RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496314.1

TSC22D1-209, Transcript of TSC22 domain family member 1, human

TSL 2

Gene TSC22D1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC22D1-209	ENST00000496314	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.27	■■■■■ 4.2
TSC22D1-209	ENST00000496314	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.27	■■■■■ 4.2
TSC22D1-209	ENST00000496314	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TSC22D1-209	ENST00000496314	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TSC22D1-209	ENST00000496314	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TSC22D1-209	ENST00000496314	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.23	■■■■■ 4.19
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	41.22	■■■■■ 4.19
TSC22D1-209	ENST00000496314	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.18	■■■■■ 4.18
TSC22D1-209	ENST00000496314	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
TSC22D1-209	ENST00000496314	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.15	■■■■■ 4.18
TSC22D1-209	ENST00000496314	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.13	■■■■■ 4.17
TSC22D1-209	ENST00000496314	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.12	■■■■■ 4.17
TSC22D1-209	ENST00000496314	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.11	■■■■■ 4.17
TSC22D1-209	ENST00000496314	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.11	■■■■■ 4.17
TSC22D1-209	ENST00000496314	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		41.03	■■■■■ 4.16
TSC22D1-209	ENST00000496314	ABCC1	P33527	1531 aa		41.01	■■■■■ 4.16
TSC22D1-209	ENST00000496314	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41	■■■■■ 4.15
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
TSC22D1-209	ENST00000496314	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TSC22D1-209	ENST00000496314	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TSC22D1-209	ENST00000496314	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TSC22D1-209	ENST00000496314	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.95	■■■■■ 4.15
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.93	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.89	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.89	■■■■■ 4.14
TSC22D1-209	ENST00000496314	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.81	■■■■■ 4.12
TSC22D1-209	ENST00000496314	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.78	■■■■■ 4.12
TSC22D1-209	ENST00000496314	KDM5C	P41229	1560 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TSC22D1-209	ENST00000496314	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.75	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.71	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.7	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
TSC22D1-209	ENST00000496314	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TSC22D1-209	ENST00000496314	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
TSC22D1-209	ENST00000496314	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.64	■■■■■ 4.1
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TSC22D1-209	ENST00000496314	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
TSC22D1-209	ENST00000496314	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TSC22D1-209	ENST00000496314	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.58	■■■■■ 4.09
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.58	■■■■■ 4.09
TSC22D1-209	ENST00000496314	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.55	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	ATP10A	O60312	1499 aa		40.54	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.51	■■■■■ 4.08
TSC22D1-209	ENST00000496314	DAPK1	P53355	1430 aa		40.47	■■■■■ 4.07
TSC22D1-209	ENST00000496314	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
TSC22D1-209	ENST00000496314	ABCC5	O15440	1437 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TSC22D1-209	ENST00000496314	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TSC22D1-209	ENST00000496314	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TSC22D1-209	ENST00000496314	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.4	■■■■■ 4.06
TSC22D1-209	ENST00000496314	ITGAE	P38570	1179 aa		40.39	■■■■■ 4.06
TSC22D1-209	ENST00000496314	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.39	■■■■■ 4.06
TSC22D1-209	ENST00000496314	MLEC	Q14165	292 aa		40.38	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.38	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	A2M	P01023	1474 aa		40.35	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.35	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.34	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.32	■■■■■ 4.05
TSC22D1-209	ENST00000496314	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.28	■■■■■ 4.04
TSC22D1-209	ENST00000496314	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TSC22D1-209	ENST00000496314	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04
TSC22D1-209	ENST00000496314	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.26	■■■■■ 4.04
TSC22D1-209	ENST00000496314	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.25	■■■■■ 4.03
TSC22D1-209	ENST00000496314	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
TSC22D1-209	ENST00000496314	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.23	■■■■■ 4.03
TSC22D1-209	ENST00000496314	AGL	P35573	1532 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TSC22D1-209	ENST00000496314	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.2	■■■■■ 4.03
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIF3B	O15066	747 aa		40.14	■■■■■ 4.02
TSC22D1-209	ENST00000496314	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.14	■■■■■ 4.02
TSC22D1-209	ENST00000496314	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40.13	■■■■■ 4.02
TSC22D1-209	ENST00000496314	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.13	■■■■■ 4.01
TSC22D1-209	ENST00000496314	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.13	■■■■■ 4.01
TSC22D1-209	ENST00000496314	GGT6	Q6P531	493 aa		40.12	■■■■■ 4.01
TSC22D1-209	ENST00000496314	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.11	■■■■■ 4.01
TSC22D1-209	ENST00000496314	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
TSC22D1-209	ENST00000496314	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4.01
TSC22D1-209	ENST00000496314	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.07	■■■■■ 4
TSC22D1-209	ENST00000496314	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
TSC22D1-209	ENST00000496314	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.05	■■■■■ 4
TSC22D1-209	ENST00000496314	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.01	■■■■■ 4
TSC22D1-209	ENST00000496314	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.01	■■■■■ 4
TSC22D1-209	ENST00000496314	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99

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