RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495098.5

MTMR3-212, Transcript of myotubularin related protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MTMR3, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3-212ENST00000495098 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.32■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.31■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.31■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 PTPRMP28827 1452 aa35.3■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 MADDQ8WXG6 1647 aa35.3■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.28■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.27■■■■□ 3.24
MTMR3-212ENST00000495098 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.25■■■■□ 3.23
MTMR3-212ENST00000495098 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
MTMR3-212ENST00000495098 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.22■■■■□ 3.23
MTMR3-212ENST00000495098 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.22■■■■□ 3.23
MTMR3-212ENST00000495098 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.2■■■■□ 3.23
MTMR3-212ENST00000495098 MLECQ14165 292 aa35.19■■■■□ 3.22
MTMR3-212ENST00000495098 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.19■■■■□ 3.22
MTMR3-212ENST00000495098 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.18■■■■□ 3.22
MTMR3-212ENST00000495098 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.16■■■■□ 3.22
MTMR3-212ENST00000495098 AFAP1Q8N556 730 aa35.13■■■■□ 3.21
MTMR3-212ENST00000495098 PREX2Q70Z35 1606 aa35.11■■■■□ 3.21
MTMR3-212ENST00000495098 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.1■■■■□ 3.21
MTMR3-212ENST00000495098 ATP10AO60312 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
MTMR3-212ENST00000495098 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.07■■■■□ 3.2
MTMR3-212ENST00000495098 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.05■■■■□ 3.2
MTMR3-212ENST00000495098 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.05■■■■□ 3.2
MTMR3-212ENST00000495098 KDM5CP41229 1560 aa35.02■■■■□ 3.2
MTMR3-212ENST00000495098 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.99■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 ABCC1P33527 1531 aa34.99■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.98■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.97■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 CEP162Q5TB80 1403 aa34.95■■■■□ 3.19
MTMR3-212ENST00000495098 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.94■■■■□ 3.18
MTMR3-212ENST00000495098 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.92■■■■□ 3.18
MTMR3-212ENST00000495098 ABCA6Q8N139 1617 aa34.92■■■■□ 3.18
MTMR3-212ENST00000495098 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.9■■■■□ 3.18
MTMR3-212ENST00000495098 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
MTMR3-212ENST00000495098 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.89■■■■□ 3.18
MTMR3-212ENST00000495098 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.87■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 HSPA2P54652 639 aa34.86■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.84■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.84■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.83■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
MTMR3-212ENST00000495098 REREQ9P2R6 1566 aa34.79■■■■□ 3.16
MTMR3-212ENST00000495098 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.78■■■■□ 3.16
MTMR3-212ENST00000495098 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.74■■■■□ 3.15
MTMR3-212ENST00000495098 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
MTMR3-212ENST00000495098 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
MTMR3-212ENST00000495098 AGLP35573 1532 aa34.7■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 TIAM1Q13009 1591 aa34.7■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.69■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.68■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.66■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 ATP7AQ04656 1500 aa34.65■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.14
MTMR3-212ENST00000495098 C3P01024 1663 aa34.63■■■■□ 3.13
MTMR3-212ENST00000495098 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
MTMR3-212ENST00000495098 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.58■■■■□ 3.13
MTMR3-212ENST00000495098 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.55■■■■□ 3.12
MTMR3-212ENST00000495098 NCOA2Q15596 1464 aa34.54■■■■□ 3.12
MTMR3-212ENST00000495098 A2MP01023 1474 aa34.52■■■■□ 3.12
MTMR3-212ENST00000495098 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.5■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 FBXO41Q8TF61 875 aa34.49■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 MBD5Q9P267 1494 aa34.49■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.47■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 GGT6Q6P531 493 aa34.47■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 PLXNC1O60486 1568 aa34.47■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
MTMR3-212ENST00000495098 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.44■■■■□ 3.1
MTMR3-212ENST00000495098 MROH2AA6NES4 1674 aa34.43■■■■□ 3.1
MTMR3-212ENST00000495098 STRCQ7RTU9 1775 aa34.42■■■■□ 3.1
MTMR3-212ENST00000495098 ZMYM3Q14202 1370 aa34.41■■■■□ 3.1
MTMR3-212ENST00000495098 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.4■■■■□ 3.1
MTMR3-212ENST00000495098 MAP3K1Q13233 1512 aa34.38■■■■□ 3.09
MTMR3-212ENST00000495098 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.37■■■■□ 3.09
MTMR3-212ENST00000495098 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.37■■■■□ 3.09
MTMR3-212ENST00000495098 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
MTMR3-212ENST00000495098 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.32■■■■□ 3.08
MTMR3-212ENST00000495098 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.3■■■■□ 3.08
MTMR3-212ENST00000495098 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
MTMR3-212ENST00000495098 NPATQ14207 1427 aa34.3■■■■□ 3.08
MTMR3-212ENST00000495098 CERKQ8TCT0 537 aa34.29■■■■□ 3.08
MTMR3-212ENST00000495098 KIF3BO15066 747 aa34.27■■■■□ 3.08
MTMR3-212ENST00000495098 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.25■■■■□ 3.07
MTMR3-212ENST00000495098 TSPY4P0CV99 314 aa34.25■■■■□ 3.07
MTMR3-212ENST00000495098 TSPY10P0CW01 314 aa34.25■■■■□ 3.07
MTMR3-212ENST00000495098 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.23■■■■□ 3.07
MTMR3-212ENST00000495098 PTPRKQ15262 1439 aa34.21■■■■□ 3.07
MTMR3-212ENST00000495098 APLP2Q06481 763 aa34.2■■■■□ 3.07
MTMR3-212ENST00000495098 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR3-212ENST00000495098 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR3-212ENST00000495098 NCOA1Q15788 1441 aa34.17■■■■□ 3.06
MTMR3-212ENST00000495098 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.16■■■■□ 3.06
MTMR3-212ENST00000495098 PTPRTO14522 1441 aa34.15■■■■□ 3.06
MTMR3-212ENST00000495098 MIA2Q96PC5 1412 aa34.15■■■■□ 3.06
MTMR3-212ENST00000495098 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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