RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43	■■■■■ 4.47
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43	■■■■■ 4.47
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.98	■■■■■ 4.47
PLXNA3-208	ENST00000495040	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PLXNA3-208	ENST00000495040	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PLXNA3-208	ENST00000495040	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PLXNA3-208	ENST00000495040	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PLXNA3-208	ENST00000495040	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTPRM	P28827	1452 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PLXNA3-208	ENST00000495040	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.83	■■■■■ 4.45
PLXNA3-208	ENST00000495040	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.82	■■■■■ 4.44
PLXNA3-208	ENST00000495040	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PLXNA3-208	ENST00000495040	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PLXNA3-208	ENST00000495040	KDM5C	P41229	1560 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATP10A	O60312	1499 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PLXNA3-208	ENST00000495040	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PLXNA3-208	ENST00000495040	ABCC1	P33527	1531 aa		42.72	■■■■■ 4.43
PLXNA3-208	ENST00000495040	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PLXNA3-208	ENST00000495040	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.68	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.63	■■■■■ 4.42
PLXNA3-208	ENST00000495040	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.62	■■■■■ 4.41
PLXNA3-208	ENST00000495040	MLEC	Q14165	292 aa		42.61	■■■■■ 4.41
PLXNA3-208	ENST00000495040	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.58	■■■■■ 4.41
PLXNA3-208	ENST00000495040	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.56	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.56	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.52	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.52	■■■■■ 4.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.48	■■■■■ 4.39
PLXNA3-208	ENST00000495040	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PLXNA3-208	ENST00000495040	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PLXNA3-208	ENST00000495040	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PLXNA3-208	ENST00000495040	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.43	■■■■■ 4.38
PLXNA3-208	ENST00000495040	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.42	■■■■■ 4.38
PLXNA3-208	ENST00000495040	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.42	■■■■■ 4.38
PLXNA3-208	ENST00000495040	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PLXNA3-208	ENST00000495040	AGL	P35573	1532 aa		42.38	■■■■■ 4.37
PLXNA3-208	ENST00000495040	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
PLXNA3-208	ENST00000495040	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
PLXNA3-208	ENST00000495040	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.27	■■■■■ 4.36
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
PLXNA3-208	ENST00000495040	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
PLXNA3-208	ENST00000495040	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
PLXNA3-208	ENST00000495040	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
PLXNA3-208	ENST00000495040	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.19	■■■■■ 4.34
PLXNA3-208	ENST00000495040	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.15	■■■■■ 4.34
PLXNA3-208	ENST00000495040	HSPA2	P54652	639 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PLXNA3-208	ENST00000495040	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	A2M	P01023	1474 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.1	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.1	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	C3	P01024	1663 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.08	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.08	■■■■■ 4.33
PLXNA3-208	ENST00000495040	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.04	■■■■■ 4.32
PLXNA3-208	ENST00000495040	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
PLXNA3-208	ENST00000495040	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
PLXNA3-208	ENST00000495040	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		41.98	■■■■■ 4.31
PLXNA3-208	ENST00000495040	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.97	■■■■■ 4.31
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PLXNA3-208	ENST00000495040	APLP2	Q06481	763 aa		41.92	■■■■■ 4.3
PLXNA3-208	ENST00000495040	GGT6	Q6P531	493 aa		41.92	■■■■■ 4.3
PLXNA3-208	ENST00000495040	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.91	■■■■■ 4.3
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.89	■■■■■ 4.3
PLXNA3-208	ENST00000495040	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.89	■■■■■ 4.3
PLXNA3-208	ENST00000495040	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PLXNA3-208	ENST00000495040	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.87	■■■■■ 4.29
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
PLXNA3-208	ENST00000495040	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.86	■■■■■ 4.29
PLXNA3-208	ENST00000495040	NPAT	Q14207	1427 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PLXNA3-208	ENST00000495040	KIF3B	O15066	747 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PLXNA3-208	ENST00000495040	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.73	■■■■■ 4.27
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.73	■■■■■ 4.27
PLXNA3-208	ENST00000495040	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.72	■■■■■ 4.27
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.69	■■■■■ 4.26
PLXNA3-208	ENST00000495040	FBXO41	Q8TF61	875 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PLXNA3-208	ENST00000495040	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.6	■■■■■ 4.25
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.6	■■■■■ 4.25
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PLXNA3-208	ENST00000495040	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.57	■■■■■ 4.25

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