RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CREBZF	Q9NS37	354 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DISP1	Q96F81	1524 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MIER1	Q8N108	512 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH8	Q96L42	1107 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0556	O60303	1618 aa		18.66	■□□□□ 0.58
SKAP2-209	ENST00000497511	CD109	Q6YHK3	1445 aa		18.63	■□□□□ 0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA3	Q08378	1498 aa		18.58	■□□□□ 0.56
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		18.57	■□□□□ 0.56
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID3C	A6NKF2	412 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SKAP2-209	ENST00000497511	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.53	■□□□□ 0.56
SKAP2-209	ENST00000497511	HAX1	O00165	279 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA8	O94911	1581 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF21B	O75037	1637 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	P3H3	Q8IVL6	736 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO41	Q8TF61	875 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPGEF3	O95398	923 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP10B	O94823	1461 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRM	P28827	1452 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PRX	Q9BXM0	1461 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NEO1	Q92859	1461 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MADD	Q8WXG6	1647 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NUBP1	P53384	320 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA2	P54652	639 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	EVX2	Q03828	476 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SPOCK2	Q92563	424 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD9	Q5K651	1589 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	AKNA	Q7Z591	1439 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MLEC	Q14165	292 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RASEF	Q8IZ41	740 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM212A	Q96EL1	285 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCA	O15360	1455 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN6	P51797	869 aa		18.14	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		18.13	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CERK	Q8TCT0	537 aa		18.11	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		18.11	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		18.1	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		18.09	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RICTOR	Q6R327	1708 aa		18.09	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	18.08	■□□□□ 0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GSE1	Q14687	1217 aa		18.07	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		18.07	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		18.07	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		18.06	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		18.06	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	EEA1	Q15075	1411 aa		18.05	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		18.04	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		18.04	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		18.04	■□□□□ 0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HECW1	Q76N89	1606 aa		18.01	■□□□□ 0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		18.01	■□□□□ 0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCH2	O75038	1416 aa		18	■□□□□ 0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		17.99	■□□□□ 0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	17.99	■□□□□ 0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP10A	O60312	1499 aa		17.99	■□□□□ 0.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms