9.09□□□□□ -0.95
HERC3-209ENST00000504994 CCDC102AQ96A19 550 aa9.08□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 ARID3CA6NKF2 412 aa9.07□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 MAP2K5Q13163 448 aa9.06□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.06□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 HRCP23327 699 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 AMHR2Q16671 573 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-209ENST00000504994 IRF6O14896 467 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 FOXK1P85037 733 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 NUTM2FA1L443 756 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 APBB1O00213 710 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 FECHP22830 423 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 FLIIQ13045 1269 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.99□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 MICALL2Q8IY33 904 aa8.99□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 GNPATO15228 680 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 TMC2Q8TDI7 906 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 OSBPP22059 807 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 PLPP6Q8IY26 295 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-209ENST00000504994 TIE1P35590 1138 aa8.96□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 GOPCQ9HD26 462 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 HIC1Q14526 733 aa8.94□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.94□□□□□ -0.98
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HERC3-209ENST00000504994 MS4A1P11836 297 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 MAP3K9P80192 1104 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 C2orf72A6NCS6 295 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 KIF3CO14782 793 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 A6NJR5 290 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 TRAK2O60296 914 aa8.9□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 DDX12PQ92771 950 aa8.9□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HERC3-209ENST00000504994 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 PTGER2P43116 358 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 PTGDRQ13258 359 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 MCM6Q14566 821 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 OXER1Q8TDS5 423 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 NECTIN2Q92692 538 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-209ENST00000504994 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 POM121Q96HA1 1249 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.81□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 EVI5O60447 810 aa8.8□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.8□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 CLCN1P35523 988 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 PHOX2BQ99453 314 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-209ENST00000504994 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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