RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487621.5

SEMA3C-209, Transcript of semaphorin 3C, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3C, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3C-209ENST00000487621 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.36■■■■■ 4.05
SEMA3C-209ENST00000487621 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.35■■■■■ 4.05
SEMA3C-209ENST00000487621 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.35■■■■■ 4.05
SEMA3C-209ENST00000487621 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.35■■■■■ 4.05
SEMA3C-209ENST00000487621 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.34■■■■■ 4.05
SEMA3C-209ENST00000487621 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.32■■■■■ 4.05
SEMA3C-209ENST00000487621 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
SEMA3C-209ENST00000487621 PTPRMP28827 1452 aa40.31■■■■■ 4.04
SEMA3C-209ENST00000487621 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.26■■■■■ 4.04
SEMA3C-209ENST00000487621 MADDQ8WXG6 1647 aa40.24■■■■■ 4.03
SEMA3C-209ENST00000487621 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.23■■■■■ 4.03
SEMA3C-209ENST00000487621 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.19■■■■■ 4.02
SEMA3C-209ENST00000487621 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.17■■■■■ 4.02
SEMA3C-209ENST00000487621 PREX2Q70Z35 1606 aa40.16■■■■■ 4.02
SEMA3C-209ENST00000487621 KDM5CP41229 1560 aa40.14■■■■■ 4.02
SEMA3C-209ENST00000487621 AFAP1Q8N556 730 aa40.13■■■■■ 4.01
SEMA3C-209ENST00000487621 ATP10AO60312 1499 aa40.13■■■■■ 4.01
SEMA3C-209ENST00000487621 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.08■■■■■ 4.01
SEMA3C-209ENST00000487621 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.08■■■■■ 4.01
SEMA3C-209ENST00000487621 ABCC1P33527 1531 aa40.06■■■■■ 4
SEMA3C-209ENST00000487621 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
SEMA3C-209ENST00000487621 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.05■■■■■ 4
SEMA3C-209ENST00000487621 CEP162Q5TB80 1403 aa40.04■■■■■ 4
SEMA3C-209ENST00000487621 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.02■■■■■ 4
SEMA3C-209ENST00000487621 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
SEMA3C-209ENST00000487621 MLH3Q9UHC1 1453 aa40■■■■□ 3.99
SEMA3C-209ENST00000487621 MLECQ14165 292 aa39.98■■■■□ 3.99
SEMA3C-209ENST00000487621 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.96■■■■□ 3.99
SEMA3C-209ENST00000487621 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.96■■■■□ 3.99
SEMA3C-209ENST00000487621 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.9■■■■□ 3.98
SEMA3C-209ENST00000487621 REREQ9P2R6 1566 aa39.9■■■■□ 3.98
SEMA3C-209ENST00000487621 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.9■■■■□ 3.98
SEMA3C-209ENST00000487621 ABCA6Q8N139 1617 aa39.9■■■■□ 3.98
SEMA3C-209ENST00000487621 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.89■■■■□ 3.98
SEMA3C-209ENST00000487621 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.87■■■■□ 3.97
SEMA3C-209ENST00000487621 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.86■■■■□ 3.97
SEMA3C-209ENST00000487621 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
SEMA3C-209ENST00000487621 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.83■■■■□ 3.97
SEMA3C-209ENST00000487621 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.82■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.81■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.8■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.8■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.8■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 AGLP35573 1532 aa39.79■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.78■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
SEMA3C-209ENST00000487621 TIAM1Q13009 1591 aa39.74■■■■□ 3.95
SEMA3C-209ENST00000487621 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.74■■■■□ 3.95
SEMA3C-209ENST00000487621 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
SEMA3C-209ENST00000487621 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
SEMA3C-209ENST00000487621 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
SEMA3C-209ENST00000487621 HSPA2P54652 639 aa39.64■■■■□ 3.94
SEMA3C-209ENST00000487621 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
SEMA3C-209ENST00000487621 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.62■■■■□ 3.93
SEMA3C-209ENST00000487621 ATP7AQ04656 1500 aa39.61■■■■□ 3.93
SEMA3C-209ENST00000487621 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
SEMA3C-209ENST00000487621 MBD5Q9P267 1494 aa39.6■■■■□ 3.93
SEMA3C-209ENST00000487621 NCOA2Q15596 1464 aa39.58■■■■□ 3.93
SEMA3C-209ENST00000487621 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
SEMA3C-209ENST00000487621 PLXNC1O60486 1568 aa39.52■■■■□ 3.92
SEMA3C-209ENST00000487621 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.51■■■■□ 3.92
SEMA3C-209ENST00000487621 A2MP01023 1474 aa39.49■■■■□ 3.91
SEMA3C-209ENST00000487621 C3P01024 1663 aa39.49■■■■□ 3.91
SEMA3C-209ENST00000487621 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.48■■■■□ 3.91
SEMA3C-209ENST00000487621 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.46■■■■□ 3.91
SEMA3C-209ENST00000487621 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
SEMA3C-209ENST00000487621 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.43■■■■□ 3.9
SEMA3C-209ENST00000487621 MAP3K1Q13233 1512 aa39.41■■■■□ 3.9
SEMA3C-209ENST00000487621 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.41■■■■□ 3.9
SEMA3C-209ENST00000487621 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.4■■■■□ 3.9
SEMA3C-209ENST00000487621 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
SEMA3C-209ENST00000487621 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.36■■■■□ 3.89
SEMA3C-209ENST00000487621 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
SEMA3C-209ENST00000487621 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.36■■■■□ 3.89
SEMA3C-209ENST00000487621 MROH2AA6NES4 1674 aa39.34■■■■□ 3.89
SEMA3C-209ENST00000487621 ZMYM3Q14202 1370 aa39.33■■■■□ 3.89
SEMA3C-209ENST00000487621 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.32■■■■□ 3.89
SEMA3C-209ENST00000487621 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
SEMA3C-209ENST00000487621 NPATQ14207 1427 aa39.28■■■■□ 3.88
SEMA3C-209ENST00000487621 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.27■■■■□ 3.88
SEMA3C-209ENST00000487621 GGT6Q6P531 493 aa39.27■■■■□ 3.88
SEMA3C-209ENST00000487621 FBXO41Q8TF61 875 aa39.26■■■■□ 3.88
SEMA3C-209ENST00000487621 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.24■■■■□ 3.87
SEMA3C-209ENST00000487621 STRCQ7RTU9 1775 aa39.23■■■■□ 3.87
SEMA3C-209ENST00000487621 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
SEMA3C-209ENST00000487621 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.17■■■■□ 3.86
SEMA3C-209ENST00000487621 PTPRKQ15262 1439 aa39.16■■■■□ 3.86
SEMA3C-209ENST00000487621 MIA2Q96PC5 1412 aa39.16■■■■□ 3.86
SEMA3C-209ENST00000487621 TSPY4P0CV99 314 aa39.13■■■■□ 3.85
SEMA3C-209ENST00000487621 TSPY10P0CW01 314 aa39.13■■■■□ 3.85
SEMA3C-209ENST00000487621 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.12■■■■□ 3.85
SEMA3C-209ENST00000487621 KIF3BO15066 747 aa39.11■■■■□ 3.85
SEMA3C-209ENST00000487621 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.08■■■■□ 3.85
SEMA3C-209ENST00000487621 NCOA1Q15788 1441 aa39.07■■■■□ 3.85
SEMA3C-209ENST00000487621 PTPRTO14522 1441 aa39.06■■■■□ 3.84
SEMA3C-209ENST00000487621 CERKQ8TCT0 537 aa39.04■■■■□ 3.84
SEMA3C-209ENST00000487621 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.03■■■■□ 3.84
SEMA3C-209ENST00000487621 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.02■■■■□ 3.84
SEMA3C-209ENST00000487621 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms