RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498124.1

CDKN2A-208, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDKN2A, Length 880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-208ENST00000498124 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
CDKN2A-208ENST00000498124 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.98■■■■□ 3.51
CDKN2A-208ENST00000498124 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.97■■■■□ 3.51
CDKN2A-208ENST00000498124 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.96■■■■□ 3.51
CDKN2A-208ENST00000498124 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.94■■■■□ 3.5
CDKN2A-208ENST00000498124 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CDKN2A-208ENST00000498124 CLIP1P30622 1438 aa36.91■■■■□ 3.5
CDKN2A-208ENST00000498124 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.89■■■■□ 3.5
CDKN2A-208ENST00000498124 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.87■■■■□ 3.49
CDKN2A-208ENST00000498124 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.85■■■■□ 3.49
CDKN2A-208ENST00000498124 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
CDKN2A-208ENST00000498124 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.84■■■■□ 3.49
CDKN2A-208ENST00000498124 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.82■■■■□ 3.49
CDKN2A-208ENST00000498124 KDM5CP41229 1560 aa36.79■■■■□ 3.48
CDKN2A-208ENST00000498124 PREX2Q70Z35 1606 aa36.79■■■■□ 3.48
CDKN2A-208ENST00000498124 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.76■■■■□ 3.48
CDKN2A-208ENST00000498124 ATP10AO60312 1499 aa36.74■■■■□ 3.47
CDKN2A-208ENST00000498124 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.71■■■■□ 3.47
CDKN2A-208ENST00000498124 ABCC1P33527 1531 aa36.7■■■■□ 3.47
CDKN2A-208ENST00000498124 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.69■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.69■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.68■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 AFAP1Q8N556 730 aa36.67■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.67■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.65■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.64■■■■□ 3.46
CDKN2A-208ENST00000498124 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
CDKN2A-208ENST00000498124 ABCA6Q8N139 1617 aa36.61■■■■□ 3.45
CDKN2A-208ENST00000498124 MLECQ14165 292 aa36.61■■■■□ 3.45
CDKN2A-208ENST00000498124 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.6■■■■□ 3.45
CDKN2A-208ENST00000498124 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.59■■■■□ 3.45
CDKN2A-208ENST00000498124 REREQ9P2R6 1566 aa36.58■■■■□ 3.45
CDKN2A-208ENST00000498124 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
CDKN2A-208ENST00000498124 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.53■■■■□ 3.44
CDKN2A-208ENST00000498124 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.49■■■■□ 3.43
CDKN2A-208ENST00000498124 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.48■■■■□ 3.43
CDKN2A-208ENST00000498124 CEP162Q5TB80 1403 aa36.46■■■■□ 3.43
CDKN2A-208ENST00000498124 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.45■■■■□ 3.43
CDKN2A-208ENST00000498124 AGLP35573 1532 aa36.44■■■■□ 3.42
CDKN2A-208ENST00000498124 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.41■■■■□ 3.42
CDKN2A-208ENST00000498124 HSPA2P54652 639 aa36.38■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.37■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.35■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 TIAM1Q13009 1591 aa36.35■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.35■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.34■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.34■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CDKN2A-208ENST00000498124 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CDKN2A-208ENST00000498124 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.31■■■■□ 3.4
CDKN2A-208ENST00000498124 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.29■■■■□ 3.4
CDKN2A-208ENST00000498124 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CDKN2A-208ENST00000498124 C3P01024 1663 aa36.27■■■■□ 3.4
CDKN2A-208ENST00000498124 ATP7AQ04656 1500 aa36.27■■■■□ 3.4
CDKN2A-208ENST00000498124 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CDKN2A-208ENST00000498124 PLXNC1O60486 1568 aa36.23■■■■□ 3.39
CDKN2A-208ENST00000498124 MBD5Q9P267 1494 aa36.18■■■■□ 3.38
CDKN2A-208ENST00000498124 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CDKN2A-208ENST00000498124 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CDKN2A-208ENST00000498124 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CDKN2A-208ENST00000498124 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.14■■■■□ 3.38
CDKN2A-208ENST00000498124 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.14■■■■□ 3.38
CDKN2A-208ENST00000498124 A2MP01023 1474 aa36.12■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 NCOA2Q15596 1464 aa36.12■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 FBXO41Q8TF61 875 aa36.12■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 MROH2AA6NES4 1674 aa36.11■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.1■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 STRCQ7RTU9 1775 aa36.1■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.08■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.07■■■■□ 3.37
CDKN2A-208ENST00000498124 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
CDKN2A-208ENST00000498124 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.02■■■■□ 3.36
CDKN2A-208ENST00000498124 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
CDKN2A-208ENST00000498124 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36■■■■□ 3.35
CDKN2A-208ENST00000498124 NPATQ14207 1427 aa35.98■■■■□ 3.35
CDKN2A-208ENST00000498124 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.98■■■■□ 3.35
CDKN2A-208ENST00000498124 ZMYM3Q14202 1370 aa35.97■■■■□ 3.35
CDKN2A-208ENST00000498124 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.97■■■■□ 3.35
CDKN2A-208ENST00000498124 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.89■■■■□ 3.34
CDKN2A-208ENST00000498124 MAP3K1Q13233 1512 aa35.89■■■■□ 3.34
CDKN2A-208ENST00000498124 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 PTPRKQ15262 1439 aa35.87■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 GGT6Q6P531 493 aa35.87■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 NCOA1Q15788 1441 aa35.86■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 CERKQ8TCT0 537 aa35.86■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.86■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 PTPRTO14522 1441 aa35.83■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.83■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
CDKN2A-208ENST00000498124 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CDKN2A-208ENST00000498124 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.8■■■■□ 3.32
CDKN2A-208ENST00000498124 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.79■■■■□ 3.32
CDKN2A-208ENST00000498124 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.79■■■■□ 3.32
CDKN2A-208ENST00000498124 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
CDKN2A-208ENST00000498124 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.73■■■■□ 3.31
CDKN2A-208ENST00000498124 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.73■■■■□ 3.31
CDKN2A-208ENST00000498124 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.72■■■■□ 3.31
CDKN2A-208ENST00000498124 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.72■■■■□ 3.31
CDKN2A-208ENST00000498124 KIF3BO15066 747 aa35.7■■■■□ 3.31
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