RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490812.5

PTPN18-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN18, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-215ENST00000490812 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.39■■■■□ 3.1
PTPN18-215ENST00000490812 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.38■■■■□ 3.09
PTPN18-215ENST00000490812 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPN18-215ENST00000490812 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.34■■■■□ 3.09
PTPN18-215ENST00000490812 PREX2Q70Z35 1606 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPN18-215ENST00000490812 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPN18-215ENST00000490812 CEP162Q5TB80 1403 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPN18-215ENST00000490812 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPN18-215ENST00000490812 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPN18-215ENST00000490812 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PTPN18-215ENST00000490812 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPN18-215ENST00000490812 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.24■■■■□ 3.07
PTPN18-215ENST00000490812 KDM5CP41229 1560 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPN18-215ENST00000490812 PTPRMP28827 1452 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPN18-215ENST00000490812 ABCC1P33527 1531 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPN18-215ENST00000490812 MADDQ8WXG6 1647 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPN18-215ENST00000490812 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPN18-215ENST00000490812 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPN18-215ENST00000490812 ATP10AO60312 1499 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPN18-215ENST00000490812 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.13■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.13■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.13■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 AFAP1Q8N556 730 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.08■■■■□ 3.05
PTPN18-215ENST00000490812 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.06■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.06■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.05■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 REREQ9P2R6 1566 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPN18-215ENST00000490812 MYT1LQ9UL68 1186 aa34■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 ABCA6Q8N139 1617 aa34■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.99■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.99■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.97■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 TIAM1Q13009 1591 aa33.97■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPN18-215ENST00000490812 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.95■■■■□ 3.02
PTPN18-215ENST00000490812 MLECQ14165 292 aa33.94■■■■□ 3.02
PTPN18-215ENST00000490812 AGLP35573 1532 aa33.89■■■■□ 3.02
PTPN18-215ENST00000490812 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
PTPN18-215ENST00000490812 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
PTPN18-215ENST00000490812 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PTPN18-215ENST00000490812 NCOA2Q15596 1464 aa33.83■■■■□ 3.01
PTPN18-215ENST00000490812 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.82■■■■□ 3
PTPN18-215ENST00000490812 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
PTPN18-215ENST00000490812 ATP7AQ04656 1500 aa33.81■■■■□ 3
PTPN18-215ENST00000490812 MAP3K1Q13233 1512 aa33.8■■■■□ 3
PTPN18-215ENST00000490812 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.77■■■■□ 3
PTPN18-215ENST00000490812 MBD5Q9P267 1494 aa33.76■■■□□ 2.99
PTPN18-215ENST00000490812 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
PTPN18-215ENST00000490812 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.74■■■□□ 2.99
PTPN18-215ENST00000490812 PLXNC1O60486 1568 aa33.7■■■□□ 2.99
PTPN18-215ENST00000490812 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.69■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 A2MP01023 1474 aa33.67■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.67■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.66■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.65■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.65■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
PTPN18-215ENST00000490812 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.63■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 C3P01024 1663 aa33.62■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.62■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.59■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 MROH2AA6NES4 1674 aa33.58■■■□□ 2.97
PTPN18-215ENST00000490812 HSPA2P54652 639 aa33.55■■■□□ 2.96
PTPN18-215ENST00000490812 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.52■■■□□ 2.96
PTPN18-215ENST00000490812 MIA2Q96PC5 1412 aa33.52■■■□□ 2.96
PTPN18-215ENST00000490812 APLP2Q06481 763 aa33.51■■■□□ 2.95
PTPN18-215ENST00000490812 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.51■■■□□ 2.95
PTPN18-215ENST00000490812 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
PTPN18-215ENST00000490812 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
PTPN18-215ENST00000490812 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.46■■■□□ 2.95
PTPN18-215ENST00000490812 TSPY4P0CV99 314 aa33.44■■■□□ 2.94
PTPN18-215ENST00000490812 TSPY10P0CW01 314 aa33.44■■■□□ 2.94
PTPN18-215ENST00000490812 ZMYM3Q14202 1370 aa33.44■■■□□ 2.94
PTPN18-215ENST00000490812 NPATQ14207 1427 aa33.44■■■□□ 2.94
PTPN18-215ENST00000490812 GGT6Q6P531 493 aa33.43■■■□□ 2.94
PTPN18-215ENST00000490812 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.42■■■□□ 2.94
PTPN18-215ENST00000490812 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
PTPN18-215ENST00000490812 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.36■■■□□ 2.93
PTPN18-215ENST00000490812 KIF3BO15066 747 aa33.32■■■□□ 2.92
PTPN18-215ENST00000490812 STRCQ7RTU9 1775 aa33.31■■■□□ 2.92
PTPN18-215ENST00000490812 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.31■■■□□ 2.92
PTPN18-215ENST00000490812 PTPRKQ15262 1439 aa33.29■■■□□ 2.92
PTPN18-215ENST00000490812 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.28■■■□□ 2.92
PTPN18-215ENST00000490812 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.26■■■□□ 2.91
PTPN18-215ENST00000490812 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.25■■■□□ 2.91
PTPN18-215ENST00000490812 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.25■■■□□ 2.91
PTPN18-215ENST00000490812 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.25■■■□□ 2.91
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