RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492099.1

SH3GL3-204, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, human

TSL 1 (best)

Gene SH3GL3, Length 1,170 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3GL3-204	ENST00000492099	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.47	■■■■■ 4.55
SH3GL3-204	ENST00000492099	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.46	■■■■■ 4.55
SH3GL3-204	ENST00000492099	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.45	■■■■■ 4.55
SH3GL3-204	ENST00000492099	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		43.44	■■■■■ 4.54
SH3GL3-204	ENST00000492099	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.39	■■■■■ 4.54
SH3GL3-204	ENST00000492099	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SH3GL3-204	ENST00000492099	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.36	■■■■■ 4.53
SH3GL3-204	ENST00000492099	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.35	■■■■■ 4.53
SH3GL3-204	ENST00000492099	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.32	■■■■■ 4.53
SH3GL3-204	ENST00000492099	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.32	■■■■■ 4.52
SH3GL3-204	ENST00000492099	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SH3GL3-204	ENST00000492099	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.26	■■■■■ 4.52
SH3GL3-204	ENST00000492099	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.26	■■■■■ 4.52
SH3GL3-204	ENST00000492099	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.24	■■■■■ 4.51
SH3GL3-204	ENST00000492099	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.24	■■■■■ 4.51
SH3GL3-204	ENST00000492099	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
SH3GL3-204	ENST00000492099	KDM5C	P41229	1560 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SH3GL3-204	ENST00000492099	ABCC1	P33527	1531 aa		43.19	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	ATP10A	O60312	1499 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	PTPRM	P28827	1452 aa		43.13	■■■■■ 4.5
SH3GL3-204	ENST00000492099	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SH3GL3-204	ENST00000492099	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SH3GL3-204	ENST00000492099	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SH3GL3-204	ENST00000492099	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SH3GL3-204	ENST00000492099	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SH3GL3-204	ENST00000492099	MLEC	Q14165	292 aa		43	■■■■■ 4.47
SH3GL3-204	ENST00000492099	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SH3GL3-204	ENST00000492099	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SH3GL3-204	ENST00000492099	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.97	■■■■■ 4.47	4e-6	■■■■□ 24.7
SH3GL3-204	ENST00000492099	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SH3GL3-204	ENST00000492099	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
SH3GL3-204	ENST00000492099	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SH3GL3-204	ENST00000492099	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SH3GL3-204	ENST00000492099	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
SH3GL3-204	ENST00000492099	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
SH3GL3-204	ENST00000492099	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.88	■■■■■ 4.46
SH3GL3-204	ENST00000492099	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SH3GL3-204	ENST00000492099	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SH3GL3-204	ENST00000492099	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SH3GL3-204	ENST00000492099	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
SH3GL3-204	ENST00000492099	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SH3GL3-204	ENST00000492099	AGL	P35573	1532 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SH3GL3-204	ENST00000492099	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SH3GL3-204	ENST00000492099	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SH3GL3-204	ENST00000492099	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SH3GL3-204	ENST00000492099	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
SH3GL3-204	ENST00000492099	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.43
SH3GL3-204	ENST00000492099	APLP2	Q06481	763 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SH3GL3-204	ENST00000492099	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.66	■■■■■ 4.42
SH3GL3-204	ENST00000492099	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SH3GL3-204	ENST00000492099	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
SH3GL3-204	ENST00000492099	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SH3GL3-204	ENST00000492099	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SH3GL3-204	ENST00000492099	A2M	P01023	1474 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SH3GL3-204	ENST00000492099	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.58	■■■■■ 4.41
SH3GL3-204	ENST00000492099	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
SH3GL3-204	ENST00000492099	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SH3GL3-204	ENST00000492099	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SH3GL3-204	ENST00000492099	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SH3GL3-204	ENST00000492099	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SH3GL3-204	ENST00000492099	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SH3GL3-204	ENST00000492099	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SH3GL3-204	ENST00000492099	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SH3GL3-204	ENST00000492099	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SH3GL3-204	ENST00000492099	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
SH3GL3-204	ENST00000492099	HSPA2	P54652	639 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SH3GL3-204	ENST00000492099	GGT6	Q6P531	493 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SH3GL3-204	ENST00000492099	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SH3GL3-204	ENST00000492099	C3	P01024	1663 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SH3GL3-204	ENST00000492099	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SH3GL3-204	ENST00000492099	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
SH3GL3-204	ENST00000492099	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.33	■■■■■ 4.37
SH3GL3-204	ENST00000492099	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SH3GL3-204	ENST00000492099	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SH3GL3-204	ENST00000492099	KIF3B	O15066	747 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SH3GL3-204	ENST00000492099	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SH3GL3-204	ENST00000492099	NPAT	Q14207	1427 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SH3GL3-204	ENST00000492099	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
SH3GL3-204	ENST00000492099	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SH3GL3-204	ENST00000492099	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SH3GL3-204	ENST00000492099	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
SH3GL3-204	ENST00000492099	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SH3GL3-204	ENST00000492099	ABCC5	O15440	1437 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SH3GL3-204	ENST00000492099	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SH3GL3-204	ENST00000492099	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SH3GL3-204	ENST00000492099	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SH3GL3-204	ENST00000492099	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SH3GL3-204	ENST00000492099	DAPK1	P53355	1430 aa		42.03	■■■■■ 4.32

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