RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502364.2

ZBED1P1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ZBED1P1, Length 1,930 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1P1-201ENST00000502364 GLI2P10070 1586 aa22.73■■□□□ 1.23
ZBED1P1-201ENST00000502364 DIP2BQ9P265 1576 aa22.73■■□□□ 1.23
ZBED1P1-201ENST00000502364 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ZBED1P1-201ENST00000502364 PREX2Q70Z35 1606 aa22.72■■□□□ 1.23
ZBED1P1-201ENST00000502364 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.72■■□□□ 1.23
ZBED1P1-201ENST00000502364 MIA2Q96PC5 1412 aa22.72■■□□□ 1.23
ZBED1P1-201ENST00000502364 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.69■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 PLCH2O75038 1416 aa22.67■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.67■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.66■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.65■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.65■■□□□ 1.22
ZBED1P1-201ENST00000502364 CD109Q6YHK3 1445 aa22.64■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.59■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.58■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.58■■□□□ 1.21
ZBED1P1-201ENST00000502364 FANCAO15360 1455 aa22.57■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.56■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.56■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 HFM1A2PYH4 1435 aa22.54■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.52■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 NEO1Q92859 1461 aa22.52■■□□□ 1.2
ZBED1P1-201ENST00000502364 PTPRKQ15262 1439 aa22.51■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 ABCC1P33527 1531 aa22.5■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.5■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 TSPOAP1O95153 1857 aa22.5■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.48■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 AKNAQ7Z591 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 ADGRL1O94910 1474 aa22.47■■□□□ 1.19
ZBED1P1-201ENST00000502364 NAIPQ13075 1403 aa22.45■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.45■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 MBD5Q9P267 1494 aa22.44■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 DAPK1P53355 1430 aa22.43■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.43■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.43■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.41■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 ABCC5O15440 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1P1-201ENST00000502364 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.39■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.36■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 TSPY4P0CV99 314 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 TSPY10P0CW01 314 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.34■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.34■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.33■■□□□ 1.17
ZBED1P1-201ENST00000502364 ROCK1Q13464 1354 aa22.33■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 KDM5CP41229 1560 aa22.31■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 RICTORQ6R327 1708 aa22.31■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 ADGRL2O95490 1459 aa22.31■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 AFAP1Q8N556 730 aa22.28■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.28■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.28■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.27■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ZBED1P1-201ENST00000502364 PLXNC1O60486 1568 aa22.26■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.26■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.26■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.26■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.26■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 ATP7AQ04656 1500 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 NCOA1Q15788 1441 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 RAPGEF3O95398 923 aa22.23■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 NEUROD1Q13562 356 aa22.21■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 KDM6BO15054 1643 aa22.21■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.2■■□□□ 1.15
ZBED1P1-201ENST00000502364 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.2■■□□□ 1.14
ZBED1P1-201ENST00000502364 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ZBED1P1-201ENST00000502364 KIF15Q9NS87 1388 aa22.19■■□□□ 1.14
ZBED1P1-201ENST00000502364 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.19■■□□□ 1.14
ZBED1P1-201ENST00000502364 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.16■■□□□ 1.14
ZBED1P1-201ENST00000502364 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ZBED1P1-201ENST00000502364 TONSLQ96HA7 1378 aa22.13■■□□□ 1.13
ZBED1P1-201ENST00000502364 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
ZBED1P1-201ENST00000502364 TRIM52Q96A61 297 aa22.12■■□□□ 1.13
ZBED1P1-201ENST00000502364 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.12■■□□□ 1.13
ZBED1P1-201ENST00000502364 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.11■■□□□ 1.13
ZBED1P1-201ENST00000502364 ERBINQ96RT1 1412 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms