RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486587.1

LRSAM1-208, Transcript of leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1, human

TSL 3

Gene LRSAM1, Length 827 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRSAM1-208	ENST00000486587	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.17	■■■□□ 2.26
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.15	■■■□□ 2.26
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.15	■■■□□ 2.26
LRSAM1-208	ENST00000486587	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		29.15	■■■□□ 2.26
LRSAM1-208	ENST00000486587	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.15	■■■□□ 2.26
LRSAM1-208	ENST00000486587	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		29.13	■■■□□ 2.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.13	■■■□□ 2.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.13	■■■□□ 2.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.11	■■■□□ 2.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.06	■■■□□ 2.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	PTPRM	P28827	1452 aa		29.04	■■■□□ 2.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		29.04	■■■□□ 2.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.01	■■■□□ 2.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29	■■■□□ 2.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.99	■■■□□ 2.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	ABCC1	P33527	1531 aa		28.99	■■■□□ 2.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	KDM5C	P41229	1560 aa		28.98	■■■□□ 2.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.97	■■■□□ 2.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.94	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.93	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.91	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.91	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.9	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.89	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	MLEC	Q14165	292 aa		28.89	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.89	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ATP10A	O60312	1499 aa		28.89	■■■□□ 2.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.88	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.83	■■■□□ 2.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
LRSAM1-208	ENST00000486587	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LRSAM1-208	ENST00000486587	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LRSAM1-208	ENST00000486587	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LRSAM1-208	ENST00000486587	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.77	■■■□□ 2.2
LRSAM1-208	ENST00000486587	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.75	■■■□□ 2.19
LRSAM1-208	ENST00000486587	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.75	■■■□□ 2.19
LRSAM1-208	ENST00000486587	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.67	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.66	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.65	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.64	■■■□□ 2.18
LRSAM1-208	ENST00000486587	AGL	P35573	1532 aa		28.64	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.62	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.61	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.6	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	HSPA2	P54652	639 aa		28.6	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	C3	P01024	1663 aa		28.6	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LRSAM1-208	ENST00000486587	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LRSAM1-208	ENST00000486587	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LRSAM1-208	ENST00000486587	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.51	■■■□□ 2.16
LRSAM1-208	ENST00000486587	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
LRSAM1-208	ENST00000486587	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LRSAM1-208	ENST00000486587	A2M	P01023	1474 aa		28.49	■■■□□ 2.15
LRSAM1-208	ENST00000486587	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
LRSAM1-208	ENST00000486587	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.45	■■■□□ 2.14
LRSAM1-208	ENST00000486587	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.45	■■■□□ 2.14
LRSAM1-208	ENST00000486587	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
LRSAM1-208	ENST00000486587	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.42	■■■□□ 2.14
LRSAM1-208	ENST00000486587	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.41	■■■□□ 2.14
LRSAM1-208	ENST00000486587	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
LRSAM1-208	ENST00000486587	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.13
LRSAM1-208	ENST00000486587	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.38	■■■□□ 2.13
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.37	■■■□□ 2.13
LRSAM1-208	ENST00000486587	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.36	■■■□□ 2.13
LRSAM1-208	ENST00000486587	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.35	■■■□□ 2.13
LRSAM1-208	ENST00000486587	GGT6	Q6P531	493 aa		28.32	■■■□□ 2.12
LRSAM1-208	ENST00000486587	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.29	■■■□□ 2.12
LRSAM1-208	ENST00000486587	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.29	■■■□□ 2.12
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.28	■■■□□ 2.12
LRSAM1-208	ENST00000486587	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
LRSAM1-208	ENST00000486587	NPAT	Q14207	1427 aa		28.25	■■■□□ 2.11
LRSAM1-208	ENST00000486587	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.24	■■■□□ 2.11
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
LRSAM1-208	ENST00000486587	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.21	■■■□□ 2.11
LRSAM1-208	ENST00000486587	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.21	■■■□□ 2.11
LRSAM1-208	ENST00000486587	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.2	■■■□□ 2.11
LRSAM1-208	ENST00000486587	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.19	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.19	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	KIF3B	O15066	747 aa		28.19	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.18	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	APLP2	Q06481	763 aa		28.17	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.16	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.15	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.15	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.15	■■■□□ 2.1

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