RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 SCAPERQ9BY12 1400 aa29■■■□□ 2.23
PKN3-202ENST00000483521 PREX2Q70Z35 1606 aa28.99■■■□□ 2.23
PKN3-202ENST00000483521 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.99■■■□□ 2.23
PKN3-202ENST00000483521 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.97■■■□□ 2.23
PKN3-202ENST00000483521 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.97■■■□□ 2.23
PKN3-202ENST00000483521 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.95■■■□□ 2.23
PKN3-202ENST00000483521 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.94■■■□□ 2.22
PKN3-202ENST00000483521 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.94■■■□□ 2.22
PKN3-202ENST00000483521 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.93■■■□□ 2.22
PKN3-202ENST00000483521 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.91■■■□□ 2.22
PKN3-202ENST00000483521 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.91■■■□□ 2.22
PKN3-202ENST00000483521 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.88■■■□□ 2.21
PKN3-202ENST00000483521 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.88■■■□□ 2.21
PKN3-202ENST00000483521 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PKN3-202ENST00000483521 TIAM1Q13009 1591 aa28.87■■■□□ 2.21
PKN3-202ENST00000483521 ABCC1P33527 1531 aa28.84■■■□□ 2.21
PKN3-202ENST00000483521 KDM5CP41229 1560 aa28.82■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.8■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 MAP3K1Q13233 1512 aa28.79■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.78■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.78■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 AFAP1Q8N556 730 aa28.77■■■□□ 2.2
PKN3-202ENST00000483521 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.75■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.75■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.75■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.74■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 ATP10AO60312 1499 aa28.73■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 NCOA2Q15596 1464 aa28.73■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.73■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.73■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.72■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.72■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.72■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.71■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.71■■■□□ 2.19
PKN3-202ENST00000483521 APLP2Q06481 763 aa28.7■■■□□ 2.18
PKN3-202ENST00000483521 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.7■■■□□ 2.18
PKN3-202ENST00000483521 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.64■■■□□ 2.18
PKN3-202ENST00000483521 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
PKN3-202ENST00000483521 REREQ9P2R6 1566 aa28.62■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 ABCA6Q8N139 1617 aa28.61■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 MADDQ8WXG6 1647 aa28.6■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.6■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.59■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 PTPRMP28827 1452 aa28.58■■■□□ 2.17
PKN3-202ENST00000483521 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 ATP7AQ04656 1500 aa28.54■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.54■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 MBD5Q9P267 1494 aa28.54■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 MLECQ14165 292 aa28.53■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 AGLP35573 1532 aa28.52■■■□□ 2.16
PKN3-202ENST00000483521 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.51■■■□□ 2.15
PKN3-202ENST00000483521 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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PKN3-202ENST00000483521 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.5■■■□□ 2.15
PKN3-202ENST00000483521 MIA2Q96PC5 1412 aa28.49■■■□□ 2.15
PKN3-202ENST00000483521 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.48■■■□□ 2.15
PKN3-202ENST00000483521 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.46■■■□□ 2.15
PKN3-202ENST00000483521 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.45■■■□□ 2.14
PKN3-202ENST00000483521 A2MP01023 1474 aa28.41■■■□□ 2.14
PKN3-202ENST00000483521 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.4■■■□□ 2.14
PKN3-202ENST00000483521 PLXNC1O60486 1568 aa28.39■■■□□ 2.14
PKN3-202ENST00000483521 TSPY4P0CV99 314 aa28.38■■■□□ 2.13
PKN3-202ENST00000483521 TSPY10P0CW01 314 aa28.38■■■□□ 2.13
PKN3-202ENST00000483521 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PKN3-202ENST00000483521 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.32■■■□□ 2.12
PKN3-202ENST00000483521 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.31■■■□□ 2.12
PKN3-202ENST00000483521 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.3■■■□□ 2.12
PKN3-202ENST00000483521 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PKN3-202ENST00000483521 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.3■■■□□ 2.12
PKN3-202ENST00000483521 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.29■■■□□ 2.12
PKN3-202ENST00000483521 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.24■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.22■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.22■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 GGT6Q6P531 493 aa28.21■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 MROH2AA6NES4 1674 aa28.2■■■□□ 2.11
PKN3-202ENST00000483521 C3P01024 1663 aa28.19■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.17■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 ABCC5O15440 1437 aa28.17■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 DAPK1P53355 1430 aa28.17■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 KIF3BO15066 747 aa28.16■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.16■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.15■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PKN3-202ENST00000483521 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PKN3-202ENST00000483521 ZMYM3Q14202 1370 aa28.13■■■□□ 2.09
PKN3-202ENST00000483521 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.12■■■□□ 2.09
PKN3-202ENST00000483521 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.12■■■□□ 2.09
PKN3-202ENST00000483521 NPATQ14207 1427 aa28.11■■■□□ 2.09
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