RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.55■■■□□ 2.96
HOXD10-202ENST00000490088 NEO1Q92859 1461 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXD10-202ENST00000490088 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXD10-202ENST00000490088 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXD10-202ENST00000490088 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXD10-202ENST00000490088 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
HOXD10-202ENST00000490088 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.48■■■□□ 2.95
HOXD10-202ENST00000490088 AKNAQ7Z591 1439 aa33.47■■■□□ 2.95
HOXD10-202ENST00000490088 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.45■■■□□ 2.95
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HOXD10-202ENST00000490088 ADGRL1O94910 1474 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD10-202ENST00000490088 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
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HOXD10-202ENST00000490088 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
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HOXD10-202ENST00000490088 MIA2Q96PC5 1412 aa33.35■■■□□ 2.93
HOXD10-202ENST00000490088 ABCC1P33527 1531 aa33.34■■■□□ 2.93
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HOXD10-202ENST00000490088 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.28■■■□□ 2.92
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HOXD10-202ENST00000490088 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXD10-202ENST00000490088 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXD10-202ENST00000490088 DAPK1P53355 1430 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXD10-202ENST00000490088 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXD10-202ENST00000490088 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
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HOXD10-202ENST00000490088 TSPY10P0CW01 314 aa32.99■■■□□ 2.87
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HOXD10-202ENST00000490088 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.93■■■□□ 2.86
HOXD10-202ENST00000490088 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.92■■■□□ 2.86
HOXD10-202ENST00000490088 ABCA6Q8N139 1617 aa32.92■■■□□ 2.86
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HOXD10-202ENST00000490088 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
HOXD10-202ENST00000490088 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
HOXD10-202ENST00000490088 ROCK1Q13464 1354 aa32.7■■■□□ 2.83
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HOXD10-202ENST00000490088 AGLP35573 1532 aa32.66■■■□□ 2.82
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HOXD10-202ENST00000490088 ERBINQ96RT1 1412 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD10-202ENST00000490088 KIF3BO15066 747 aa32.58■■■□□ 2.81
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HOXD10-202ENST00000490088 HFM1A2PYH4 1435 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXD10-202ENST00000490088 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
HOXD10-202ENST00000490088 GGT6Q6P531 493 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXD10-202ENST00000490088 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD10-202ENST00000490088 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
HOXD10-202ENST00000490088 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXD10-202ENST00000490088 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.43■■■□□ 2.78
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