RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495174.5

SH3BP1-208, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 947 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-208ENST00000495174 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1-208ENST00000495174 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1-208ENST00000495174 RAPGEF3O95398 923 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1-208ENST00000495174 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 TIAM1Q13009 1591 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 MAP3K1Q13233 1512 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-208ENST00000495174 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCC1P33527 1531 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 KDM5CP41229 1560 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.7■■□□□ 1.07
SH3BP1-208ENST00000495174 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 NCOA2Q15596 1464 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-208ENST00000495174 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 APLP2Q06481 763 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 AFAP1Q8N556 730 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 ATP10AO60312 1499 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-208ENST00000495174 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 REREQ9P2R6 1566 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCA6Q8N139 1617 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-208ENST00000495174 MBD5Q9P267 1494 aa21.52■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 MIA2Q96PC5 1412 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 ATP7AQ04656 1500 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 MADDQ8WXG6 1647 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 AGLP35573 1532 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.45■■□□□ 1.03
SH3BP1-208ENST00000495174 PTPRMP28827 1452 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-208ENST00000495174 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-208ENST00000495174 PLXNC1O60486 1568 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1-208ENST00000495174 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 A2MP01023 1474 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 MLECQ14165 292 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 TSPY4P0CV99 314 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 TSPY10P0CW01 314 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1-208ENST00000495174 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 MROH2AA6NES4 1674 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP1-208ENST00000495174 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 C3P01024 1663 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCC5O15440 1437 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 DAPK1P53355 1430 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1-208ENST00000495174 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 GGT6Q6P531 493 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 KIF3BO15066 747 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 ZMYM3Q14202 1370 aa21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1-208ENST00000495174 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms