RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP51.71■■■■■ 5.87
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP5Q13017 1502 aa51.7■■■■■ 5.87
CHKB-210ENST00000484266 AKNAQ7Z591 1439 aa51.68■■■■■ 5.86
CHKB-210ENST00000484266 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP51.65■■■■■ 5.86
CHKB-210ENST00000484266 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa51.64■■■■■ 5.86
CHKB-210ENST00000484266 NCOA2Q15596 1464 aa51.63■■■■■ 5.86
CHKB-210ENST00000484266 CCNB3Q8WWL7 1395 aa51.61■■■■■ 5.85
CHKB-210ENST00000484266 ADGRL1O94910 1474 aa51.54■■■■■ 5.84
CHKB-210ENST00000484266 ITSN2Q9NZM3 1697 aa51.54■■■■■ 5.84
CHKB-210ENST00000484266 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa51.49■■■■■ 5.83
CHKB-210ENST00000484266 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP51.48■■■■■ 5.83
CHKB-210ENST00000484266 RICTORQ6R327 1708 aa51.47■■■■■ 5.83
CHKB-210ENST00000484266 SCAPERQ9BY12 1400 aa51.45■■■■■ 5.83
CHKB-210ENST00000484266 RAPGEF3O95398 923 aa51.45■■■■■ 5.83
CHKB-210ENST00000484266 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP51.42■■■■■ 5.82
CHKB-210ENST00000484266 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa51.42■■■■■ 5.82
CHKB-210ENST00000484266 ABCC1P33527 1531 aa51.41■■■■■ 5.82
CHKB-210ENST00000484266 POGZQ7Z3K3 1410 aa51.36■■■■■ 5.81
CHKB-210ENST00000484266 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP51.35■■■■■ 5.81
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa51.31■■■■■ 5.8
CHKB-210ENST00000484266 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa51.26■■■■■ 5.8
CHKB-210ENST00000484266 MYOM3Q5VTT5 1437 aa51.24■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 SYCP2Q9BX26 1530 aa51.24■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa51.24■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa51.23■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa51.2■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP51.2■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa51.2■■■■■ 5.79
CHKB-210ENST00000484266 KDM5CP41229 1560 aa51.19■■■■■ 5.78
CHKB-210ENST00000484266 AFAP1Q8N556 730 aa51.15■■■■■ 5.78
CHKB-210ENST00000484266 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa51.15■■■■■ 5.78
CHKB-210ENST00000484266 MIA2Q96PC5 1412 aa51.13■■■■■ 5.78
CHKB-210ENST00000484266 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP51.12■■■■■ 5.77
CHKB-210ENST00000484266 MAGI2Q86UL8 1455 aa51.1■■■■■ 5.77
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa51.08■■■■■ 5.77
CHKB-210ENST00000484266 MBD5Q9P267 1494 aa51.06■■■■■ 5.76
CHKB-210ENST00000484266 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa51.06■■■■■ 5.76
CHKB-210ENST00000484266 HECW2Q9P2P5 1572 aa51.04■■■■■ 5.76
CHKB-210ENST00000484266 YEATS2Q9ULM3 1422 aa51.03■■■■■ 5.76
CHKB-210ENST00000484266 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP51.03■■■■■ 5.76
CHKB-210ENST00000484266 FGD6Q6ZV73 1430 aa50.99■■■■■ 5.75
CHKB-210ENST00000484266 MLH3Q9UHC1 1453 aa50.98■■■■■ 5.75
CHKB-210ENST00000484266 PTPN23Q9H3S7 1636 aa50.97■■■■■ 5.75
CHKB-210ENST00000484266 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa50.93■■■■■ 5.74
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF5Q12774 1597 aa50.92■■■■■ 5.74
CHKB-210ENST00000484266 CCDC141Q6ZP82 1450 aa50.89■■■■■ 5.74
