RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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ATG4B-221ENST00000483778 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ATG4B-221ENST00000483778 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.47■■■□□ 2.31
ATG4B-221ENST00000483778 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.46■■■□□ 2.31
ATG4B-221ENST00000483778 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
ATG4B-221ENST00000483778 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.45■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.44■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.4■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 CLIP1P30622 1438 aa29.39■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 AFAP1Q8N556 730 aa29.39■■■□□ 2.3
ATG4B-221ENST00000483778 MLECQ14165 292 aa29.38■■■□□ 2.29
ATG4B-221ENST00000483778 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.35■■■□□ 2.29
ATG4B-221ENST00000483778 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.34■■■□□ 2.29
ATG4B-221ENST00000483778 ATP10AO60312 1499 aa29.33■■■□□ 2.29
ATG4B-221ENST00000483778 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.31■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 PREX2Q70Z35 1606 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.28■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.28■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.28■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 KDM5CP41229 1560 aa29.27■■■□□ 2.28
ATG4B-221ENST00000483778 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.26■■■□□ 2.27
ATG4B-221ENST00000483778 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.25■■■□□ 2.27
ATG4B-221ENST00000483778 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.22■■■□□ 2.27
ATG4B-221ENST00000483778 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.21■■■□□ 2.27
ATG4B-221ENST00000483778 ABCC1P33527 1531 aa29.21■■■□□ 2.27
ATG4B-221ENST00000483778 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.21■■■□□ 2.27
ATG4B-221ENST00000483778 HSPA2P54652 639 aa29.2■■■□□ 2.26
ATG4B-221ENST00000483778 ABCA6Q8N139 1617 aa29.19■■■□□ 2.26
ATG4B-221ENST00000483778 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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ATG4B-221ENST00000483778 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.16■■■□□ 2.26
ATG4B-221ENST00000483778 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
ATG4B-221ENST00000483778 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.14■■■□□ 2.26
ATG4B-221ENST00000483778 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.13■■■□□ 2.25
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ATG4B-221ENST00000483778 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.05■■■□□ 2.24
ATG4B-221ENST00000483778 CEP162Q5TB80 1403 aa29.05■■■□□ 2.24
ATG4B-221ENST00000483778 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.03■■■□□ 2.24
ATG4B-221ENST00000483778 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.02■■■□□ 2.24
ATG4B-221ENST00000483778 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ATG4B-221ENST00000483778 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.01■■■□□ 2.24
ATG4B-221ENST00000483778 AGLP35573 1532 aa29.01■■■□□ 2.23
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ATG4B-221ENST00000483778 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-221ENST00000483778 C3P01024 1663 aa28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-221ENST00000483778 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-221ENST00000483778 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ATG4B-221ENST00000483778 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
ATG4B-221ENST00000483778 TIAM1Q13009 1591 aa28.95■■■□□ 2.22
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ATG4B-221ENST00000483778 STRCQ7RTU9 1775 aa28.9■■■□□ 2.22
ATG4B-221ENST00000483778 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.89■■■□□ 2.22
ATG4B-221ENST00000483778 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ATG4B-221ENST00000483778 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.89■■■□□ 2.22
ATG4B-221ENST00000483778 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
ATG4B-221ENST00000483778 MBD5Q9P267 1494 aa28.85■■■□□ 2.21
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ATG4B-221ENST00000483778 NCOA2Q15596 1464 aa28.79■■■□□ 2.2
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ATG4B-221ENST00000483778 ZMYM3Q14202 1370 aa28.77■■■□□ 2.2
ATG4B-221ENST00000483778 MROH2AA6NES4 1674 aa28.77■■■□□ 2.2
ATG4B-221ENST00000483778 GGT6Q6P531 493 aa28.76■■■□□ 2.19
ATG4B-221ENST00000483778 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.76■■■□□ 2.19
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ATG4B-221ENST00000483778 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.72■■■□□ 2.19
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ATG4B-221ENST00000483778 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.67■■■□□ 2.18
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ATG4B-221ENST00000483778 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.65■■■□□ 2.18
ATG4B-221ENST00000483778 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.64■■■□□ 2.17
ATG4B-221ENST00000483778 PTPRKQ15262 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
ATG4B-221ENST00000483778 KIF3BO15066 747 aa28.6■■■□□ 2.17
ATG4B-221ENST00000483778 NCOA1Q15788 1441 aa28.6■■■□□ 2.17
ATG4B-221ENST00000483778 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.59■■■□□ 2.17
ATG4B-221ENST00000483778 PTPRTO14522 1441 aa28.59■■■□□ 2.17
ATG4B-221ENST00000483778 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.56■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.56■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 MAP3K1Q13233 1512 aa28.53■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ATG4B-221ENST00000483778 TSPY4P0CV99 314 aa28.51■■■□□ 2.15
ATG4B-221ENST00000483778 TSPY10P0CW01 314 aa28.51■■■□□ 2.15
ATG4B-221ENST00000483778 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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