RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.42■■■□□ 2.62
ARRDC1-211ENST00000495220 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.41■■■□□ 2.62
ARRDC1-211ENST00000495220 NEO1Q92859 1461 aa31.41■■■□□ 2.62
ARRDC1-211ENST00000495220 PREX2Q70Z35 1606 aa31.41■■■□□ 2.62
ARRDC1-211ENST00000495220 FANCAO15360 1455 aa31.4■■■□□ 2.62
ARRDC1-211ENST00000495220 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.38■■■□□ 2.61
ARRDC1-211ENST00000495220 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.38■■■□□ 2.61
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.37■■■□□ 2.61
ARRDC1-211ENST00000495220 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.36■■■□□ 2.61
ARRDC1-211ENST00000495220 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
ARRDC1-211ENST00000495220 AKNAQ7Z591 1439 aa31.32■■■□□ 2.61
ARRDC1-211ENST00000495220 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.32■■■□□ 2.6
ARRDC1-211ENST00000495220 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
ARRDC1-211ENST00000495220 MIA2Q96PC5 1412 aa31.29■■■□□ 2.6
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRL1O94910 1474 aa31.28■■■□□ 2.6
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
ARRDC1-211ENST00000495220 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.22■■■□□ 2.59
ARRDC1-211ENST00000495220 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.2■■■□□ 2.59
ARRDC1-211ENST00000495220 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.2■■■□□ 2.59
ARRDC1-211ENST00000495220 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.2■■■□□ 2.58
ARRDC1-211ENST00000495220 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.18■■■□□ 2.58
ARRDC1-211ENST00000495220 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC1P33527 1531 aa31.18■■■□□ 2.58
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
ARRDC1-211ENST00000495220 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.14■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.11■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.11■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.1■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 RAPGEF3O95398 923 aa31.1■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.09■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.08■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.08■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 MBD5Q9P267 1494 aa31.08■■■□□ 2.57
ARRDC1-211ENST00000495220 RICTORQ6R327 1708 aa31.07■■■□□ 2.56
ARRDC1-211ENST00000495220 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.06■■■□□ 2.56
ARRDC1-211ENST00000495220 AFAP1Q8N556 730 aa31.04■■■□□ 2.56
ARRDC1-211ENST00000495220 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.04■■■□□ 2.56
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.02■■■□□ 2.56
ARRDC1-211ENST00000495220 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.556e-6■■■□□ 15.6
ARRDC1-211ENST00000495220 KDM5CP41229 1560 aa31■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.98■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.98■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.95■■■□□ 2.55
ARRDC1-211ENST00000495220 TSPY4P0CV99 314 aa30.93■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 TSPY10P0CW01 314 aa30.93■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.9■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC5O15440 1437 aa30.9■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.89■■■□□ 2.54
ARRDC1-211ENST00000495220 DAPK1P53355 1430 aa30.89■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.86■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.85■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.85■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.84■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.84■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 ATP7AQ04656 1500 aa30.83■■■□□ 2.53
ARRDC1-211ENST00000495220 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.81■■■□□ 2.52
ARRDC1-211ENST00000495220 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.81■■■□□ 2.52
ARRDC1-211ENST00000495220 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.81■■■□□ 2.52
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.81■■■□□ 2.52
ARRDC1-211ENST00000495220 ATP10AO60312 1499 aa30.78■■■□□ 2.52
ARRDC1-211ENST00000495220 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
ARRDC1-211ENST00000495220 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.75■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.74■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCA6Q8N139 1617 aa30.74■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 PTPRKQ15262 1439 aa30.72■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRL2O95490 1459 aa30.71■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.71■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 PLXNC1O60486 1568 aa30.71■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 REREQ9P2R6 1566 aa30.71■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 PTPRMP28827 1452 aa30.7■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.7■■■□□ 2.51
ARRDC1-211ENST00000495220 ITGAEP38570 1179 aa30.69■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 NCOA1Q15788 1441 aa30.69■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.68■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 ROCK1Q13464 1354 aa30.68■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 A2MP01023 1474 aa30.67■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.67■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
ARRDC1-211ENST00000495220 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.63■■■□□ 2.49
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF15Q9NS87 1388 aa30.63■■■□□ 2.49
ARRDC1-211ENST00000495220 AGLP35573 1532 aa30.62■■■□□ 2.49
ARRDC1-211ENST00000495220 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.6■■■□□ 2.49
ARRDC1-211ENST00000495220 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
ARRDC1-211ENST00000495220 MADDQ8WXG6 1647 aa30.56■■■□□ 2.48
ARRDC1-211ENST00000495220 ERBINQ96RT1 1412 aa30.54■■■□□ 2.48
ARRDC1-211ENST00000495220 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.53■■■□□ 2.48
ARRDC1-211ENST00000495220 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
ARRDC1-211ENST00000495220 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.48■■■□□ 2.47
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF3BO15066 747 aa30.48■■■□□ 2.47
ARRDC1-211ENST00000495220 HFM1A2PYH4 1435 aa30.47■■■□□ 2.47
ARRDC1-211ENST00000495220 NAIPQ13075 1403 aa30.46■■■□□ 2.47
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