RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 DISP1Q96F81 1524 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 FGD1P98174 961 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-213ENST00000496055 NEO1Q92859 1461 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 PRXQ9BXM0 1461 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 AKNAQ7Z591 1439 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 BCANQ96GW7 911 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO41Q8TF61 875 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 CLIP1P30622 1438 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA8O94911 1581 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 RAPGEF3O95398 923 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 FANCAO15360 1455 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP10BO94823 1461 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 MLECQ14165 292 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 FMN1Q68DA7 1419 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO3Q9UK99 471 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-213ENST00000496055 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.65□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 NEUROD1Q13562 356 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRMP28827 1452 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 AAMPQ13685 434 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCH2O75038 1416 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF21BO75037 1637 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP10AO60312 1499 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD9Q5K651 1589 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-213ENST00000496055 CERKQ8TCT0 537 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 HECW1Q76N89 1606 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 HSPA2P54652 639 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF14Q15058 1648 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 AFAP1Q8N556 730 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 MADDQ8WXG6 1647 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPY4P0CV99 314 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPY10P0CW01 314 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-213ENST00000496055 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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