RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.71■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.71■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.7■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.69■■■■□ 3.46
POLR2F-211ENST00000488684 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.68■■■■□ 3.46
POLR2F-211ENST00000488684 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.63■■■■□ 3.45
POLR2F-211ENST00000488684 CLIP1P30622 1438 aa36.62■■■■□ 3.45
POLR2F-211ENST00000488684 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
POLR2F-211ENST00000488684 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.57■■■■□ 3.44
POLR2F-211ENST00000488684 MLECQ14165 292 aa36.54■■■■□ 3.44
POLR2F-211ENST00000488684 AFAP1Q8N556 730 aa36.53■■■■□ 3.44
POLR2F-211ENST00000488684 ATP10AO60312 1499 aa36.53■■■■□ 3.44
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.53■■■■□ 3.44
POLR2F-211ENST00000488684 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.51■■■■□ 3.44
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR2F-211ENST00000488684 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.49■■■■□ 3.43
POLR2F-211ENST00000488684 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.47■■■■□ 3.43
POLR2F-211ENST00000488684 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.46■■■■□ 3.43
POLR2F-211ENST00000488684 KDM5CP41229 1560 aa36.44■■■■□ 3.42
POLR2F-211ENST00000488684 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.44■■■■□ 3.42
POLR2F-211ENST00000488684 PREX2Q70Z35 1606 aa36.42■■■■□ 3.42
POLR2F-211ENST00000488684 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.4■■■■□ 3.42
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.39■■■■□ 3.42
POLR2F-211ENST00000488684 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.36■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.36■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC1P33527 1531 aa36.34■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.34■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 HSPA2P54652 639 aa36.34■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.32■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.32■■■■□ 3.41
POLR2F-211ENST00000488684 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.29■■■■□ 3.4
POLR2F-211ENST00000488684 ABCA6Q8N139 1617 aa36.27■■■■□ 3.4
POLR2F-211ENST00000488684 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
POLR2F-211ENST00000488684 REREQ9P2R6 1566 aa36.24■■■■□ 3.39
POLR2F-211ENST00000488684 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
POLR2F-211ENST00000488684 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.2■■■■□ 3.38
POLR2F-211ENST00000488684 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.19■■■■□ 3.38
POLR2F-211ENST00000488684 AGLP35573 1532 aa36.15■■■■□ 3.38
POLR2F-211ENST00000488684 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.38
POLR2F-211ENST00000488684 FBXO41Q8TF61 875 aa36.14■■■■□ 3.38
POLR2F-211ENST00000488684 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.13■■■■□ 3.37
POLR2F-211ENST00000488684 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
POLR2F-211ENST00000488684 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.11■■■■□ 3.37
POLR2F-211ENST00000488684 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.09■■■■□ 3.37
POLR2F-211ENST00000488684 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.09■■■■□ 3.37
POLR2F-211ENST00000488684 CEP162Q5TB80 1403 aa36.07■■■■□ 3.36
POLR2F-211ENST00000488684 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.05■■■■□ 3.36
POLR2F-211ENST00000488684 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
POLR2F-211ENST00000488684 C3P01024 1663 aa36.01■■■■□ 3.36
POLR2F-211ENST00000488684 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.97■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 ATP7AQ04656 1500 aa35.96■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 TIAM1Q13009 1591 aa35.96■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.95■■■■□ 3.35
POLR2F-211ENST00000488684 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
POLR2F-211ENST00000488684 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.91■■■■□ 3.34
POLR2F-211ENST00000488684 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
POLR2F-211ENST00000488684 STRCQ7RTU9 1775 aa35.89■■■■□ 3.34
POLR2F-211ENST00000488684 A2MP01023 1474 aa35.87■■■■□ 3.33
POLR2F-211ENST00000488684 MBD5Q9P267 1494 aa35.86■■■■□ 3.33
POLR2F-211ENST00000488684 PLXNC1O60486 1568 aa35.86■■■■□ 3.33
POLR2F-211ENST00000488684 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.85■■■■□ 3.33
POLR2F-211ENST00000488684 CERKQ8TCT0 537 aa35.85■■■■□ 3.33
POLR2F-211ENST00000488684 ZMYM3Q14202 1370 aa35.82■■■■□ 3.32
POLR2F-211ENST00000488684 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.8■■■■□ 3.32
POLR2F-211ENST00000488684 MROH2AA6NES4 1674 aa35.8■■■■□ 3.32
POLR2F-211ENST00000488684 NCOA2Q15596 1464 aa35.79■■■■□ 3.32
POLR2F-211ENST00000488684 GGT6Q6P531 493 aa35.77■■■■□ 3.32
POLR2F-211ENST00000488684 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.75■■■■□ 3.31
POLR2F-211ENST00000488684 NPATQ14207 1427 aa35.74■■■■□ 3.31
POLR2F-211ENST00000488684 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
POLR2F-211ENST00000488684 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.74■■■■□ 3.31
POLR2F-211ENST00000488684 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.68■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.67■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRTO14522 1441 aa35.67■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.66■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.65■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 NCOA1Q15788 1441 aa35.65■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRKQ15262 1439 aa35.64■■■■□ 3.3
POLR2F-211ENST00000488684 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.62■■■■□ 3.29
POLR2F-211ENST00000488684 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.62■■■■□ 3.29
POLR2F-211ENST00000488684 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.59■■■■□ 3.29
POLR2F-211ENST00000488684 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
POLR2F-211ENST00000488684 KIF3BO15066 747 aa35.56■■■■□ 3.28
POLR2F-211ENST00000488684 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.54■■■■□ 3.28
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.54■■■■□ 3.28
POLR2F-211ENST00000488684 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.52■■■■□ 3.28
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K1Q13233 1512 aa35.49■■■■□ 3.27
POLR2F-211ENST00000488684 TSPY4P0CV99 314 aa35.49■■■■□ 3.27
POLR2F-211ENST00000488684 TSPY10P0CW01 314 aa35.49■■■■□ 3.27
POLR2F-211ENST00000488684 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
POLR2F-211ENST00000488684 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.49■■■■□ 3.27
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