CHKB-210ENST00000484266 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP50.87■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 ABCA6Q8N139 1617 aa50.86■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP50.86■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP50.86■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 MYT1LQ9UL68 1186 aa50.86■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa50.85■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 RSPH4AQ5TD94 716 aa50.83■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 ATP7AQ04656 1500 aa50.82■■■■■ 5.73
CHKB-210ENST00000484266 ATP10AO60312 1499 aa50.81■■■■■ 5.72
CHKB-210ENST00000484266 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa50.78■■■■■ 5.72
CHKB-210ENST00000484266 C9orf84Q5VXU9 1444 aa50.76■■■■■ 5.72
CHKB-210ENST00000484266 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa50.71■■■■■ 5.71
CHKB-210ENST00000484266 REREQ9P2R6 1566 aa50.69■■■■■ 5.71
CHKB-210ENST00000484266 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
CHKB-210ENST00000484266 CROCC2H7BZ55 1655 aa50.66■■■■■ 5.7
CHKB-210ENST00000484266 MAST1Q9Y2H9 1570 aa50.65■■■■■ 5.7
CHKB-210ENST00000484266 TSPY4P0CV99 314 aa50.63■■■■■ 5.7
CHKB-210ENST00000484266 TSPY10P0CW01 314 aa50.63■■■■■ 5.7
CHKB-210ENST00000484266 ABCC5O15440 1437 aa50.63■■■■■ 5.7
CHKB-210ENST00000484266 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP50.61■■■■■ 5.69
CHKB-210ENST00000484266 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
CHKB-210ENST00000484266 DAPK1P53355 1430 aa50.6■■■■■ 5.69
CHKB-210ENST00000484266 ADGBQ8N7X0 1667 aa50.59■■■■■ 5.69
CHKB-210ENST00000484266 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa50.59■■■■■ 5.69
CHKB-210ENST00000484266 BCORL1Q5H9F3 1711 aa50.58■■■■■ 5.69
CHKB-210ENST00000484266 SHANK2Q9UPX8 1470 aa50.56■■■■■ 5.68
CHKB-210ENST00000484266 PLXNC1O60486 1568 aa50.51■■■■■ 5.68
CHKB-210ENST00000484266 A2MP01023 1474 aa50.51■■■■■ 5.68
CHKB-210ENST00000484266 AGLP35573 1532 aa50.51■■■■■ 5.68
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTSL3P82987 1691 aa50.48■■■■■ 5.67
CHKB-210ENST00000484266 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP50.47■■■■■ 5.67
CHKB-210ENST00000484266 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP50.44■■■■■ 5.67
CHKB-210ENST00000484266 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP50.38■■■■■ 5.66
CHKB-210ENST00000484266 MLECQ14165 292 aa50.36■■■■■ 5.65
CHKB-210ENST00000484266 MADDQ8WXG6 1647 aa50.35■■■■■ 5.65
CHKB-210ENST00000484266 CHIC2Q9UKJ5 165 aa50.3■■■■■ 5.64
CHKB-210ENST00000484266 PTPRKQ15262 1439 aa50.3■■■■■ 5.64
CHKB-210ENST00000484266 ADGRL2O95490 1459 aa50.28■■■■■ 5.64
CHKB-210ENST00000484266 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa50.27■■■■■ 5.64
CHKB-210ENST00000484266 KIF15Q9NS87 1388 aa50.25■■■■■ 5.64
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa50.24■■■■■ 5.63
CHKB-210ENST00000484266 DUOX2Q9NRD8 1548 aa50.24■■■■■ 5.63
CHKB-210ENST00000484266 NCOA1Q15788 1441 aa50.23■■■■■ 5.63
CHKB-210ENST00000484266 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP50.22■■■■■ 5.63
CHKB-210ENST00000484266 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa50.21■■■■■ 5.63
CHKB-210ENST00000484266 ITGAEP38570 1179 aa50.16■■■■■ 5.62
CHKB-210ENST00000484266 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
CHKB-210ENST00000484266 KIF3BO15066 747 aa50.12■■■■■ 5.61
CHKB-210ENST00000484266 PTPRMP28827 1452 aa50.12■■■■■ 5.61
CHKB-210ENST00000484266 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP50.1■■■■■ 5.61
CHKB-210ENST00000484266 ERBINQ96RT1 1412 aa50.09■■■■■ 5.61
CHKB-210ENST00000484266 ROCK1Q13464 1354 aa50.08■■■■■ 5.61
CHKB-210ENST00000484266 GGT6Q6P531 493 aa50.08■■■■■ 5.61
CHKB-210ENST00000484266 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms