RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486100.1

PRPF40A-209, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 4

Gene PRPF40A, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-209ENST00000486100 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.54■■■□□ 2.32
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PRPF40A-209ENST00000486100 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.52■■■□□ 2.32
PRPF40A-209ENST00000486100 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.51■■■□□ 2.32
PRPF40A-209ENST00000486100 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.48■■■□□ 2.31
PRPF40A-209ENST00000486100 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.47■■■□□ 2.31
PRPF40A-209ENST00000486100 AFAP1Q8N556 730 aa29.46■■■□□ 2.31
PRPF40A-209ENST00000486100 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.45■■■□□ 2.31
PRPF40A-209ENST00000486100 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.42■■■□□ 2.3
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PRPF40A-209ENST00000486100 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.4■■■□□ 2.3
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PRPF40A-209ENST00000486100 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.37■■■□□ 2.29
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PRPF40A-209ENST00000486100 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.34■■■□□ 2.29
PRPF40A-209ENST00000486100 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.34■■■□□ 2.29
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PRPF40A-209ENST00000486100 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.33■■■□□ 2.29
PRPF40A-209ENST00000486100 KDM5CP41229 1560 aa29.32■■■□□ 2.28
PRPF40A-209ENST00000486100 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.31■■■□□ 2.28
PRPF40A-209ENST00000486100 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.31■■■□□ 2.28
PRPF40A-209ENST00000486100 ABCC1P33527 1531 aa29.3■■■□□ 2.28
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PRPF40A-209ENST00000486100 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.29■■■□□ 2.28
PRPF40A-209ENST00000486100 MADDQ8WXG6 1647 aa29.27■■■□□ 2.28
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PRPF40A-209ENST00000486100 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.24■■■□□ 2.27
PRPF40A-209ENST00000486100 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.23■■■□□ 2.27
PRPF40A-209ENST00000486100 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.22■■■□□ 2.27
PRPF40A-209ENST00000486100 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.21■■■□□ 2.27
PRPF40A-209ENST00000486100 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.21■■■□□ 2.27
PRPF40A-209ENST00000486100 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.2■■■□□ 2.26
PRPF40A-209ENST00000486100 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.18■■■□□ 2.26
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PRPF40A-209ENST00000486100 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.16■■■□□ 2.26
PRPF40A-209ENST00000486100 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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PRPF40A-209ENST00000486100 TIAM1Q13009 1591 aa29.14■■■□□ 2.26
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PRPF40A-209ENST00000486100 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.96■■■□□ 2.23
PRPF40A-209ENST00000486100 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
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PRPF40A-209ENST00000486100 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.9■■■□□ 2.22
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PRPF40A-209ENST00000486100 TSPY10P0CW01 314 aa28.89■■■□□ 2.22
PRPF40A-209ENST00000486100 PLXNC1O60486 1568 aa28.87■■■□□ 2.21
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PRPF40A-209ENST00000486100 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.84■■■□□ 2.21
PRPF40A-209ENST00000486100 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.81■■■□□ 2.2
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PRPF40A-209ENST00000486100 KIF3BO15066 747 aa28.76■■■□□ 2.19
PRPF40A-209ENST00000486100 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
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PRPF40A-209ENST00000486100 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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PRPF40A-209ENST00000486100 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.66■■■□□ 2.18
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PRPF40A-209ENST00000486100 PTPRKQ15262 1439 aa28.63■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.63■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.63■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.63■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 ABCC5O15440 1437 aa28.6■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.6■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PRPF40A-209ENST00000486100 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.55■■■□□ 2.16
PRPF40A-209ENST00000486100 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.54■■■□□ 2.16
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