RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-211ENST00000493436 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP4-211ENST00000493436 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP4-211ENST00000493436 PREX2Q70Z35 1606 aa26.83■■□□□ 1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-211ENST00000493436 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-211ENST00000493436 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-211ENST00000493436 AFAP1Q8N556 730 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC1P33527 1531 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM5CP41229 1560 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP10AO60312 1499 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 MADDQ8WXG6 1647 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRMP28827 1452 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-211ENST00000493436 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.64■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 TIAM1Q13009 1591 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 MLECQ14165 292 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA6Q8N139 1617 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP4-211ENST00000493436 REREQ9P2R6 1566 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-211ENST00000493436 NCOA2Q15596 1464 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-211ENST00000493436 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-211ENST00000493436 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K1Q13233 1512 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 AGLP35573 1532 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP7AQ04656 1500 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 MBD5Q9P267 1494 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP4-211ENST00000493436 APLP2Q06481 763 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-211ENST00000493436 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP4-211ENST00000493436 A2MP01023 1474 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 PLXNC1O60486 1568 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-211ENST00000493436 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 C3P01024 1663 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 MIA2Q96PC5 1412 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA2P54652 639 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPY4P0CV99 314 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPY10P0CW01 314 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 GGT6Q6P531 493 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 MROH2AA6NES4 1674 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP4-211ENST00000493436 ZMYM3Q14202 1370 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF3BO15066 747 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-211ENST00000493436 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-211ENST00000493436 NPATQ14207 1427 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP4-211ENST00000493436 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-211ENST00000493436 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC5O15440 1437 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRKQ15262 1439 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-211ENST00000493436 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-211ENST00000493436 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-211ENST00000493436 STRCQ7RTU9 1775 aa25.98■■□□□ 1.75
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