RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDE3BQ13370 1112 aa23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CFAP44Q96MT7 982 aa23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MORC1Q86VD1 984 aa23.07■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.06■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KANK1Q14678 1352 aa23.06■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FMN1Q68DA7 1419 aa23.03■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GBP4Q96PP9 640 aa22.99■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GGT6Q6P531 493 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUP155O75694 1391 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SOX12O15370 315 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.96■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLCB2Q00722 1185 aa22.94■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.94■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.94■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MLECQ14165 292 aa22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCNJ4P48050 445 aa22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STK26Q9P289 416 aa22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FGD1P98174 961 aa22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NLRP13Q86W25 1043 aa22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.89■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GSE1Q14687 1217 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDE4AP27815 886 aa22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.85■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WIZO95785 1651 aa22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMARCA2P51531 1590 aa22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NRDCO43847 1150 aa22.83■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF15Q9NS87 1388 aa22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MCCP23508 829 aa22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOLGA2Q08379 1002 aa22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 APBB1O00213 710 aa22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM161AQ3B820 660 aa22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF3BO15066 747 aa22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NPHP1O15259 732 aa22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.64■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.63■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 JPH4Q96JJ6 628 aa22.6■■□□□ 1.21
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