RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGRL1O94910 1474 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRVP-202ENST00000490575 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRVP-202ENST00000490575 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRVP-202ENST00000490575 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC1P33527 1531 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 MAP3K1Q13233 1512 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 NCOA2Q15596 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 AFAP1Q8N556 730 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM5CP41229 1560 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PTPRVP-202ENST00000490575 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRVP-202ENST00000490575 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRVP-202ENST00000490575 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRVP-202ENST00000490575 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.715e-6■■■■□ 20.3
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRVP-202ENST00000490575 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRVP-202ENST00000490575 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRVP-202ENST00000490575 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRVP-202ENST00000490575 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCA6Q8N139 1617 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRVP-202ENST00000490575 MBD5Q9P267 1494 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 ATP10AO60312 1499 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRVP-202ENST00000490575 APLP2Q06481 763 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 MADDQ8WXG6 1647 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRVP-202ENST00000490575 ATP7AQ04656 1500 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 MLECQ14165 292 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 REREQ9P2R6 1566 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 MIA2Q96PC5 1412 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRMP28827 1452 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 PLXNC1O60486 1568 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 AGLP35573 1532 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRVP-202ENST00000490575 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRVP-202ENST00000490575 A2MP01023 1474 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRVP-202ENST00000490575 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PTPRVP-202ENST00000490575 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC5O15440 1437 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRVP-202ENST00000490575 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRVP-202ENST00000490575 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 DAPK1P53355 1430 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 TSPY4P0CV99 314 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 TSPY10P0CW01 314 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRVP-202ENST00000490575 C3P01024 1663 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRVP-202ENST00000490575 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRVP-202ENST00000490575 GGT6Q6P531 493 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRKQ15262 1439 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRVP-202ENST00000490575 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRVP-202ENST00000490575 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF3BO15066 747 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRVP-202ENST00000490575 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRVP-202ENST00000490575 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 MROH2AA6NES4 1674 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF15Q9NS87 1388 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 NCOA1Q15788 1441 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 ZMYM3Q14202 1370 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRVP-202ENST00000490575 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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