RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483962.1

SNED1-210, Transcript of sushi, nidogen and EGF like domains 1, humanhuman

TSL 2

Gene SNED1, Length 938 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1-210ENST00000483962 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.49■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.48■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.47■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.47■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 AKNAQ7Z591 1439 aa30.47■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.46■■■□□ 2.47
SNED1-210ENST00000483962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.4■■■□□ 2.46
SNED1-210ENST00000483962 ADGRL1O94910 1474 aa30.37■■■□□ 2.45
SNED1-210ENST00000483962 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SNED1-210ENST00000483962 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.34■■■□□ 2.45
SNED1-210ENST00000483962 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.33■■■□□ 2.45
SNED1-210ENST00000483962 RAPGEF3O95398 923 aa30.33■■■□□ 2.45
SNED1-210ENST00000483962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.32■■■□□ 2.45
SNED1-210ENST00000483962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 RICTORQ6R327 1708 aa30.31■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 ABCC1P33527 1531 aa30.3■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.28■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.28■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SNED1-210ENST00000483962 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.25■■■□□ 2.43
SNED1-210ENST00000483962 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
SNED1-210ENST00000483962 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.21■■■□□ 2.43
SNED1-210ENST00000483962 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.21■■■□□ 2.43
SNED1-210ENST00000483962 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.21■■■□□ 2.43
SNED1-210ENST00000483962 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
SNED1-210ENST00000483962 MIA2Q96PC5 1412 aa30.2■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.19■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 AFAP1Q8N556 730 aa30.18■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.18■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.17■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 KDM5CP41229 1560 aa30.15■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.14■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 MBD5Q9P267 1494 aa30.14■■■□□ 2.42
SNED1-210ENST00000483962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.12■■■□□ 2.41
SNED1-210ENST00000483962 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.07■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.07■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.07■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.06■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.06■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.05■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.05■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.03■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
SNED1-210ENST00000483962 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.99■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.99■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 ABCA6Q8N139 1617 aa29.97■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 ATP7AQ04656 1500 aa29.96■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.96■■■□□ 2.39
SNED1-210ENST00000483962 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 ATP10AO60312 1499 aa29.93■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 ABCC5O15440 1437 aa29.92■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.91■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.91■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.91■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 DAPK1P53355 1430 aa29.89■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 TSPY4P0CV99 314 aa29.89■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 TSPY10P0CW01 314 aa29.89■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.89■■■□□ 2.38
SNED1-210ENST00000483962 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.88■■■□□ 2.37
SNED1-210ENST00000483962 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SNED1-210ENST00000483962 REREQ9P2R6 1566 aa29.84■■■□□ 2.37
SNED1-210ENST00000483962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.83■■■□□ 2.37
SNED1-210ENST00000483962 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
SNED1-210ENST00000483962 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.82■■■□□ 2.36
SNED1-210ENST00000483962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
SNED1-210ENST00000483962 A2MP01023 1474 aa29.78■■■□□ 2.36
SNED1-210ENST00000483962 PTPRKQ15262 1439 aa29.77■■■□□ 2.36
SNED1-210ENST00000483962 PLXNC1O60486 1568 aa29.77■■■□□ 2.36
SNED1-210ENST00000483962 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.76■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.75■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 AGLP35573 1532 aa29.75■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.73■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 ITGAEP38570 1179 aa29.71■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 ADGRL2O95490 1459 aa29.7■■■□□ 2.35
SNED1-210ENST00000483962 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.69■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 MLECQ14165 292 aa29.68■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.68■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 NCOA1Q15788 1441 aa29.68■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.67■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 KIF15Q9NS87 1388 aa29.67■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.65■■■□□ 2.34
SNED1-210ENST00000483962 MADDQ8WXG6 1647 aa29.61■■■□□ 2.33
SNED1-210ENST00000483962 ROCK1Q13464 1354 aa29.6■■■□□ 2.33
SNED1-210ENST00000483962 KIF3BO15066 747 aa29.58■■■□□ 2.33
SNED1-210ENST00000483962 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SNED1-210ENST00000483962 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.57■■■□□ 2.32
SNED1-210ENST00000483962 ERBINQ96RT1 1412 aa29.54■■■□□ 2.32
SNED1-210ENST00000483962 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SNED1-210ENST00000483962 GGT6Q6P531 493 aa29.54■■■□□ 2.32
SNED1-210ENST00000483962 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SNED1-210ENST00000483962 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.48■■■□□ 2.31
SNED1-210ENST00000483962 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.48■■■□□ 2.31
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